RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584243.5

GGA3-218, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 3

Gene GGA3, Length 646 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-218ENST00000584243 ZG16BQ96DA0 208 aa7.28□□□□□ -1.24
GGA3-218ENST00000584243 DPYSL5Q9BPU6 564 aa7.28□□□□□ -1.24
GGA3-218ENST00000584243 MACROD1Q9BQ69 325 aa7.28□□□□□ -1.24
GGA3-218ENST00000584243 OR10A5Q9H207 317 aa7.28□□□□□ -1.24
GGA3-218ENST00000584243 MIXL1Q9H2W2 232 aa7.28□□□□□ -1.24
GGA3-218ENST00000584243 RNF167Q9H6Y7 350 aa7.28□□□□□ -1.24
GGA3-218ENST00000584243 FKRPQ9H9S5 495 aa7.28□□□□□ -1.24
GGA3-218ENST00000584243 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
GGA3-218ENST00000584243 POLE4Q9NR33 117 aa7.28□□□□□ -1.24
GGA3-218ENST00000584243 CTPS2Q9NRF8 586 aa7.28□□□□□ -1.24
GGA3-218ENST00000584243 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
GGA3-218ENST00000584243 C14orf119Q9NWQ9 140 aa7.28□□□□□ -1.24
GGA3-218ENST00000584243 QPCTLQ9NXS2 382 aa7.28□□□□□ -1.24
GGA3-218ENST00000584243 COPS7AQ9UBW8 275 aa7.28□□□□□ -1.24
GGA3-218ENST00000584243 CARD8Q9Y2G2 431 aa7.28□□□□□ -1.24
GGA3-218ENST00000584243 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa7.28□□□□□ -1.24
GGA3-218ENST00000584243 A0A1B0GVI7 797 aa7.27□□□□□ -1.25
GGA3-218ENST00000584243 NPIPB13A6NJU9 1138 aa7.27□□□□□ -1.25
GGA3-218ENST00000584243 B4DXG7 233 aa7.27□□□□□ -1.25
GGA3-218ENST00000584243 NPIPB4C9JG80 1138 aa7.27□□□□□ -1.25
GGA3-218ENST00000584243 PEX12O00623 359 aa7.27□□□□□ -1.25
GGA3-218ENST00000584243 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
GGA3-218ENST00000584243 TO15178 435 aa7.27□□□□□ -1.25
GGA3-218ENST00000584243 ZNF264O43296 627 aa7.27□□□□□ -1.25
GGA3-218ENST00000584243 OR2T1O43869 369 aa7.27□□□□□ -1.25
GGA3-218ENST00000584243 LDB3O75112 727 aa7.27□□□□□ -1.25
GGA3-218ENST00000584243 CH25HO95992 272 aa7.27□□□□□ -1.25
GGA3-218ENST00000584243 RENP00797 406 aa7.27□□□□□ -1.25
GGA3-218ENST00000584243 CD14P08571 375 aa7.27□□□□□ -1.25
GGA3-218ENST00000584243 ADRA2AP08913 450 aa7.27□□□□□ -1.25
GGA3-218ENST00000584243 CALCBP10092 127 aa7.27□□□□□ -1.25
GGA3-218ENST00000584243 MAKP20794 623 aa7.27□□□□□ -1.25
GGA3-218ENST00000584243 S1PR1P21453 382 aa7.27□□□□□ -1.25
GGA3-218ENST00000584243 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
GGA3-218ENST00000584243 SLC6A1P30531 599 aa7.27□□□□□ -1.25
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GGA3-218ENST00000584243 RFX2P48378 723 aa7.27□□□□□ -1.25
GGA3-218ENST00000584243 ARL4DP49703 201 aa7.27□□□□□ -1.25
GGA3-218ENST00000584243 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
GGA3-218ENST00000584243 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
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GGA3-218ENST00000584243 MAB21L1Q13394 359 aa7.27□□□□□ -1.25
GGA3-218ENST00000584243 EFR3AQ14156 821 aa7.27□□□□□ -1.25
GGA3-218ENST00000584243 CRMP1Q14194 572 aa7.27□□□□□ -1.25
GGA3-218ENST00000584243 BAK1Q16611 211 aa7.27□□□□□ -1.25
GGA3-218ENST00000584243 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
