RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583667.1

GGA3-217, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 4

Gene GGA3, Length 531 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-217ENST00000583667 P2RY4P51582 365 aa10.66□□□□□ -0.7
GGA3-217ENST00000583667 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
GGA3-217ENST00000583667 BLVRAP53004 296 aa10.66□□□□□ -0.7
GGA3-217ENST00000583667 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP10.66□□□□□ -0.7
GGA3-217ENST00000583667 ACTC1P68032 377 aa10.66□□□□□ -0.7
GGA3-217ENST00000583667 ACTA1P68133 377 aa10.66□□□□□ -0.7
GGA3-217ENST00000583667 SLC35A1P78382 337 aa10.66□□□□□ -0.7
GGA3-217ENST00000583667 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP10.66□□□□□ -0.7
GGA3-217ENST00000583667 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
GGA3-217ENST00000583667 TPBGQ13641 420 aa10.66□□□□□ -0.7
GGA3-217ENST00000583667 C1DQ13901 141 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
GGA3-217ENST00000583667 OR1C1Q15619 314 aa10.66□□□□□ -0.7
GGA3-217ENST00000583667 OR7A5Q15622 319 aa10.66□□□□□ -0.7
GGA3-217ENST00000583667 ACKR1Q16570 336 aa10.66□□□□□ -0.7
GGA3-217ENST00000583667 LINC01590Q5TEZ4 76 aa10.66□□□□□ -0.7
GGA3-217ENST00000583667 SPINK14Q6IE38 97 aa10.66□□□□□ -0.7
GGA3-217ENST00000583667 SLC25A25Q6KCM7 469 aa10.66□□□□□ -0.7
GGA3-217ENST00000583667 XKRXQ6PP77 449 aa10.66□□□□□ -0.7
GGA3-217ENST00000583667 RPTNQ6XPR3 784 aa10.66□□□□□ -0.7
GGA3-217ENST00000583667 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa10.66□□□□□ -0.7
GGA3-217ENST00000583667 Q71RC1 249 aaPredicted RBP10.66□□□□□ -0.7
GGA3-217ENST00000583667 ZBTB46Q86UZ6 589 aa10.66□□□□□ -0.7
GGA3-217ENST00000583667 OR2M7Q8NG81 312 aa10.66□□□□□ -0.7
GGA3-217ENST00000583667 OR2T4Q8NH00 348 aa10.66□□□□□ -0.7
GGA3-217ENST00000583667 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
GGA3-217ENST00000583667 NMNAT3Q96T66 252 aa10.66□□□□□ -0.7
GGA3-217ENST00000583667 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP10.66□□□□□ -0.7
GGA3-217ENST00000583667 SPOCK3Q9BQ16 436 aa10.66□□□□□ -0.7
GGA3-217ENST00000583667 MARCH7Q9H992 704 aa10.66□□□□□ -0.7
GGA3-217ENST00000583667 ERVK13-1Q9NX77 482 aa10.66□□□□□ -0.7
GGA3-217ENST00000583667 CLEC2DQ9UHP7 191 aa10.66□□□□□ -0.7
GGA3-217ENST00000583667 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP10.66□□□□□ -0.7
GGA3-217ENST00000583667 CSAG2Q9Y5P2 127 aa10.66□□□□□ -0.7
GGA3-217ENST00000583667 NOX1Q9Y5S8 564 aa10.66□□□□□ -0.7
GGA3-217ENST00000583667 FKBP7Q9Y680 259 aa10.66□□□□□ -0.7
GGA3-217ENST00000583667 ATRQ13535 2644 aa10.66□□□□□ -0.7
GGA3-217ENST00000583667 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa10.66□□□□□ -0.7
GGA3-217ENST00000583667 A0A1W2PRG6 482 aa10.65□□□□□ -0.7
GGA3-217ENST00000583667 CENPBD1B2RD01 187 aa10.65□□□□□ -0.7
GGA3-217ENST00000583667 H3BMQ9 156 aa10.65□□□□□ -0.7
GGA3-217ENST00000583667 CCL21O00585 134 aa10.65□□□□□ -0.7
GGA3-217ENST00000583667 RNF13O43567 381 aa10.65□□□□□ -0.7
GGA3-217ENST00000583667 NME2P1O60361 137 aa10.65□□□□□ -0.7
GGA3-217ENST00000583667 GLSO94925 669 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
GGA3-217ENST00000583667 RENP00797 406 aa10.65□□□□□ -0.7
GGA3-217ENST00000583667 SP1P08047 785 aa10.65□□□□□ -0.7
GGA3-217ENST00000583667 OR2T7P0C7T2 308 aa10.65□□□□□ -0.7
GGA3-217ENST00000583667 NME2P22392 152 aa10.65□□□□□ -0.7
