RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636351.1

CLN3-247, Transcript of CLN3, battenin, humanhuman

TSL 5

Gene CLN3, Length 1,292 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3-247ENST00000636351 NOXO1Q8NFA2 376 aa15.61■□□□□ 0.09
CLN3-247ENST00000636351 OR10G2Q8NGC3 310 aa15.61■□□□□ 0.09
CLN3-247ENST00000636351 OR52N5Q8NH56 324 aa15.61■□□□□ 0.09
CLN3-247ENST00000636351 HSD17B8Q92506 261 aa15.61■□□□□ 0.09
CLN3-247ENST00000636351 SLCO4A1Q96BD0 722 aa15.61■□□□□ 0.09
CLN3-247ENST00000636351 LRR1Q96L50 414 aa15.61■□□□□ 0.09
CLN3-247ENST00000636351 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
CLN3-247ENST00000636351 GPA33Q99795 319 aa15.61■□□□□ 0.09
CLN3-247ENST00000636351 GLTPQ9NZD2 209 aa15.61■□□□□ 0.09
CLN3-247ENST00000636351 IL20RAQ9UHF4 553 aa15.61■□□□□ 0.09
CLN3-247ENST00000636351 SIGLEC7Q9Y286 467 aa15.61■□□□□ 0.09
CLN3-247ENST00000636351 A0A1W2PR80 420 aa15.6■□□□□ 0.09
CLN3-247ENST00000636351 NPIPB13A6NJU9 1138 aa15.6■□□□□ 0.09
CLN3-247ENST00000636351 OR5H1A6NKK0 313 aa15.6■□□□□ 0.09
CLN3-247ENST00000636351 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
CLN3-247ENST00000636351 NPIPB4C9JG80 1138 aa15.6■□□□□ 0.09
CLN3-247ENST00000636351 KLF4O43474 513 aa15.6■□□□□ 0.09
CLN3-247ENST00000636351 IGHMP01871 453 aa15.6■□□□□ 0.09
CLN3-247ENST00000636351 THBDP07204 575 aa15.6■□□□□ 0.09
CLN3-247ENST00000636351 PGA4P0DJD7 388 aa15.6■□□□□ 0.09
CLN3-247ENST00000636351 PGA3P0DJD8 388 aa15.6■□□□□ 0.09
CLN3-247ENST00000636351 ACVR1BP36896 505 aa15.6■□□□□ 0.09
CLN3-247ENST00000636351 RPL27P61353 136 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
CLN3-247ENST00000636351 ERVK-25P63136 954 aa15.6■□□□□ 0.09
CLN3-247ENST00000636351 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
CLN3-247ENST00000636351 CD47Q08722 323 aa15.6■□□□□ 0.09
CLN3-247ENST00000636351 TSPAN31Q12999 210 aa15.6■□□□□ 0.09
CLN3-247ENST00000636351 FHL1Q13642 323 aa15.6■□□□□ 0.09
CLN3-247ENST00000636351 GK3PQ14409 553 aa15.6■□□□□ 0.09
CLN3-247ENST00000636351 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
CLN3-247ENST00000636351 PPA1Q15181 289 aa15.6■□□□□ 0.09
CLN3-247ENST00000636351 GABRA6Q16445 453 aa15.6■□□□□ 0.09
CLN3-247ENST00000636351 MICAQ29983 383 aa15.6■□□□□ 0.09
CLN3-247ENST00000636351 TIMM23BQ5SRD1 257 aa15.6■□□□□ 0.09
CLN3-247ENST00000636351 PHYHD1Q5SRE7 291 aa15.6■□□□□ 0.09
CLN3-247ENST00000636351 FAM205BPQ63HN1 556 aa15.6■□□□□ 0.09
CLN3-247ENST00000636351 SMARCD3Q6STE5 483 aa15.6■□□□□ 0.09
CLN3-247ENST00000636351 P2RY8Q86VZ1 359 aa15.6■□□□□ 0.09
CLN3-247ENST00000636351 LRRC75AQ8NAA5 344 aa15.6■□□□□ 0.09
CLN3-247ENST00000636351 SYT14Q8NB59 555 aa15.6■□□□□ 0.09
CLN3-247ENST00000636351 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
CLN3-247ENST00000636351 OR1K1Q8NGR3 316 aa15.6■□□□□ 0.09
CLN3-247ENST00000636351 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
CLN3-247ENST00000636351 ZNF570Q96NI8 536 aa15.6■□□□□ 0.09
CLN3-247ENST00000636351 TSPAN32Q96QS1 320 aa15.6■□□□□ 0.09
CLN3-247ENST00000636351 DNAJB9Q9UBS3 223 aa15.6■□□□□ 0.09
CLN3-247ENST00000636351 POFUT2Q9Y2G5 429 aa15.6■□□□□ 0.09
CLN3-247ENST00000636351 FBN3Q75N90 2809 aa15.6■□□□□ 0.09
CLN3-247ENST00000636351 A6NIZ1 184 aa15.59■□□□□ 0.09
CLN3-247ENST00000636351 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
