RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566180.5

RNPS1-218, Transcript of RNA binding protein with serine rich domain 1, humanhuman

TSL 5

Gene RNPS1, Length 814 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNPS1-218ENST00000566180 DNM1P46Q6ZS02 220 aa18.52■□□□□ 0.56
RNPS1-218ENST00000566180 SKA3Q8IX90 412 aa18.52■□□□□ 0.56
RNPS1-218ENST00000566180 CDK20Q8IZL9 346 aa18.52■□□□□ 0.56
RNPS1-218ENST00000566180 SLC22A24Q8N4F4 322 aa18.52■□□□□ 0.56
RNPS1-218ENST00000566180 FITM2Q8N6M3 262 aa18.52■□□□□ 0.56
RNPS1-218ENST00000566180 FAM86B1Q8N7N1 296 aa18.52■□□□□ 0.56
RNPS1-218ENST00000566180 NUP37Q8NFH4 326 aa18.52■□□□□ 0.56
RNPS1-218ENST00000566180 MCHR2Q969V1 340 aa18.52■□□□□ 0.56
RNPS1-218ENST00000566180 ZNF347Q96SE7 839 aa18.52■□□□□ 0.56
RNPS1-218ENST00000566180 TXNIPQ9H3M7 391 aa18.52■□□□□ 0.56
RNPS1-218ENST00000566180 TMEM38BQ9NVV0 291 aa18.52■□□□□ 0.56
RNPS1-218ENST00000566180 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa18.52■□□□□ 0.56
RNPS1-218ENST00000566180 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP18.52■□□□□ 0.56
RNPS1-218ENST00000566180 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP18.52■□□□□ 0.55
RNPS1-218ENST00000566180 ARID1AO14497 2285 aa18.51■□□□□ 0.55
RNPS1-218ENST00000566180 A0A1W2PRQ8 180 aa18.51■□□□□ 0.55
RNPS1-218ENST00000566180 FAM171A2A8MVW0 826 aa18.51■□□□□ 0.55
RNPS1-218ENST00000566180 EFCAB9A8MZ26 197 aa18.51■□□□□ 0.55
RNPS1-218ENST00000566180 ENTPD5O75356 428 aa18.51■□□□□ 0.55
RNPS1-218ENST00000566180 UBL3O95164 117 aa18.51■□□□□ 0.55
RNPS1-218ENST00000566180 FAM107AO95990 144 aa18.51■□□□□ 0.55
RNPS1-218ENST00000566180 OR8G3PP0DMU2 310 aa18.51■□□□□ 0.55
RNPS1-218ENST00000566180 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
RNPS1-218ENST00000566180 RHCEP18577 417 aa18.51■□□□□ 0.55
RNPS1-218ENST00000566180 SERPINF1P36955 418 aa18.51■□□□□ 0.55
RNPS1-218ENST00000566180 MNAT1P51948 309 aa18.51■□□□□ 0.55
RNPS1-218ENST00000566180 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
RNPS1-218ENST00000566180 RAB1AP62820 205 aa18.51■□□□□ 0.55
RNPS1-218ENST00000566180 FHL1Q13642 323 aa18.51■□□□□ 0.55
RNPS1-218ENST00000566180 DGCR6Q14129 220 aa18.51■□□□□ 0.55
RNPS1-218ENST00000566180 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
RNPS1-218ENST00000566180 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa18.51■□□□□ 0.55
RNPS1-218ENST00000566180 OAFQ86UD1 273 aa18.51■□□□□ 0.55
RNPS1-218ENST00000566180 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
RNPS1-218ENST00000566180 LRRC75AQ8NAA5 344 aa18.51■□□□□ 0.55
RNPS1-218ENST00000566180 SYT14Q8NB59 555 aa18.51■□□□□ 0.55
RNPS1-218ENST00000566180 OR51A7Q8NH64 312 aa18.51■□□□□ 0.55
RNPS1-218ENST00000566180 SLC7A13Q8TCU3 470 aa18.51■□□□□ 0.55
RNPS1-218ENST00000566180 PYURFQ96I23 114 aa18.51■□□□□ 0.55
RNPS1-218ENST00000566180 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa18.51■□□□□ 0.55
RNPS1-218ENST00000566180 VPS13CQ709C8 3753 aa18.5■□□□□ 0.55
RNPS1-218ENST00000566180 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
RNPS1-218ENST00000566180 PDE5AO76074 875 aa18.5■□□□□ 0.55
RNPS1-218ENST00000566180 H1F0P07305 194 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
RNPS1-218ENST00000566180 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
RNPS1-218ENST00000566180 GIPRP48546 466 aa18.5■□□□□ 0.55
RNPS1-218ENST00000566180 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
