RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602516.1

HCG18-244, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

BASIC

Gene HCG18, Length 2,890 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-244ENST00000602516 IMPA1P29218 277 aa6.95□□□□□ -1.3
HCG18-244ENST00000602516 OR3A1P47881 315 aa6.95□□□□□ -1.3
HCG18-244ENST00000602516 WNT3P56703 355 aa6.95□□□□□ -1.3
HCG18-244ENST00000602516 UGT8Q16880 541 aa6.95□□□□□ -1.3
HCG18-244ENST00000602516 CCSMST1Q4G0I0 132 aa6.95□□□□□ -1.3
HCG18-244ENST00000602516 CCDC157Q569K6 752 aa6.95□□□□□ -1.3
HCG18-244ENST00000602516 SERPINA11Q86U17 422 aa6.95□□□□□ -1.3
HCG18-244ENST00000602516 CCDC190Q86UF4 302 aa6.95□□□□□ -1.3
HCG18-244ENST00000602516 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
HCG18-244ENST00000602516 FAM58AQ8N1B3 248 aa6.95□□□□□ -1.3
HCG18-244ENST00000602516 RNF175Q8N4F7 328 aa6.95□□□□□ -1.3
HCG18-244ENST00000602516 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
HCG18-244ENST00000602516 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa6.95□□□□□ -1.3
HCG18-244ENST00000602516 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
HCG18-244ENST00000602516 OR1L6Q8NGR2 347 aa6.95□□□□□ -1.3
HCG18-244ENST00000602516 NETO1Q8TDF5 533 aa6.95□□□□□ -1.3
HCG18-244ENST00000602516 OSTF1Q92882 214 aa6.95□□□□□ -1.3
HCG18-244ENST00000602516 BADQ92934 168 aa6.95□□□□□ -1.3
HCG18-244ENST00000602516 RSPRY1Q96DX4 576 aa6.95□□□□□ -1.3
HCG18-244ENST00000602516 FNDC11Q9BVV2 318 aa6.95□□□□□ -1.3
HCG18-244ENST00000602516 SLC28A3Q9HAS3 691 aa6.95□□□□□ -1.3
HCG18-244ENST00000602516 MSL2Q9HCI7 577 aa6.95□□□□□ -1.3
HCG18-244ENST00000602516 C14orf119Q9NWQ9 140 aa6.95□□□□□ -1.3
HCG18-244ENST00000602516 USE1Q9NZ43 259 aa6.95□□□□□ -1.3
HCG18-244ENST00000602516 FOXJ2Q9P0K8 574 aa6.95□□□□□ -1.3
HCG18-244ENST00000602516 IGLON5A6NGN9 336 aa6.95□□□□□ -1.3
HCG18-244ENST00000602516 MYL12BO14950 172 aa6.95□□□□□ -1.3
HCG18-244ENST00000602516 CLIC3O95833 236 aa6.95□□□□□ -1.3
HCG18-244ENST00000602516 B3GALT4O96024 378 aa6.95□□□□□ -1.3
HCG18-244ENST00000602516 F3P13726 295 aa6.95□□□□□ -1.3
HCG18-244ENST00000602516 MYL12AP19105 171 aa6.95□□□□□ -1.3
HCG18-244ENST00000602516 KIR3DL1P43629 444 aa6.95□□□□□ -1.3
HCG18-244ENST00000602516 LGALS7P47929 136 aa6.95□□□□□ -1.3
HCG18-244ENST00000602516 GP2P55259 537 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
HCG18-244ENST00000602516 MESP2Q0VG99 397 aa6.95□□□□□ -1.3
HCG18-244ENST00000602516 SLC10A1Q14973 349 aa6.95□□□□□ -1.3
HCG18-244ENST00000602516 SYTL3Q4VX76 610 aa6.95□□□□□ -1.3
HCG18-244ENST00000602516 XKR6Q5GH73 641 aa6.95□□□□□ -1.3
HCG18-244ENST00000602516 TCEAL5Q5H9L2 206 aa6.95□□□□□ -1.3
HCG18-244ENST00000602516 NKAIN2Q5VXU1 208 aa6.95□□□□□ -1.3
HCG18-244ENST00000602516 TMEM220Q6QAJ8 160 aa6.95□□□□□ -1.3
HCG18-244ENST00000602516 VN1R2Q8NFZ6 395 aa6.95□□□□□ -1.3
HCG18-244ENST00000602516 GPR151Q8TDV0 419 aa6.95□□□□□ -1.3
HCG18-244ENST00000602516 C11orf40Q8WZ69 217 aa6.95□□□□□ -1.3
HCG18-244ENST00000602516 FAM162AQ96A26 154 aa6.95□□□□□ -1.3
HCG18-244ENST00000602516 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
HCG18-244ENST00000602516 PHB2Q99623 299 aa6.95□□□□□ -1.3
HCG18-244ENST00000602516 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
HCG18-244ENST00000602516 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa6.94□□□□□ -1.3
HCG18-244ENST00000602516 C20orf202A1L168 122 aa6.94□□□□□ -1.3
