RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613246.4

PTPRJ-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRJ, Length 7,851 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-207ENST00000613246 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP17.24■□□□□ 0.35
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PTPRJ-207ENST00000613246 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP17.22■□□□□ 0.35
PTPRJ-207ENST00000613246 OR5K3A6NET4 321 aa17.22■□□□□ 0.35
PTPRJ-207ENST00000613246 ERVFC1-1P60608 527 aa17.22■□□□□ 0.35
PTPRJ-207ENST00000613246 CEBPEQ15744 281 aa17.22■□□□□ 0.35
PTPRJ-207ENST00000613246 BHLHE23Q8NDY6 225 aa17.22■□□□□ 0.35
PTPRJ-207ENST00000613246 H7C1C5 153 aa17.22■□□□□ 0.35
PTPRJ-207ENST00000613246 SLC25A6P12236 298 aa17.22■□□□□ 0.35
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