RNPS1-218ENST00000566180 SLC9A3P48764 834 aa18.5■□□□□ 0.55
RNPS1-218ENST00000566180 VLDLRP98155 873 aa18.5■□□□□ 0.55
RNPS1-218ENST00000566180 MYBPC1Q00872 1141 aa18.5■□□□□ 0.55
RNPS1-218ENST00000566180 RAB35Q15286 201 aa18.5■□□□□ 0.55
RNPS1-218ENST00000566180 ADIPOQQ15848 244 aa18.5■□□□□ 0.55
RNPS1-218ENST00000566180 SPATS1Q496A3 300 aa18.5■□□□□ 0.55
RNPS1-218ENST00000566180 NRN1LQ496H8 165 aa18.5■□□□□ 0.55
RNPS1-218ENST00000566180 IQCCQ4KMZ1 466 aa18.5■□□□□ 0.55
RNPS1-218ENST00000566180 CLEC9AQ6UXN8 241 aa18.5■□□□□ 0.55
RNPS1-218ENST00000566180 RRM2BQ7LG56 351 aa18.5■□□□□ 0.55
RNPS1-218ENST00000566180 DEFB107AQ8IZN7 70 aa18.5■□□□□ 0.55
RNPS1-218ENST00000566180 FGFBP3Q8TAT2 258 aa18.5■□□□□ 0.55
RNPS1-218ENST00000566180 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
RNPS1-218ENST00000566180 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
RNPS1-218ENST00000566180 FBXO17Q96EF6 278 aa18.5■□□□□ 0.55
RNPS1-218ENST00000566180 MS4A3Q96HJ5 214 aa18.5■□□□□ 0.55
RNPS1-218ENST00000566180 ZNF442Q9H7R0 627 aa18.5■□□□□ 0.55
RNPS1-218ENST00000566180 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
RNPS1-218ENST00000566180 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa18.5■□□□□ 0.55
RNPS1-218ENST00000566180 ACANP16112 2415 aa18.5■□□□□ 0.55
RNPS1-218ENST00000566180 TRAV27A0A087WT01 109 aa18.49■□□□□ 0.55
RNPS1-218ENST00000566180 CDC42EP2O14613 210 aa18.49■□□□□ 0.55
RNPS1-218ENST00000566180 FARS2O95363 451 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
RNPS1-218ENST00000566180 RAB36O95755 333 aa18.49■□□□□ 0.55
RNPS1-218ENST00000566180 IGHMP01871 453 aa18.49■□□□□ 0.55
RNPS1-218ENST00000566180 OR4A8P0C604 315 aa18.49■□□□□ 0.55
RNPS1-218ENST00000566180 ZNF84P51523 738 aa18.49■□□□□ 0.55
RNPS1-218ENST00000566180 CTXN1P60606 82 aa18.49■□□□□ 0.55
RNPS1-218ENST00000566180 RPL27P61353 136 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
RNPS1-218ENST00000566180 MXRA7P84157 204 aa18.49■□□□□ 0.55
RNPS1-218ENST00000566180 C10orf128Q5T292 105 aa18.49■□□□□ 0.55
RNPS1-218ENST00000566180 PODNL1Q6PEZ8 512 aa18.49■□□□□ 0.55
RNPS1-218ENST00000566180 VHLLQ6RSH7 139 aa18.49■□□□□ 0.55
RNPS1-218ENST00000566180 OR13C2Q8NGS9 318 aa18.49■□□□□ 0.55
RNPS1-218ENST00000566180 KCNK17Q96T54 332 aa18.49■□□□□ 0.55
RNPS1-218ENST00000566180 SMURF2Q9HAU4 748 aa18.49■□□□□ 0.55
RNPS1-218ENST00000566180 FBXL3Q9UKT7 428 aa18.49■□□□□ 0.55
RNPS1-218ENST00000566180 MTORP42345 2549 aa18.49■□□□□ 0.55
RNPS1-218ENST00000566180 B9A039 149 aa18.48■□□□□ 0.55
RNPS1-218ENST00000566180 hCG_2039718K7EN88 272 aa18.48■□□□□ 0.55
RNPS1-218ENST00000566180 ARPC2O15144 300 aa18.48■□□□□ 0.55
RNPS1-218ENST00000566180 SSX4O60224 188 aa18.48■□□□□ 0.55
RNPS1-218ENST00000566180 SEMG1P04279 462 aa18.48■□□□□ 0.55
RNPS1-218ENST00000566180 PATE4P0C8F1 98 aa18.48■□□□□ 0.55
RNPS1-218ENST00000566180 ITGA2P17301 1181 aa18.48■□□□□ 0.55
RNPS1-218ENST00000566180 GPR4P46093 362 aa18.48■□□□□ 0.55
RNPS1-218ENST00000566180 NUDT6P53370 316 aa18.48■□□□□ 0.55
RNPS1-218ENST00000566180 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
RNPS1-218ENST00000566180 EFNB3Q15768 340 aa18.48■□□□□ 0.55
RNPS1-218ENST00000566180 DPPA2Q7Z7J5 298 aa18.48■□□□□ 0.55
RNPS1-218ENST00000566180 IGFN1Q86VF2 1251 aa18.48■□□□□ 0.55
RNPS1-218ENST00000566180 CCDC197Q8NCU1 140 aa18.48■□□□□ 0.55
RNPS1-218ENST00000566180 OR4K5Q8NGD3 323 aa18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.2 ms