HCG18-244ENST00000602516 RFXANKO14593 260 aa6.94□□□□□ -1.3
HCG18-244ENST00000602516 WIPF1O43516 503 aa6.94□□□□□ -1.3
HCG18-244ENST00000602516 SCGB2A1O75556 95 aa6.94□□□□□ -1.3
HCG18-244ENST00000602516 C1orf105O95561 183 aa6.94□□□□□ -1.3
HCG18-244ENST00000602516 SLC16A8O95907 504 aa6.94□□□□□ -1.3
HCG18-244ENST00000602516 CST1P01037 141 aa6.94□□□□□ -1.3
HCG18-244ENST00000602516 PRNPP04156 253 aa6.94□□□□□ -1.3
HCG18-244ENST00000602516 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
HCG18-244ENST00000602516 EPXP11678 715 aa6.94□□□□□ -1.3
HCG18-244ENST00000602516 GLB1P16278 677 aa6.94□□□□□ -1.3
HCG18-244ENST00000602516 ENGP17813 658 aa6.94□□□□□ -1.3
HCG18-244ENST00000602516 GPX2P18283 190 aa6.94□□□□□ -1.3
HCG18-244ENST00000602516 TBPP20226 339 aa6.94□□□□□ -1.3
HCG18-244ENST00000602516 ITGB7P26010 798 aa6.94□□□□□ -1.3
HCG18-244ENST00000602516 CALCRP30988 508 aa6.94□□□□□ -1.3
HCG18-244ENST00000602516 GRK5P34947 590 aa6.94□□□□□ -1.3
HCG18-244ENST00000602516 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
HCG18-244ENST00000602516 ST8SIA6P61647 398 aa6.94□□□□□ -1.3
HCG18-244ENST00000602516 RAE1P78406 368 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
HCG18-244ENST00000602516 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa6.94□□□□□ -1.3
HCG18-244ENST00000602516 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
HCG18-244ENST00000602516 OR4F3Q6IEY1 312 aa6.94□□□□□ -1.3
HCG18-244ENST00000602516 ZNF774Q6NX45 483 aa6.94□□□□□ -1.3
HCG18-244ENST00000602516 SPRED2Q7Z698 418 aa6.94□□□□□ -1.3
HCG18-244ENST00000602516 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
HCG18-244ENST00000602516 SERPINA12Q8IW75 414 aa6.94□□□□□ -1.3
HCG18-244ENST00000602516 AMER2Q8N7J2 671 aa6.94□□□□□ -1.3
HCG18-244ENST00000602516 EXD3Q8N9H8 876 aa6.94□□□□□ -1.3
HCG18-244ENST00000602516 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa6.94□□□□□ -1.3
HCG18-244ENST00000602516 OR51A7Q8NH64 312 aa6.94□□□□□ -1.3
HCG18-244ENST00000602516 OR5R1Q8NH85 324 aa6.94□□□□□ -1.3
HCG18-244ENST00000602516 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
HCG18-244ENST00000602516 WDR34Q96EX3 536 aa6.94□□□□□ -1.3
HCG18-244ENST00000602516 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
HCG18-244ENST00000602516 OR2V2Q96R30 315 aa6.94□□□□□ -1.3
HCG18-244ENST00000602516 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
HCG18-244ENST00000602516 ONECUT1Q9UBC0 465 aa6.94□□□□□ -1.3
HCG18-244ENST00000602516 PADI1Q9ULC6 663 aa6.94□□□□□ -1.3
HCG18-244ENST00000602516 KCNK6Q9Y257 313 aa6.94□□□□□ -1.3
HCG18-244ENST00000602516 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
HCG18-244ENST00000602516 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa6.94□□□□□ -1.3
HCG18-244ENST00000602516 C2orf16Q68DN1 1984 aa6.94□□□□□ -1.3
HCG18-244ENST00000602516 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa6.94□□□□□ -1.3
HCG18-244ENST00000602516 MGAT4DA6NG13 374 aa6.94□□□□□ -1.3
HCG18-244ENST00000602516 HEPACAM2A8MVW5 462 aa6.94□□□□□ -1.3
HCG18-244ENST00000602516 ANHXE9PGG2 379 aa6.94□□□□□ -1.3
HCG18-244ENST00000602516 GPR31O00270 319 aa6.94□□□□□ -1.3
HCG18-244ENST00000602516 IMPA2O14732 288 aa6.94□□□□□ -1.3
HCG18-244ENST00000602516 LRATO95237 230 aa6.94□□□□□ -1.3
HCG18-244ENST00000602516 SERPINA1P01009 418 aa6.94□□□□□ -1.3
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