RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000220676.1

RP1-201, Transcript of RP1, axonemal microtubule associated, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RP1, Length 7,100 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RP1-201ENST00000220676 B3GALNT1O75752 331 aa10□□□□□ -0.81
RP1-201ENST00000220676 UPK1BO75841 260 aa10□□□□□ -0.81
RP1-201ENST00000220676 SHC1P29353 583 aa10□□□□□ -0.81
RP1-201ENST00000220676 GIPRP48546 466 aa10□□□□□ -0.81
RP1-201ENST00000220676 FAM74A1Q5RGS3 127 aa10□□□□□ -0.81
RP1-201ENST00000220676 GLYATL3Q5SZD4 288 aa10□□□□□ -0.81
RP1-201ENST00000220676 C11orf42Q8N5U0 333 aa10□□□□□ -0.81
RP1-201ENST00000220676 KLHDC9Q8NEP7 349 aa10□□□□□ -0.81
RP1-201ENST00000220676 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
RP1-201ENST00000220676 TMEM106AQ96A25 262 aa10□□□□□ -0.81
RP1-201ENST00000220676 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa10□□□□□ -0.81
RP1-201ENST00000220676 A0A1W2PRD5 423 aa10□□□□□ -0.81
RP1-201ENST00000220676 A0A1W2PRF3 423 aa10□□□□□ -0.81
RP1-201ENST00000220676 A0A1W2PRM7 423 aa10□□□□□ -0.81
RP1-201ENST00000220676 THBS1P07996 1170 aa10□□□□□ -0.81
RP1-201ENST00000220676 ACP2P11117 423 aa10□□□□□ -0.81
RP1-201ENST00000220676 HSD17B1P14061 328 aa10□□□□□ -0.81
RP1-201ENST00000220676 CPEP16870 476 aa10□□□□□ -0.81
RP1-201ENST00000220676 ACSM1Q08AH1 577 aa10□□□□□ -0.81
RP1-201ENST00000220676 BTLAQ7Z6A9 289 aa10□□□□□ -0.81
RP1-201ENST00000220676 SLC38A5Q8WUX1 472 aa10□□□□□ -0.81
RP1-201ENST00000220676 ELP4Q96EB1 424 aa10□□□□□ -0.81
RP1-201ENST00000220676 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
RP1-201ENST00000220676 GPX3P22352 226 aa10□□□□□ -0.81
RP1-201ENST00000220676 CCSMST1Q4G0I0 132 aa10□□□□□ -0.81
RP1-201ENST00000220676 Q6ZRG5 221 aa10□□□□□ -0.81
RP1-201ENST00000220676 FNDC8Q8TC99 324 aa10□□□□□ -0.81
RP1-201ENST00000220676 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
RP1-201ENST00000220676 NECAP2Q9NVZ3 263 aa10□□□□□ -0.81
RP1-201ENST00000220676 CLEC1BQ9P126 229 aa10□□□□□ -0.81
RP1-201ENST00000220676 CHD4Q14839 1912 aa10□□□□□ -0.81
RP1-201ENST00000220676 MEIKINA0A087WXM9 373 aa10□□□□□ -0.81
RP1-201ENST00000220676 TMEM212A6NML5 194 aa10□□□□□ -0.81
RP1-201ENST00000220676 STMND1H3BQB6 276 aa10□□□□□ -0.81
RP1-201ENST00000220676 SULT1C2O00338 296 aa10□□□□□ -0.81
RP1-201ENST00000220676 GPR12P47775 334 aa10□□□□□ -0.81
RP1-201ENST00000220676 C15orf54Q8N8G6 183 aa10□□□□□ -0.81
RP1-201ENST00000220676 SLC35E1Q96K37 410 aa10□□□□□ -0.81
RP1-201ENST00000220676 SPACA5Q96QH8 159 aa10□□□□□ -0.81
RP1-201ENST00000220676 OR52A1Q9UKL2 312 aa10□□□□□ -0.81
RP1-201ENST00000220676 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
RP1-201ENST00000220676 F6UZH7 168 aa9.99□□□□□ -0.81
RP1-201ENST00000220676 MKRN2OSH3BPM6 223 aa9.99□□□□□ -0.81
RP1-201ENST00000220676 CCSO14618 274 aa9.99□□□□□ -0.81
RP1-201ENST00000220676 CDC14BO60729 498 aa9.99□□□□□ -0.81
RP1-201ENST00000220676 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
RP1-201ENST00000220676 CSF3P09919 207 aa9.99□□□□□ -0.81
RP1-201ENST00000220676 PIGAP37287 484 aa9.99□□□□□ -0.81
RP1-201ENST00000220676 TLE4Q04727 773 aa9.99□□□□□ -0.81
RP1-201ENST00000220676 PRR27Q6MZM9 219 aa9.99□□□□□ -0.81