GGA3-218ENST00000584243 DEFB113Q30KQ7 82 aa7.27□□□□□ -1.25
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GGA3-218ENST00000584243 UBE2NLQ5JXB2 153 aa7.27□□□□□ -1.25
GGA3-218ENST00000584243 SNAP47Q5SQN1 464 aa7.27□□□□□ -1.25
GGA3-218ENST00000584243 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa7.27□□□□□ -1.25
GGA3-218ENST00000584243 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
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GGA3-218ENST00000584243 FIGNL1Q6PIW4 674 aa7.27□□□□□ -1.25
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GGA3-218ENST00000584243 SLC16A9Q7RTY1 509 aa7.27□□□□□ -1.25
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GGA3-218ENST00000584243 LUZP2Q86TE4 346 aa7.27□□□□□ -1.25
GGA3-218ENST00000584243 FAM20CQ8IXL6 584 aa7.27□□□□□ -1.25
GGA3-218ENST00000584243 SLC35F2Q8IXU6 374 aa7.27□□□□□ -1.25
GGA3-218ENST00000584243 GPR135Q8IZ08 494 aa7.27□□□□□ -1.25
GGA3-218ENST00000584243 OR4D9Q8NGE8 314 aa7.27□□□□□ -1.25
GGA3-218ENST00000584243 OR13C2Q8NGS9 318 aa7.27□□□□□ -1.25
GGA3-218ENST00000584243 RPS4Y2Q8TD47 263 aa7.27□□□□□ -1.25
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GGA3-218ENST00000584243 NACC2Q96BF6 587 aa7.27□□□□□ -1.25
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GGA3-218ENST00000584243 RADILQ96JH8 1075 aa7.27□□□□□ -1.25
GGA3-218ENST00000584243 C4orf36Q96KX1 117 aa7.27□□□□□ -1.25
GGA3-218ENST00000584243 HYLS1Q96M11 299 aa7.27□□□□□ -1.25
GGA3-218ENST00000584243 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
GGA3-218ENST00000584243 HDHD5Q9BXW7 423 aa7.27□□□□□ -1.25
GGA3-218ENST00000584243 LAT2Q9GZY6 243 aa7.27□□□□□ -1.25
GGA3-218ENST00000584243 COMMD4Q9H0A8 199 aa7.27□□□□□ -1.25
GGA3-218ENST00000584243 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
GGA3-218ENST00000584243 DPAGT1Q9H3H5 408 aa7.27□□□□□ -1.25
GGA3-218ENST00000584243 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
GGA3-218ENST00000584243 TIGARQ9NQ88 270 aa7.27□□□□□ -1.25
GGA3-218ENST00000584243 TAS2R8Q9NYW2 309 aa7.27□□□□□ -1.25
GGA3-218ENST00000584243 SEMA5BQ9P283 1151 aa7.27□□□□□ -1.25
GGA3-218ENST00000584243 EXTL2Q9UBQ6 330 aa7.27□□□□□ -1.25
GGA3-218ENST00000584243 SPATA2Q9UM82 520 aa7.27□□□□□ -1.25
GGA3-218ENST00000584243 CAMK2AQ9UQM7 478 aa7.27□□□□□ -1.25
GGA3-218ENST00000584243 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
GGA3-218ENST00000584243 CMYA5Q8N3K9 4069 aa7.27□□□□□ -1.25
GGA3-218ENST00000584243 TMEM212A6NML5 194 aa7.26□□□□□ -1.25
GGA3-218ENST00000584243 AIPO00170 330 aa7.26□□□□□ -1.25
GGA3-218ENST00000584243 SOCS6O14544 535 aa7.26□□□□□ -1.25
GGA3-218ENST00000584243 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
GGA3-218ENST00000584243 PIP5K1CO60331 668 aa7.26□□□□□ -1.25
GGA3-218ENST00000584243 IFNA2P01563 188 aa7.26□□□□□ -1.25
GGA3-218ENST00000584243 C1QBP02746 253 aa7.26□□□□□ -1.25
GGA3-218ENST00000584243 PSKH1P11801 424 aa7.26□□□□□ -1.25
GGA3-218ENST00000584243 ST6GAL1P15907 406 aa7.26□□□□□ -1.25
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