RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000622166.1

IGHV3-54-201, Transcript of immunoglobulin heavy variable 3-54 (pseudogene), humanhuman

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Gene IGHV3-54, Length 353 nt, Biotype IG V pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-54-201ENST00000622166 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa8.7□□□□□ -1.02
IGHV3-54-201ENST00000622166 CUTCQ9NTM9 273 aa8.7□□□□□ -1.02
IGHV3-54-201ENST00000622166 TAS2R8Q9NYW2 309 aa8.7□□□□□ -1.02
IGHV3-54-201ENST00000622166 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
IGHV3-54-201ENST00000622166 MGAT4CQ9UBM8 478 aa8.7□□□□□ -1.02
IGHV3-54-201ENST00000622166 KLK11Q9UBX7 282 aa8.7□□□□□ -1.02
IGHV3-54-201ENST00000622166 IKZF2Q9UKS7 526 aa8.7□□□□□ -1.02
IGHV3-54-201ENST00000622166 B9D1Q9UPM9 204 aa8.7□□□□□ -1.02
IGHV3-54-201ENST00000622166 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa8.7□□□□□ -1.02
IGHV3-54-201ENST00000622166 F5P12259 2224 aa8.7□□□□□ -1.02
IGHV3-54-201ENST00000622166 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa8.69□□□□□ -1.02
IGHV3-54-201ENST00000622166 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa8.69□□□□□ -1.02
IGHV3-54-201ENST00000622166 A0A1B0GTH9 108 aa8.69□□□□□ -1.02
IGHV3-54-201ENST00000622166 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa8.69□□□□□ -1.02
IGHV3-54-201ENST00000622166 OR6C65A6NJZ3 312 aa8.69□□□□□ -1.02
IGHV3-54-201ENST00000622166 A8MUA0 341 aa8.69□□□□□ -1.02
IGHV3-54-201ENST00000622166 H7C1C5 153 aa8.69□□□□□ -1.02
IGHV3-54-201ENST00000622166 SLC17A2O00624 439 aa8.69□□□□□ -1.02
IGHV3-54-201ENST00000622166 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
IGHV3-54-201ENST00000622166 RBBP9O75884 186 aa8.69□□□□□ -1.02
IGHV3-54-201ENST00000622166 DXOO77932 396 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
IGHV3-54-201ENST00000622166 CRYZL1O95825 349 aa8.69□□□□□ -1.02
IGHV3-54-201ENST00000622166 CSF1P09603 554 aa8.69□□□□□ -1.02
IGHV3-54-201ENST00000622166 PGCP20142 388 aa8.69□□□□□ -1.02
IGHV3-54-201ENST00000622166 CD27P26842 260 aa8.69□□□□□ -1.02
IGHV3-54-201ENST00000622166 CSF2RBP32927 897 aa8.69□□□□□ -1.02
IGHV3-54-201ENST00000622166 ZNF81P51508 661 aa8.69□□□□□ -1.02
IGHV3-54-201ENST00000622166 PNLIPRP2P54317 469 aa8.69□□□□□ -1.02
IGHV3-54-201ENST00000622166 GFERP55789 205 aa8.69□□□□□ -1.02
IGHV3-54-201ENST00000622166 ARPC4P59998 168 aa8.69□□□□□ -1.02
IGHV3-54-201ENST00000622166 RPL27P61353 136 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
IGHV3-54-201ENST00000622166 LCN6P62502 163 aa8.69□□□□□ -1.02
IGHV3-54-201ENST00000622166 PUDPQ08623 228 aa8.69□□□□□ -1.02
IGHV3-54-201ENST00000622166 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
IGHV3-54-201ENST00000622166 EBPQ15125 230 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
IGHV3-54-201ENST00000622166 WDR38Q5JTN6 314 aa8.69□□□□□ -1.02
IGHV3-54-201ENST00000622166 SIGIRRQ6IA17 410 aa8.69□□□□□ -1.02
IGHV3-54-201ENST00000622166 SYT13Q7L8C5 426 aa8.69□□□□□ -1.02
IGHV3-54-201ENST00000622166 DPY19L4Q7Z388 723 aa8.69□□□□□ -1.02
IGHV3-54-201ENST00000622166 HDDC2Q7Z4H3 204 aa8.69□□□□□ -1.02
IGHV3-54-201ENST00000622166 CCDC28AQ8IWP9 274 aa8.69□□□□□ -1.02
IGHV3-54-201ENST00000622166 PM20D2Q8IYS1 436 aa8.69□□□□□ -1.02
IGHV3-54-201ENST00000622166 SMRP1Q8NCR6 262 aa8.69□□□□□ -1.02
IGHV3-54-201ENST00000622166 OR2T35Q8NGX2 323 aa8.69□□□□□ -1.02
IGHV3-54-201ENST00000622166 OR10AC1Q8NH08 325 aa8.69□□□□□ -1.02
IGHV3-54-201ENST00000622166 STK35Q8TDR2 534 aa8.69□□□□□ -1.02
IGHV3-54-201ENST00000622166 LMX1AQ8TE12 382 aa8.69□□□□□ -1.02
