RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578561.1

ERVFRD-3-201, Transcript of endogenous retrovirus group FRD member 3, humanhuman

BASIC

Gene ERVFRD-3, Length 1,617 nt, Biotype transcribed processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFRD-3-201ENST00000578561 RPS27P42677 84 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
ERVFRD-3-201ENST00000578561 EMP2P54851 167 aa4.75□□□□□ -1.65
ERVFRD-3-201ENST00000578561 SLC26A5P58743 744 aa4.75□□□□□ -1.65
ERVFRD-3-201ENST00000578561 RPL27P61353 136 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
ERVFRD-3-201ENST00000578561 DCDP81605 110 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
ERVFRD-3-201ENST00000578561 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
ERVFRD-3-201ENST00000578561 IL18Q14116 193 aa4.75□□□□□ -1.65
ERVFRD-3-201ENST00000578561 EFR3AQ14156 821 aa4.75□□□□□ -1.65
ERVFRD-3-201ENST00000578561 KCNJ8Q15842 424 aa4.75□□□□□ -1.65
ERVFRD-3-201ENST00000578561 ACKR1Q16570 336 aa4.75□□□□□ -1.65
ERVFRD-3-201ENST00000578561 COL28A1Q2UY09 1125 aa4.75□□□□□ -1.65
ERVFRD-3-201ENST00000578561 FAM69AQ5T7M9 428 aa4.75□□□□□ -1.65
ERVFRD-3-201ENST00000578561 STPG1Q5TH74 334 aa4.75□□□□□ -1.65
ERVFRD-3-201ENST00000578561 FAM69BQ5VUD6 431 aa4.75□□□□□ -1.65
ERVFRD-3-201ENST00000578561 C1orf140Q5VVS0 124 aa4.75□□□□□ -1.65
ERVFRD-3-201ENST00000578561 LIPNQ5VXI9 398 aa4.75□□□□□ -1.65
ERVFRD-3-201ENST00000578561 OTPQ5XKR4 325 aa4.75□□□□□ -1.65
ERVFRD-3-201ENST00000578561 SLC6A19Q695T7 634 aa4.75□□□□□ -1.65
ERVFRD-3-201ENST00000578561 BICRALQ6AI39 1079 aa4.75□□□□□ -1.65
ERVFRD-3-201ENST00000578561 OR5M10Q6IEU7 315 aa4.75□□□□□ -1.65
ERVFRD-3-201ENST00000578561 CDPF1Q6NVV7 123 aa4.75□□□□□ -1.65
ERVFRD-3-201ENST00000578561 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
ERVFRD-3-201ENST00000578561 NHLRC1Q6VVB1 395 aa4.75□□□□□ -1.65
ERVFRD-3-201ENST00000578561 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
ERVFRD-3-201ENST00000578561 GRINAQ7Z429 371 aa4.75□□□□□ -1.65
ERVFRD-3-201ENST00000578561 RAB43Q86YS6 212 aa4.75□□□□□ -1.65
ERVFRD-3-201ENST00000578561 EGFL6Q8IUX8 553 aa4.75□□□□□ -1.65
ERVFRD-3-201ENST00000578561 PM20D2Q8IYS1 436 aa4.75□□□□□ -1.65
ERVFRD-3-201ENST00000578561 EID2Q8N6I1 236 aa4.75□□□□□ -1.65
ERVFRD-3-201ENST00000578561 SAMD12Q8N8I0 201 aa4.75□□□□□ -1.65
ERVFRD-3-201ENST00000578561 SCAIQ8N9R8 606 aa4.75□□□□□ -1.65
ERVFRD-3-201ENST00000578561 OR6S1Q8NH40 331 aa4.75□□□□□ -1.65
ERVFRD-3-201ENST00000578561 NUBPLQ8TB37 319 aa4.75□□□□□ -1.65
ERVFRD-3-201ENST00000578561 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
ERVFRD-3-201ENST00000578561 STK35Q8TDR2 534 aa4.75□□□□□ -1.65
ERVFRD-3-201ENST00000578561 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
ERVFRD-3-201ENST00000578561 PHYHIPQ92561 330 aa4.75□□□□□ -1.65
ERVFRD-3-201ENST00000578561 PIGKQ92643 395 aa4.75□□□□□ -1.65
ERVFRD-3-201ENST00000578561 C8orf44Q96CB5 159 aa4.75□□□□□ -1.65
ERVFRD-3-201ENST00000578561 SLC25A36Q96CQ1 311 aa4.75□□□□□ -1.65
ERVFRD-3-201ENST00000578561 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
ERVFRD-3-201ENST00000578561 SNX18Q96RF0 628 aa4.75□□□□□ -1.65
ERVFRD-3-201ENST00000578561 SYT4Q9H2B2 425 aa4.75□□□□□ -1.65
ERVFRD-3-201ENST00000578561 SLC26A1Q9H2B4 701 aa4.75□□□□□ -1.65
ERVFRD-3-201ENST00000578561 GALNT9Q9HCQ5 603 aa4.75□□□□□ -1.65
ERVFRD-3-201ENST00000578561 NOX4Q9NPH5 578 aa4.75□□□□□ -1.65
ERVFRD-3-201ENST00000578561 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
ERVFRD-3-201ENST00000578561 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
ERVFRD-3-201ENST00000578561 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