GGA3-217ENST00000583667 PSMB9P28065 219 aa10.65□□□□□ -0.7
GGA3-217ENST00000583667 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
GGA3-217ENST00000583667 DAP3P51398 398 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
GGA3-217ENST00000583667 WNT4P56705 351 aa10.65□□□□□ -0.7
GGA3-217ENST00000583667 BDH1Q02338 343 aa10.65□□□□□ -0.7
GGA3-217ENST00000583667 HSF2Q03933 536 aa10.65□□□□□ -0.7
GGA3-217ENST00000583667 GPR50Q13585 617 aa10.65□□□□□ -0.7
GGA3-217ENST00000583667 POU4F3Q15319 338 aa10.65□□□□□ -0.7
GGA3-217ENST00000583667 CTF1Q16619 201 aa10.65□□□□□ -0.7
GGA3-217ENST00000583667 GXYLT1Q4G148 440 aa10.65□□□□□ -0.7
GGA3-217ENST00000583667 MESTQ5EB52 335 aa10.65□□□□□ -0.7
GGA3-217ENST00000583667 ARMCX4Q5H9R4 360 aa10.65□□□□□ -0.7
GGA3-217ENST00000583667 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa10.65□□□□□ -0.7
GGA3-217ENST00000583667 LEG1Q6P5S2 330 aa10.65□□□□□ -0.7
GGA3-217ENST00000583667 PAQR6Q6TCH4 344 aa10.65□□□□□ -0.7
GGA3-217ENST00000583667 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa10.65□□□□□ -0.7
GGA3-217ENST00000583667 P2RY8Q86VZ1 359 aa10.65□□□□□ -0.7
GGA3-217ENST00000583667 JAZF1Q86VZ6 243 aa10.65□□□□□ -0.7
GGA3-217ENST00000583667 CYB561A3Q8NBI2 242 aa10.65□□□□□ -0.7
GGA3-217ENST00000583667 SDR9C7Q8NEX9 313 aa10.65□□□□□ -0.7
GGA3-217ENST00000583667 OR4F15Q8NGB8 312 aa10.65□□□□□ -0.7
GGA3-217ENST00000583667 OR2T27Q8NH04 317 aa10.65□□□□□ -0.7
GGA3-217ENST00000583667 TM9SF4Q92544 642 aa10.65□□□□□ -0.7
GGA3-217ENST00000583667 RASD2Q96D21 266 aa10.65□□□□□ -0.7
GGA3-217ENST00000583667 SCMH1Q96GD3 660 aa10.65□□□□□ -0.7
GGA3-217ENST00000583667 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa10.65□□□□□ -0.7
GGA3-217ENST00000583667 OR5M11Q96RB7 305 aa10.65□□□□□ -0.7
GGA3-217ENST00000583667 MNTQ99583 582 aa10.65□□□□□ -0.7
GGA3-217ENST00000583667 FOXC2Q99958 501 aa10.65□□□□□ -0.7
GGA3-217ENST00000583667 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
GGA3-217ENST00000583667 OR51V1Q9H2C8 321 aa10.65□□□□□ -0.7
GGA3-217ENST00000583667 MED20Q9H944 212 aa10.65□□□□□ -0.7
GGA3-217ENST00000583667 ADGRL4Q9HBW9 690 aa10.65□□□□□ -0.7
GGA3-217ENST00000583667 KLHL1Q9NR64 748 aa10.65□□□□□ -0.7
GGA3-217ENST00000583667 ASB6Q9NWX5 421 aa10.65□□□□□ -0.7
GGA3-217ENST00000583667 ANKRD10Q9NXR5 420 aa10.65□□□□□ -0.7
GGA3-217ENST00000583667 KLHL13Q9P2N7 655 aa10.65□□□□□ -0.7
GGA3-217ENST00000583667 DKKL1Q9UK85 242 aa10.65□□□□□ -0.7
GGA3-217ENST00000583667 RASD1Q9Y272 281 aa10.65□□□□□ -0.7
GGA3-217ENST00000583667 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
GGA3-217ENST00000583667 A0A0G2JMM0 328 aa10.64□□□□□ -0.71
GGA3-217ENST00000583667 A0A1W2PPB8 328 aa10.64□□□□□ -0.71
GGA3-217ENST00000583667 A0A1W2PRS3 328 aa10.64□□□□□ -0.71
GGA3-217ENST00000583667 PRSS37A4D1T9 235 aa10.64□□□□□ -0.71
GGA3-217ENST00000583667 CCDC160A6NGH7 325 aa10.64□□□□□ -0.71
GGA3-217ENST00000583667 AQP7P3A6NL99 342 aa10.64□□□□□ -0.71
GGA3-217ENST00000583667 KIR3DP1A8MWS1 328 aa10.64□□□□□ -0.71
GGA3-217ENST00000583667 SHISA8B8ZZ34 492 aa10.64□□□□□ -0.71
GGA3-217ENST00000583667 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa10.64□□□□□ -0.71
GGA3-217ENST00000583667 CCRL2O00421 344 aa10.64□□□□□ -0.71
GGA3-217ENST00000583667 XKRYO14609 159 aa10.64□□□□□ -0.71
GGA3-217ENST00000583667 MYL12BO14950 172 aa10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.3 ms