CLN3-247ENST00000636351 TRMUO75648 421 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
CLN3-247ENST00000636351 SEC14L2O76054 403 aa15.59■□□□□ 0.09
CLN3-247ENST00000636351 CD14P08571 375 aa15.59■□□□□ 0.09
CLN3-247ENST00000636351 ACADSP16219 412 aa15.59■□□□□ 0.09
CLN3-247ENST00000636351 GSSP48637 474 aa15.59■□□□□ 0.09
CLN3-247ENST00000636351 RAP1BP61224 184 aa15.59■□□□□ 0.09
CLN3-247ENST00000636351 RAP1AP62834 184 aa15.59■□□□□ 0.09
CLN3-247ENST00000636351 ARF1P84077 181 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
CLN3-247ENST00000636351 RUNX1T1Q06455 604 aa15.59■□□□□ 0.09
CLN3-247ENST00000636351 HIKESHIQ53FT3 197 aa15.59■□□□□ 0.09
CLN3-247ENST00000636351 ARMC4Q5T2S8 1044 aa15.59■□□□□ 0.09
CLN3-247ENST00000636351 C1orf94Q6P1W5 598 aa15.59■□□□□ 0.09
CLN3-247ENST00000636351 C17orf78Q8N4C9 275 aa15.59■□□□□ 0.09
CLN3-247ENST00000636351 GIPC3Q8TF64 312 aa15.59■□□□□ 0.09
CLN3-247ENST00000636351 TMEM54Q969K7 222 aa15.59■□□□□ 0.09
CLN3-247ENST00000636351 MDFIQ99750 246 aa15.59■□□□□ 0.09
CLN3-247ENST00000636351 OR52D1Q9H346 318 aa15.59■□□□□ 0.09
CLN3-247ENST00000636351 NGBQ9NPG2 151 aa15.59■□□□□ 0.09
CLN3-247ENST00000636351 GRHPRQ9UBQ7 328 aa15.59■□□□□ 0.09
CLN3-247ENST00000636351 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
CLN3-247ENST00000636351 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa15.59■□□□□ 0.09
CLN3-247ENST00000636351 AP4S1Q9Y587 144 aa15.59■□□□□ 0.09
CLN3-247ENST00000636351 PRR14LQ5THK1 2151 aa15.58■□□□□ 0.08
CLN3-247ENST00000636351 A0A096LPE4 126 aa15.58■□□□□ 0.08
CLN3-247ENST00000636351 A0A1W2PPZ6 126 aa15.58■□□□□ 0.08
CLN3-247ENST00000636351 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
CLN3-247ENST00000636351 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa15.58■□□□□ 0.08
CLN3-247ENST00000636351 XKRYO14609 159 aa15.58■□□□□ 0.08
CLN3-247ENST00000636351 NR2C1P13056 603 aa15.58■□□□□ 0.08
CLN3-247ENST00000636351 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
CLN3-247ENST00000636351 SLC6A6P31641 620 aa15.58■□□□□ 0.08
CLN3-247ENST00000636351 PTH2RP49190 550 aa15.58■□□□□ 0.08
CLN3-247ENST00000636351 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
CLN3-247ENST00000636351 MYBPC1Q00872 1141 aa15.58■□□□□ 0.08
CLN3-247ENST00000636351 BEX5Q5H9J7 111 aa15.58■□□□□ 0.08
CLN3-247ENST00000636351 ANKRD16Q6P6B7 361 aa15.58■□□□□ 0.08
CLN3-247ENST00000636351 THSD4Q6ZMP0 1018 aa15.58■□□□□ 0.08
CLN3-247ENST00000636351 ZNF620Q6ZNG0 422 aa15.58■□□□□ 0.08
CLN3-247ENST00000636351 OR52L1Q8NGH7 329 aa15.58■□□□□ 0.08
CLN3-247ENST00000636351 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
CLN3-247ENST00000636351 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
CLN3-247ENST00000636351 MUS81Q96NY9 551 aa15.58■□□□□ 0.08
CLN3-247ENST00000636351 GSX2Q9BZM3 304 aa15.58■□□□□ 0.08
CLN3-247ENST00000636351 SLC17A5Q9NRA2 495 aa15.58■□□□□ 0.08
CLN3-247ENST00000636351 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
CLN3-247ENST00000636351 AMDHD2Q9Y303 409 aa15.58■□□□□ 0.08
CLN3-247ENST00000636351 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa15.57■□□□□ 0.08
CLN3-247ENST00000636351 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
CLN3-247ENST00000636351 CENPBD1B2RD01 187 aa15.57■□□□□ 0.08
CLN3-247ENST00000636351 INAFM1C9JVW0 142 aa15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.2 ms