IGHV3-54-201ENST00000622166 TSLPQ969D9 159 aa8.69□□□□□ -1.02
IGHV3-54-201ENST00000622166 ZDHHC12Q96GR4 267 aa8.69□□□□□ -1.02
IGHV3-54-201ENST00000622166 TGM7Q96PF1 710 aa8.69□□□□□ -1.02
IGHV3-54-201ENST00000622166 ADOQ96SZ5 270 aa8.69□□□□□ -1.02
IGHV3-54-201ENST00000622166 AMELYQ99218 206 aa8.69□□□□□ -1.02
IGHV3-54-201ENST00000622166 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
IGHV3-54-201ENST00000622166 PTDSS2Q9BVG9 487 aa8.69□□□□□ -1.02
IGHV3-54-201ENST00000622166 RTN4RQ9BZR6 473 aa8.69□□□□□ -1.02
IGHV3-54-201ENST00000622166 TXNIPQ9H3M7 391 aa8.69□□□□□ -1.02
IGHV3-54-201ENST00000622166 SOHLH2Q9NX45 425 aa8.69□□□□□ -1.02
IGHV3-54-201ENST00000622166 GLTPQ9NZD2 209 aa8.69□□□□□ -1.02
IGHV3-54-201ENST00000622166 UBQLN2Q9UHD9 624 aa8.69□□□□□ -1.02
IGHV3-54-201ENST00000622166 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa8.68□□□□□ -1.02
IGHV3-54-201ENST00000622166 PLSCR5A0PG75 271 aa8.68□□□□□ -1.02
IGHV3-54-201ENST00000622166 CIB4A0PJX0 185 aa8.68□□□□□ -1.02
IGHV3-54-201ENST00000622166 PRSS37A4D1T9 235 aa8.68□□□□□ -1.02
IGHV3-54-201ENST00000622166 GGT3PA6NGU5 568 aa8.68□□□□□ -1.02
IGHV3-54-201ENST00000622166 OR6C76A6NM76 312 aa8.68□□□□□ -1.02
IGHV3-54-201ENST00000622166 METTL12A8MUP2 240 aa8.68□□□□□ -1.02
IGHV3-54-201ENST00000622166 C2CD4DB7Z1M9 353 aa8.68□□□□□ -1.02
IGHV3-54-201ENST00000622166 SULT1C2O00338 296 aa8.68□□□□□ -1.02
IGHV3-54-201ENST00000622166 XKRYO14609 159 aa8.68□□□□□ -1.02
IGHV3-54-201ENST00000622166 FADS1O60427 444 aa8.68□□□□□ -1.02
IGHV3-54-201ENST00000622166 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
IGHV3-54-201ENST00000622166 ZNF217O75362 1048 aa8.68□□□□□ -1.02
IGHV3-54-201ENST00000622166 MAS1P04201 325 aa8.68□□□□□ -1.02
IGHV3-54-201ENST00000622166 ALDOBP05062 364 aa8.68□□□□□ -1.02
IGHV3-54-201ENST00000622166 MELTFP08582 738 aa8.68□□□□□ -1.02
IGHV3-54-201ENST00000622166 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
IGHV3-54-201ENST00000622166 FSTP19883 344 aa8.68□□□□□ -1.02
IGHV3-54-201ENST00000622166 M6PRP20645 277 aa8.68□□□□□ -1.02
IGHV3-54-201ENST00000622166 MAOBP27338 520 aa8.68□□□□□ -1.02
IGHV3-54-201ENST00000622166 CD38P28907 300 aa8.68□□□□□ -1.02
IGHV3-54-201ENST00000622166 IL12BP29460 328 aa8.68□□□□□ -1.02
IGHV3-54-201ENST00000622166 DCTDP32321 178 aa8.68□□□□□ -1.02
IGHV3-54-201ENST00000622166 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
IGHV3-54-201ENST00000622166 MAP2K6P52564 334 aa8.68□□□□□ -1.02
IGHV3-54-201ENST00000622166 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
IGHV3-54-201ENST00000622166 PLA2G7Q13093 441 aa8.68□□□□□ -1.02
IGHV3-54-201ENST00000622166 SNTA1Q13424 505 aa8.68□□□□□ -1.02
IGHV3-54-201ENST00000622166 OPCMLQ14982 345 aa8.68□□□□□ -1.02
IGHV3-54-201ENST00000622166 COL19A1Q14993 1142 aa8.68□□□□□ -1.02
IGHV3-54-201ENST00000622166 GRK1Q15835 563 aa8.68□□□□□ -1.02
IGHV3-54-201ENST00000622166 RAB11BQ15907 218 aa8.68□□□□□ -1.02
IGHV3-54-201ENST00000622166 CSRP2Q16527 193 aa8.68□□□□□ -1.02
IGHV3-54-201ENST00000622166 TEX30Q5JUR7 227 aa8.68□□□□□ -1.02
IGHV3-54-201ENST00000622166 FAM209AQ5JX71 171 aa8.68□□□□□ -1.02
IGHV3-54-201ENST00000622166 NKAIN2Q5VXU1 208 aa8.68□□□□□ -1.02
IGHV3-54-201ENST00000622166 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa8.68□□□□□ -1.02
IGHV3-54-201ENST00000622166 SLC25A25Q6KCM7 469 aa8.68□□□□□ -1.02
IGHV3-54-201ENST00000622166 SLC18B1Q6NT16 456 aa8.68□□□□□ -1.02
IGHV3-54-201ENST00000622166 FAM198BQ6UWH4 519 aa8.68□□□□□ -1.02
IGHV3-54-201ENST00000622166 C5orf46Q6UWT4 87 aa8.68□□□□□ -1.02
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