RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 BGLAPP02818 100 aa22.91■■□□□ 1.26
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
CAPNS1-204ENST00000587718 NAGAP17050 411 aa22.91■■□□□ 1.26
CAPNS1-204ENST00000587718 NPR2P20594 1047 aa22.91■■□□□ 1.26
CAPNS1-204ENST00000587718 ABCD3P28288 659 aa22.91■■□□□ 1.26
CAPNS1-204ENST00000587718 THBS2P35442 1172 aa22.91■■□□□ 1.26
CAPNS1-204ENST00000587718 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
CAPNS1-204ENST00000587718 EFNA3P52797 238 aa22.91■■□□□ 1.26
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC26A5P58743 744 aa22.91■■□□□ 1.26
CAPNS1-204ENST00000587718 LTBQ06643 244 aa22.91■■□□□ 1.26
CAPNS1-204ENST00000587718 CBX3Q13185 183 aa22.91■■□□□ 1.26
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF684Q5T5D7 378 aa22.91■■□□□ 1.26
CAPNS1-204ENST00000587718 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
CAPNS1-204ENST00000587718 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa22.91■■□□□ 1.26
CAPNS1-204ENST00000587718 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
CAPNS1-204ENST00000587718 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa22.91■■□□□ 1.26
CAPNS1-204ENST00000587718 Q8N402 240 aa22.91■■□□□ 1.26
CAPNS1-204ENST00000587718 Q8NA96 180 aa22.91■■□□□ 1.26
CAPNS1-204ENST00000587718 NUBPLQ8TB37 319 aa22.91■■□□□ 1.26
CAPNS1-204ENST00000587718 CPT1CQ8TCG5 803 aa22.91■■□□□ 1.26
CAPNS1-204ENST00000587718 RASD2Q96D21 266 aa22.91■■□□□ 1.26
CAPNS1-204ENST00000587718 Q96M85 177 aa22.91■■□□□ 1.26
CAPNS1-204ENST00000587718 A0A0G2JK05 382 aa22.9■■□□□ 1.26
CAPNS1-204ENST00000587718 NOTOA8MTQ0 251 aa22.9■■□□□ 1.26
CAPNS1-204ENST00000587718 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
CAPNS1-204ENST00000587718 RENP00797 406 aa22.9■■□□□ 1.26
CAPNS1-204ENST00000587718 RAB3BP20337 219 aa22.9■■□□□ 1.26
CAPNS1-204ENST00000587718 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
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CAPNS1-204ENST00000587718 SCAIQ8N9R8 606 aa22.9■■□□□ 1.26
CAPNS1-204ENST00000587718 OR8K3Q8NH51 312 aa22.9■■□□□ 1.26
CAPNS1-204ENST00000587718 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa22.9■■□□□ 1.26
CAPNS1-204ENST00000587718 MOGAT1Q96PD6 335 aa22.9■■□□□ 1.26
CAPNS1-204ENST00000587718 KLHL1Q9NR64 748 aa22.9■■□□□ 1.26
CAPNS1-204ENST00000587718 P4HTMQ9NXG6 502 aa22.9■■□□□ 1.26
CAPNS1-204ENST00000587718 GRHPRQ9UBQ7 328 aa22.9■■□□□ 1.26
CAPNS1-204ENST00000587718 HEATR5AQ86XA9 2040 aa22.9■■□□□ 1.26
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF879B4DU55 563 aa22.89■■□□□ 1.26
CAPNS1-204ENST00000587718 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa22.89■■□□□ 1.26
CAPNS1-204ENST00000587718 ATXN8OSP0DMR3 200 aa22.89■■□□□ 1.26
CAPNS1-204ENST00000587718 TPTEP56180 551 aa22.89■■□□□ 1.26
CAPNS1-204ENST00000587718 SOX8P57073 446 aa22.89■■□□□ 1.26
CAPNS1-204ENST00000587718 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.26
CAPNS1-204ENST00000587718 INSL4Q14641 139 aa22.89■■□□□ 1.26
CAPNS1-204ENST00000587718 TP53I3Q53FA7 332 aa22.89■■□□□ 1.26
CAPNS1-204ENST00000587718 IDNKQ5T6J7 187 aa22.89■■□□□ 1.26
CAPNS1-204ENST00000587718 GRINAQ7Z429 371 aa22.89■■□□□ 1.26
CAPNS1-204ENST00000587718 MRI1Q9BV20 369 aa22.89■■□□□ 1.26
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC26A1Q9H2B4 701 aa22.89■■□□□ 1.26
CAPNS1-204ENST00000587718 MARCH7Q9H992 704 aa22.89■■□□□ 1.26
