RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637053.1

VIM-210, Transcript of vimentin, humanhuman

TSL 2

Gene VIM, Length 508 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIM-210ENST00000637053 ACOT8O14734 319 aa2.65□□□□□ -1.99
VIM-210ENST00000637053 MSH4O15457 936 aa2.65□□□□□ -1.99
VIM-210ENST00000637053 TAPBPO15533 448 aa2.65□□□□□ -1.99
VIM-210ENST00000637053 SPRY2O43597 315 aa2.65□□□□□ -1.99
VIM-210ENST00000637053 MPZL2O60487 215 aa2.65□□□□□ -1.99
VIM-210ENST00000637053 PLIN3O60664 434 aa2.65□□□□□ -1.99
VIM-210ENST00000637053 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
VIM-210ENST00000637053 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
VIM-210ENST00000637053 GRAP2O75791 330 aa2.65□□□□□ -1.99
VIM-210ENST00000637053 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP2.65□□□□□ -1.99
VIM-210ENST00000637053 OR2J2O76002 312 aa2.65□□□□□ -1.99
VIM-210ENST00000637053 KRT33AO76009 404 aa2.65□□□□□ -1.99
VIM-210ENST00000637053 FGF19O95750 216 aa2.65□□□□□ -1.99
VIM-210ENST00000637053 EML2O95834 649 aa2.65□□□□□ -1.99
VIM-210ENST00000637053 CD160O95971 181 aa2.65□□□□□ -1.99
VIM-210ENST00000637053 HLA-DQA2P01906 255 aa2.65□□□□□ -1.99
VIM-210ENST00000637053 MBPP02686 304 aaPredicted RBP2.65□□□□□ -1.99
VIM-210ENST00000637053 MT-ND4P03905 459 aa2.65□□□□□ -1.99
VIM-210ENST00000637053 IGF1P05019 195 aa2.65□□□□□ -1.99
VIM-210ENST00000637053 PRKCGP05129 697 aa2.65□□□□□ -1.99
VIM-210ENST00000637053 HTR1AP08908 422 aa2.65□□□□□ -1.99
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VIM-210ENST00000637053 OR10J4P0C629 311 aa2.65□□□□□ -1.99
VIM-210ENST00000637053 PRSS56P0CW18 603 aa2.65□□□□□ -1.99
VIM-210ENST00000637053 SMIM18P0DKX4 95 aa2.65□□□□□ -1.99
VIM-210ENST00000637053 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
VIM-210ENST00000637053 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP2.65□□□□□ -1.99
VIM-210ENST00000637053 UGT2B7P16662 529 aa2.65□□□□□ -1.99
VIM-210ENST00000637053 CA4P22748 312 aa2.65□□□□□ -1.99
VIM-210ENST00000637053 AADACP22760 399 aa2.65□□□□□ -1.99
VIM-210ENST00000637053 HRH2P25021 359 aa2.65□□□□□ -1.99
VIM-210ENST00000637053 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
VIM-210ENST00000637053 CTGFP29279 349 aa2.65□□□□□ -1.99
VIM-210ENST00000637053 HTR1FP30939 366 aa2.65□□□□□ -1.99
VIM-210ENST00000637053 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
VIM-210ENST00000637053 AKR1C3P42330 323 aa2.65□□□□□ -1.99
VIM-210ENST00000637053 RPL35P42766 123 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
VIM-210ENST00000637053 NSG1P42857 185 aa2.65□□□□□ -1.99
VIM-210ENST00000637053 MAGEA5P43359 124 aa2.65□□□□□ -1.99
VIM-210ENST00000637053 KIR2DL3P43628 341 aa2.65□□□□□ -1.99
VIM-210ENST00000637053 RPS9P46781 194 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
VIM-210ENST00000637053 OR3A3P47888 321 aa2.65□□□□□ -1.99
