RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589162.1

CAPNS1-208, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 701 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-208ENST00000589162 PRPS1P60891 318 aa5.33□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 ISL1P61371 349 aa5.33□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 TLE1Q04724 770 aa5.33□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 PMPCAQ10713 525 aa5.33□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 CDK5R2Q13319 367 aa5.33□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP5.33□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 MEP1BQ16820 701 aa5.33□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 KLHL12Q53G59 568 aa5.33□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 KRTCAP3Q53RY4 240 aa5.33□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 TSPO2Q5TGU0 170 aa5.33□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa5.33□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 AAED1Q7RTV5 226 aa5.33□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa5.33□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 FJX1Q86VR8 437 aa5.33□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 JAZF1Q86VZ6 243 aa5.33□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 LIX1LQ8IVB5 337 aa5.33□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 MCEMP1Q8IX19 187 aa5.33□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 TMEM123Q8N131 208 aa5.33□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF843Q8N446 348 aa5.33□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa5.33□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa5.33□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 NPEPL1Q8NDH3 523 aa5.33□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa5.33□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 OR2T33Q8NG76 320 aa5.33□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 TMEM163Q8TC26 289 aa5.33□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 PTP4A1Q93096 173 aa5.33□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP5.33□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 DTNBP1Q96EV8 351 aa5.33□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 PLEKHA8Q96JA3 519 aa5.33□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP5.33□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP5.33□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 OR2M2Q96R28 347 aa5.33□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP5.33□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 DDOQ99489 341 aa5.33□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP5.33□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 TXNIPQ9H3M7 391 aa5.33□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 EMC7Q9NPA0 242 aa5.33□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 TIGARQ9NQ88 270 aa5.33□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 ASB6Q9NWX5 421 aa5.33□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 IMPAD1Q9NX62 359 aa5.33□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 TAS2R16Q9NYV7 291 aa5.33□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 Q9UFV3 132 aa5.33□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 RAB26Q9ULW5 256 aa5.33□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 RASD1Q9Y272 281 aa5.33□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa5.33□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF835Q9Y2P0 537 aa5.33□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa5.33□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 DNAJC13O75165 2243 aa5.32□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa5.32□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 A0A1W2PPL8 197 aa5.32□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 A0A1W2PR80 420 aa5.32□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 SLC22A23A1A5C7 686 aa5.32□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 OR14I1A6ND48 311 aa5.32□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP5.32□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP5.32□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP5.32□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF726A6NNF4 738 aa5.32□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 RIIAD1A6NNX1 92 aa5.32□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 AHRRA9YTQ3 701 aa5.32□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 H0YAE9 185 aa5.32□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 H0YJX3 145 aa5.32□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 CCL21O00585 134 aa5.32□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP5.32□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 SLC16A7O60669 478 aa5.32□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP5.32□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 FAM20BO75063 409 aa5.32□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 TXNDC12O95881 172 aa5.32□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 QDPRP09417 244 aa5.32□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 PGA4P0DJD7 388 aa5.32□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 PGA3P0DJD8 388 aa5.32□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 MYF6P23409 242 aa5.32□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP5.32□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP5.32□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 CDH15P55291 814 aa5.32□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 CLRN1P58418 232 aa5.32□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 RPS7P62081 194 aaKnown RBP5.32□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 TUBA1BP68363 451 aa5.32□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 TUBA4AP68366 448 aa5.32□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 EFNB1P98172 346 aa5.32□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 MVKQ03426 396 aa5.32□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 APOFQ13790 326 aa5.32□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP5.32□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 KEAP1Q14145 624 aa5.32□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 MFSD13AQ14CX5 517 aa5.32□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 PDK3Q15120 406 aa5.32□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 CDSNQ15517 529 aa5.32□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 TMEM201Q5SNT2 666 aa5.32□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 TTC23Q5W5X9 447 aa5.32□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa5.32□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa5.32□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 LRFN4Q6PJG9 635 aa5.32□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 UGT2A3Q6UWM9 527 aa5.32□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa5.32□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 TUBA1AQ71U36 451 aa5.32□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 PXKQ7Z7A4 578 aa5.32□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP5.32□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 OR6V1Q8N148 313 aa5.32□□□□□ -1.56
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF786Q8N393 782 aa5.32□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.9 ms