RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000638481.1

SPIN3-208, Transcript of spindlin family member 3, human

TSL 5

Gene SPIN3, Length 2,050 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPIN3-208	ENST00000638481	SERPINA3	P01011	423 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	SBK2	P0C263	348 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	PNMT	P11086	282 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	ICAM2	P13598	275 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	ZNF3	P17036	446 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	STOM	P27105	288 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	SSR4	P51571	173 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	SLC16A1	P53985	500 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	MLF1	P58340	268 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	SNRPD2	P62316	118 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	PITPNA	Q00169	270 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	C17orf67	Q0P5P2	114 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	HSD17B12	Q53GQ0	312 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	SMUG1	Q53HV7	270 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	ZBTB37	Q5TC79	503 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	POMZP3	Q6PJE2	187 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	DTX1	Q86Y01	620 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	ARMC10	Q8N2F6	343 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	SLC43A2	Q8N370	569 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	ADAMTS17	Q8TE56	1095 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	C4orf36	Q96KX1	117 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	CITED4	Q96RK1	184 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	HCAR1	Q9BXC0	346 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	ADAM19	Q9H013	955 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	OR51V1	Q9H2C8	321 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	HAO2	Q9NYQ3	351 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	PTTG3P	Q9NZH4	202 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481		A0A0A6YYJ9	748 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481		A0A0G2JK05	382 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	SMLR1	H3BR10	107 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481		J3QLW9	94 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	CDC40	O60508	579 aa	Known RBP eCLIP	13.48	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	FZD7	O75084	574 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	PEPD	P12955	493 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	ZNF19	P17023	458 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	EGR4	Q05215	589 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	CHAF1B	Q13112	559 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	BCL2L15	Q5TBC7	163 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	PRAMEF20	Q5VT98	475 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	B3GNTL1	Q67FW5	361 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	BAIAP2L2	Q6UXY1	529 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	SMPDL3B	Q92485	455 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	PTP4A1	Q93096	173 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	SCMH1	Q96GD3	660 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	ENKD1	Q9H0I2	346 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	PPIL3	Q9H2H8	161 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	RANBP3	Q9H6Z4	567 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	ADGRL4	Q9HBW9	690 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	DLL3	Q9NYJ7	618 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	MED11	Q9P086	117 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	COPZ2	Q9P299	210 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	SLC23A1	Q9UHI7	598 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	ELF5	Q9UKW6	265 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	SIGLEC7	Q9Y286	467 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	WIF1	Q9Y5W5	379 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	TRAV1-2	A0A0B4J238	106 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	LINC00862	A6NCI5	91 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481		E9PI62	339 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	SC5D	O75845	299 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	IFNG	P01579	166 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	SERPINA7	P05543	415 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	MRPL3	P09001	348 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	RAB3B	P20337	219 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	SLC2A5	P22732	501 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	OR10A3	P58181	314 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	FHL1	Q13642	323 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	FCN2	Q15485	313 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	INPP5J	Q15735	1006 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	DMKN	Q6E0U4	476 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	OPN5	Q6U736	354 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	THSD4	Q6ZMP0	1018 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	TMPRSS7	Q7RTY8	843 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	OR51A7	Q8NH64	312 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	PHF21A	Q96BD5	680 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	OR2M2	Q96R28	347 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	CCNL2	Q96S94	520 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	C7orf50	Q9BRJ6	194 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	KLHL1	Q9NR64	748 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	TAS2R10	Q9NYW0	307 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	PPP4R1L	Q9P1A2	415 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	ABRACL	Q9P1F3	81 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	ZMIZ1	Q9ULJ6	1067 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	ANKUB1	A6NFN9	424 aa		13.46	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	TFPI	P10646	304 aa		13.46	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	GP1BB	P13224	206 aa		13.46	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	CD82	P27701	267 aa		13.46	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	BTC	P35070	178 aa		13.46	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	NHLH1	Q02575	133 aa		13.46	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	ZNF85	Q03923	595 aa		13.46	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	ACSM3	Q53FZ2	586 aa		13.46	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	FAM27D1	Q5T7N8	215 aa		13.46	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	ZNF468	Q5VIY5	522 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	CD276	Q5ZPR3	534 aa		13.46	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	FAM205BP	Q63HN1	556 aa		13.46	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	KRT74	Q7RTS7	529 aa		13.46	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	TMEM156	Q8N614	296 aa		13.46	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	SGTB	Q96EQ0	304 aa		13.46	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	NPAS1	Q99742	590 aa		13.46	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	SLC19A3	Q9BZV2	496 aa		13.46	□□□□□ -0.25
SPIN3-208	ENST00000638481	FAM117A	Q9C073	453 aa		13.46	□□□□□ -0.25

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