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VIM-210ENST00000637053 RBP2P50120 134 aa2.65□□□□□ -1.99
VIM-210ENST00000637053 AKR1D1P51857 326 aa2.65□□□□□ -1.99
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VIM-210ENST00000637053 CRISP1P54107 249 aa2.65□□□□□ -1.99
VIM-210ENST00000637053 TPTEP56180 551 aa2.65□□□□□ -1.99
VIM-210ENST00000637053 TAS2R41P59536 307 aa2.65□□□□□ -1.99
VIM-210ENST00000637053 DNAJB13P59910 316 aa2.65□□□□□ -1.99
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VIM-210ENST00000637053 KLRB1Q12918 225 aa2.65□□□□□ -1.99
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VIM-210ENST00000637053 UBE2V1Q13404 147 aa2.65□□□□□ -1.99
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VIM-210ENST00000637053 VGLL4Q14135 290 aa2.65□□□□□ -1.99
VIM-210ENST00000637053 TFDP2Q14188 446 aa2.65□□□□□ -1.99
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VIM-210ENST00000637053 ZIC1Q15915 447 aa2.65□□□□□ -1.99
VIM-210ENST00000637053 ZNF77Q15935 545 aa2.65□□□□□ -1.99
VIM-210ENST00000637053 ATP6V1FQ16864 119 aa2.65□□□□□ -1.99
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VIM-210ENST00000637053 C14orf28Q4W4Y0 310 aa2.65□□□□□ -1.99
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VIM-210ENST00000637053 SPIN4Q56A73 249 aa2.65□□□□□ -1.99
VIM-210ENST00000637053 OR2B11Q5JQS5 317 aa2.65□□□□□ -1.99
VIM-210ENST00000637053 ACTL10Q5JWF8 245 aa2.65□□□□□ -1.99
VIM-210ENST00000637053 SIRPB2Q5JXA9 342 aa2.65□□□□□ -1.99
VIM-210ENST00000637053 LCE1EQ5T753 118 aa2.65□□□□□ -1.99
VIM-210ENST00000637053 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP2.65□□□□□ -1.99
VIM-210ENST00000637053 HECTD2Q5U5R9 776 aa2.65□□□□□ -1.99
VIM-210ENST00000637053 CES5AQ6NT32 575 aa2.65□□□□□ -1.99
VIM-210ENST00000637053 CASP12Q6UXS9 341 aa2.65□□□□□ -1.99
VIM-210ENST00000637053 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
VIM-210ENST00000637053 CREB3L2Q70SY1 520 aa2.65□□□□□ -1.99
VIM-210ENST00000637053 CYS1Q717R9 158 aa2.65□□□□□ -1.99
VIM-210ENST00000637053 LINGO2Q7L985 606 aa2.65□□□□□ -1.99
VIM-210ENST00000637053 ASCL5Q7RTU5 278 aa2.65□□□□□ -1.99
VIM-210ENST00000637053 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa2.65□□□□□ -1.99
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VIM-210ENST00000637053 GRPEL2Q8TAA5 225 aa2.65□□□□□ -1.99
VIM-210ENST00000637053 ACER1Q8TDN7 264 aa2.65□□□□□ -1.99
VIM-210ENST00000637053 ABHD3Q8WU67 409 aa2.65□□□□□ -1.99
VIM-210ENST00000637053 SDR42E1Q8WUS8 393 aa2.65□□□□□ -1.99
VIM-210ENST00000637053 SSMEM1Q8WWF3 244 aa2.65□□□□□ -1.99
VIM-210ENST00000637053 ATG4AQ8WYN0 398 aa2.65□□□□□ -1.99
VIM-210ENST00000637053 OR5P2Q8WZ92 322 aa2.65□□□□□ -1.99
VIM-210ENST00000637053 TESCQ96BS2 214 aa2.65□□□□□ -1.99
VIM-210ENST00000637053 UPRTQ96BW1 309 aa2.65□□□□□ -1.99
VIM-210ENST00000637053 NTNG2Q96CW9 530 aa2.65□□□□□ -1.99
VIM-210ENST00000637053 BPIFA2Q96DR5 249 aa2.65□□□□□ -1.99
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