CAPNS1-204ENST00000587718 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.26
CAPNS1-204ENST00000587718 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.26
CAPNS1-204ENST00000587718 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa22.89■■□□□ 1.26
CAPNS1-204ENST00000587718 NPIPB7O75200 414 aa22.89■■□□□ 1.25
CAPNS1-204ENST00000587718 NCR1O76036 304 aa22.89■■□□□ 1.25
CAPNS1-204ENST00000587718 IL18Q14116 193 aa22.89■■□□□ 1.25
CAPNS1-204ENST00000587718 SGCBQ16585 318 aa22.89■■□□□ 1.25
CAPNS1-204ENST00000587718 YIF1BQ5BJH7 314 aa22.89■■□□□ 1.25
CAPNS1-204ENST00000587718 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa22.89■■□□□ 1.25
CAPNS1-204ENST00000587718 DUSP18Q8NEJ0 188 aa22.89■■□□□ 1.25
CAPNS1-204ENST00000587718 STT3BQ8TCJ2 826 aa22.89■■□□□ 1.25
CAPNS1-204ENST00000587718 TMEM234Q8WY98 164 aa22.89■■□□□ 1.25
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CAPNS1-204ENST00000587718 MASP2O00187 686 aa22.88■■□□□ 1.25
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC25A12O75746 678 aa22.88■■□□□ 1.25
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CAPNS1-204ENST00000587718 EVI2BP34910 448 aa22.88■■□□□ 1.25
CAPNS1-204ENST00000587718 ACVR1BP36896 505 aa22.88■■□□□ 1.25
CAPNS1-204ENST00000587718 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
CAPNS1-204ENST00000587718 NR4A2P43354 598 aa22.88■■□□□ 1.25
CAPNS1-204ENST00000587718 NR2C2APQ86WQ0 139 aa22.88■■□□□ 1.25
CAPNS1-204ENST00000587718 GALNT16Q8N428 558 aa22.88■■□□□ 1.25
CAPNS1-204ENST00000587718 GALNT11Q8NCW6 608 aa22.88■■□□□ 1.25
CAPNS1-204ENST00000587718 THRSPQ92748 146 aa22.88■■□□□ 1.25
CAPNS1-204ENST00000587718 TAAR8Q969N4 342 aa22.88■■□□□ 1.25
CAPNS1-204ENST00000587718 SPSB2Q99619 263 aa22.88■■□□□ 1.25
CAPNS1-204ENST00000587718 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
CAPNS1-204ENST00000587718 WDR54Q9H977 334 aa22.88■■□□□ 1.25
CAPNS1-204ENST00000587718 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa22.88■■□□□ 1.25
CAPNS1-204ENST00000587718 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa22.87■■□□□ 1.25
CAPNS1-204ENST00000587718 A8MVM7 634 aa22.87■■□□□ 1.25
CAPNS1-204ENST00000587718 FAM25AB3EWG3 89 aa22.87■■□□□ 1.25
CAPNS1-204ENST00000587718 FAM25CB3EWG5 89 aa22.87■■□□□ 1.25
CAPNS1-204ENST00000587718 FAM25GB3EWG6 89 aa22.87■■□□□ 1.25
CAPNS1-204ENST00000587718 PDCD5O14737 125 aa22.87■■□□□ 1.25
CAPNS1-204ENST00000587718 PLA2G10O15496 165 aa22.87■■□□□ 1.25
CAPNS1-204ENST00000587718 OR2T1O43869 369 aa22.87■■□□□ 1.25
CAPNS1-204ENST00000587718 IGHMP01871 453 aa22.87■■□□□ 1.25
CAPNS1-204ENST00000587718 EDNRAP25101 427 aa22.87■■□□□ 1.25
CAPNS1-204ENST00000587718 MAP2K3P46734 347 aa22.87■■□□□ 1.25
CAPNS1-204ENST00000587718 UQCRFS1P47985 274 aa22.87■■□□□ 1.25
CAPNS1-204ENST00000587718 RNF4P78317 190 aa22.87■■□□□ 1.25
CAPNS1-204ENST00000587718 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa22.87■■□□□ 1.25
CAPNS1-204ENST00000587718 PYHIN1Q6K0P9 492 aa22.87■■□□□ 1.25
CAPNS1-204ENST00000587718 MARCH3Q86UD3 253 aa22.87■■□□□ 1.25
CAPNS1-204ENST00000587718 TIGD4Q8IY51 512 aa22.87■■□□□ 1.25
CAPNS1-204ENST00000587718 PRR22Q8IZ63 422 aa22.87■■□□□ 1.25
CAPNS1-204ENST00000587718 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
CAPNS1-204ENST00000587718 OR6K6Q8NGW6 343 aa22.87■■□□□ 1.25
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