RP1-201ENST00000220676 LYPD8Q6UX82 237 aa9.99□□□□□ -0.81
RP1-201ENST00000220676 GPR150Q8NGU9 434 aa9.99□□□□□ -0.81
RP1-201ENST00000220676 C7orf43Q8WVR3 580 aa9.99□□□□□ -0.81
RP1-201ENST00000220676 ST8SIA2Q92186 375 aa9.99□□□□□ -0.81
RP1-201ENST00000220676 CCDC74BQ96LY2 380 aa9.99□□□□□ -0.81
RP1-201ENST00000220676 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
RP1-201ENST00000220676 A0A1B0GWA3 101 aa9.99□□□□□ -0.81
RP1-201ENST00000220676 YKT6O15498 198 aa9.99□□□□□ -0.81
RP1-201ENST00000220676 TM4SF4P48230 202 aa9.99□□□□□ -0.81
RP1-201ENST00000220676 PMPCAQ10713 525 aa9.99□□□□□ -0.81
RP1-201ENST00000220676 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa9.99□□□□□ -0.81
RP1-201ENST00000220676 ZNF385BQ569K4 471 aa9.99□□□□□ -0.81
RP1-201ENST00000220676 TMEM207Q6UWW9 146 aa9.99□□□□□ -0.81
RP1-201ENST00000220676 USP51Q70EK9 711 aa9.99□□□□□ -0.81
RP1-201ENST00000220676 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa9.99□□□□□ -0.81
RP1-201ENST00000220676 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa9.99□□□□□ -0.81
RP1-201ENST00000220676 RDH5Q92781 318 aa9.99□□□□□ -0.81
RP1-201ENST00000220676 GHSRQ92847 366 aa9.99□□□□□ -0.81
RP1-201ENST00000220676 SLCO4A1Q96BD0 722 aa9.99□□□□□ -0.81
RP1-201ENST00000220676 POFUT1Q9H488 388 aa9.99□□□□□ -0.81
RP1-201ENST00000220676 PLA2G3Q9NZ20 509 aa9.99□□□□□ -0.81
RP1-201ENST00000220676 M0QZ24 198 aa9.99□□□□□ -0.81
RP1-201ENST00000220676 IMPA1P29218 277 aa9.99□□□□□ -0.81
RP1-201ENST00000220676 RAB15P59190 212 aa9.99□□□□□ -0.81
RP1-201ENST00000220676 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
RP1-201ENST00000220676 NAXDQ8IW45 347 aa9.99□□□□□ -0.81
RP1-201ENST00000220676 FAM109AQ8N4B1 249 aa9.99□□□□□ -0.81
RP1-201ENST00000220676 DEFB124Q8NES8 71 aa9.99□□□□□ -0.81
RP1-201ENST00000220676 PRR7Q8TB68 274 aa9.99□□□□□ -0.81
RP1-201ENST00000220676 NANPQ8TBE9 248 aa9.99□□□□□ -0.81
RP1-201ENST00000220676 AKR1E2Q96JD6 320 aa9.99□□□□□ -0.81
RP1-201ENST00000220676 SLC46A1Q96NT5 459 aa9.99□□□□□ -0.81
RP1-201ENST00000220676 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
RP1-201ENST00000220676 TAS2R5Q9NYW4 299 aa9.99□□□□□ -0.81
RP1-201ENST00000220676 MYH15Q9Y2K3 1946 aa9.99□□□□□ -0.81
RP1-201ENST00000220676 QDPRP09417 244 aa9.99□□□□□ -0.81
RP1-201ENST00000220676 GPLD1P80108 840 aa9.99□□□□□ -0.81
RP1-201ENST00000220676 PLXDC2Q6UX71 529 aa9.99□□□□□ -0.81
RP1-201ENST00000220676 ANGPTL5Q86XS5 388 aa9.99□□□□□ -0.81
RP1-201ENST00000220676 CNTN4Q8IWV2 1026 aa9.99□□□□□ -0.81
RP1-201ENST00000220676 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa9.99□□□□□ -0.81
RP1-201ENST00000220676 CLMPQ9H6B4 373 aa9.99□□□□□ -0.81
RP1-201ENST00000220676 PDLIM7Q9NR12 457 aa9.99□□□□□ -0.81
RP1-201ENST00000220676 IFT172Q9UG01 1749 aa9.99□□□□□ -0.81
RP1-201ENST00000220676 P2RX6O15547 441 aa9.99□□□□□ -0.81
RP1-201ENST00000220676 CACNG3O60359 315 aa9.99□□□□□ -0.81
RP1-201ENST00000220676 KEAP1Q14145 624 aa9.99□□□□□ -0.81
RP1-201ENST00000220676 PDZD11Q5EBL8 140 aa9.99□□□□□ -0.81
RP1-201ENST00000220676 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
RP1-201ENST00000220676 WDR5BQ86VZ2 330 aa9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.7 ms