ERVFRD-3-201ENST00000578561 GRHPRQ9UBQ7 328 aa4.75□□□□□ -1.65
ERVFRD-3-201ENST00000578561 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
ERVFRD-3-201ENST00000578561 ADAM30Q9UKF2 790 aa4.75□□□□□ -1.65
ERVFRD-3-201ENST00000578561 POU2F3Q9UKI9 436 aa4.75□□□□□ -1.65
ERVFRD-3-201ENST00000578561 RARRES3Q9UL19 164 aa4.75□□□□□ -1.65
ERVFRD-3-201ENST00000578561 B9D1Q9UPM9 204 aa4.75□□□□□ -1.65
ERVFRD-3-201ENST00000578561 ZNF281Q9Y2X9 895 aa4.75□□□□□ -1.65
ERVFRD-3-201ENST00000578561 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
ERVFRD-3-201ENST00000578561 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
ERVFRD-3-201ENST00000578561 FKBP7Q9Y680 259 aa4.75□□□□□ -1.65
ERVFRD-3-201ENST00000578561 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
ERVFRD-3-201ENST00000578561 MYO15AQ9UKN7 3530 aa4.75□□□□□ -1.65
ERVFRD-3-201ENST00000578561 UNC13CQ8NB66 2214 aa4.75□□□□□ -1.65
ERVFRD-3-201ENST00000578561 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa4.75□□□□□ -1.65
ERVFRD-3-201ENST00000578561 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa4.75□□□□□ -1.65
ERVFRD-3-201ENST00000578561 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa4.75□□□□□ -1.65
ERVFRD-3-201ENST00000578561 PRSS37A4D1T9 235 aa4.75□□□□□ -1.65
ERVFRD-3-201ENST00000578561 TMEM221A6NGB7 291 aa4.75□□□□□ -1.65
ERVFRD-3-201ENST00000578561 HMX3A6NHT5 357 aa4.75□□□□□ -1.65
ERVFRD-3-201ENST00000578561 FAM25AB3EWG3 89 aa4.75□□□□□ -1.65
ERVFRD-3-201ENST00000578561 FAM25CB3EWG5 89 aa4.75□□□□□ -1.65
ERVFRD-3-201ENST00000578561 FAM25GB3EWG6 89 aa4.75□□□□□ -1.65
ERVFRD-3-201ENST00000578561 ZNF879B4DU55 563 aa4.75□□□□□ -1.65
ERVFRD-3-201ENST00000578561 C11orf98E9PRG8 122 aa4.75□□□□□ -1.65
ERVFRD-3-201ENST00000578561 MS4A18H0YCH9 400 aa4.75□□□□□ -1.65
ERVFRD-3-201ENST00000578561 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
ERVFRD-3-201ENST00000578561 TFECO14948 347 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
ERVFRD-3-201ENST00000578561 FLRT2O43155 660 aa4.75□□□□□ -1.65
ERVFRD-3-201ENST00000578561 ARHGEF9O43307 516 aa4.75□□□□□ -1.65
ERVFRD-3-201ENST00000578561 LYRM1O43325 122 aa4.75□□□□□ -1.65
ERVFRD-3-201ENST00000578561 FZD7O75084 574 aa4.75□□□□□ -1.65
ERVFRD-3-201ENST00000578561 ARL6IP5O75915 188 aa4.75□□□□□ -1.65
ERVFRD-3-201ENST00000578561 RPP14O95059 124 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
ERVFRD-3-201ENST00000578561 NUDT14O95848 222 aa4.75□□□□□ -1.65
ERVFRD-3-201ENST00000578561 PLGP00747 810 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
ERVFRD-3-201ENST00000578561 RENP00797 406 aa4.75□□□□□ -1.65
ERVFRD-3-201ENST00000578561 HIST1H2ABP04908 130 aa4.75□□□□□ -1.65
ERVFRD-3-201ENST00000578561 ADRB1P08588 477 aa4.75□□□□□ -1.65
ERVFRD-3-201ENST00000578561 FGF5P12034 268 aa4.75□□□□□ -1.65
ERVFRD-3-201ENST00000578561 HLA-DOBP13765 273 aa4.75□□□□□ -1.65
ERVFRD-3-201ENST00000578561 ZNF28P17035 718 aa4.75□□□□□ -1.65
ERVFRD-3-201ENST00000578561 NAGAP17050 411 aa4.75□□□□□ -1.65
ERVFRD-3-201ENST00000578561 ADRA2CP18825 462 aa4.75□□□□□ -1.65
ERVFRD-3-201ENST00000578561 SRMP19623 302 aa4.75□□□□□ -1.65
ERVFRD-3-201ENST00000578561 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
ERVFRD-3-201ENST00000578561 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
ERVFRD-3-201ENST00000578561 BTCP35070 178 aa4.75□□□□□ -1.65
ERVFRD-3-201ENST00000578561 PTGS2P35354 604 aa4.75□□□□□ -1.65
ERVFRD-3-201ENST00000578561 KIR3DL2P43630 455 aa4.75□□□□□ -1.65
ERVFRD-3-201ENST00000578561 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
ERVFRD-3-201ENST00000578561 CLDN20P56880 219 aa4.75□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 86.1 ms