RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561817.5

CAPN3-210, Transcript of calpain 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPN3, Length 915 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN3-210ENST00000561817 HPF1Q9NWY4 346 aa5.86□□□□□ -1.47
CAPN3-210ENST00000561817 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
CAPN3-210ENST00000561817 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
CAPN3-210ENST00000561817 KLHL13Q9P2N7 655 aa5.86□□□□□ -1.47
CAPN3-210ENST00000561817 B3GAT1Q9P2W7 334 aa5.86□□□□□ -1.47
CAPN3-210ENST00000561817 GRHPRQ9UBQ7 328 aa5.86□□□□□ -1.47
CAPN3-210ENST00000561817 VDAC3Q9Y277 283 aa5.86□□□□□ -1.47
CAPN3-210ENST00000561817 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
CAPN3-210ENST00000561817 MED12Q93074 2177 aa5.86□□□□□ -1.47
CAPN3-210ENST00000561817 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa5.85□□□□□ -1.47
CAPN3-210ENST00000561817 A0A1W2PNV4 684 aa5.85□□□□□ -1.47
CAPN3-210ENST00000561817 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
CAPN3-210ENST00000561817 METTL15A6NJ78 407 aa5.85□□□□□ -1.47
CAPN3-210ENST00000561817 LRRC3CA6NJW4 275 aa5.85□□□□□ -1.47
CAPN3-210ENST00000561817 E9PI62 339 aa5.85□□□□□ -1.47
CAPN3-210ENST00000561817 STMND1H3BQB6 276 aa5.85□□□□□ -1.47
CAPN3-210ENST00000561817 SLC25A12O75746 678 aa5.85□□□□□ -1.47
CAPN3-210ENST00000561817 CLPXO76031 633 aa5.85□□□□□ -1.47
CAPN3-210ENST00000561817 ALX3O95076 343 aa5.85□□□□□ -1.47
CAPN3-210ENST00000561817 GOSR1O95249 250 aa5.85□□□□□ -1.47
CAPN3-210ENST00000561817 HIST1H2ABP04908 130 aa5.85□□□□□ -1.47
CAPN3-210ENST00000561817 PSKH1P11801 424 aa5.85□□□□□ -1.47
CAPN3-210ENST00000561817 HLA-DOBP13765 273 aa5.85□□□□□ -1.47
CAPN3-210ENST00000561817 PAICSP22234 425 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
CAPN3-210ENST00000561817 CD82P27701 267 aa5.85□□□□□ -1.47
CAPN3-210ENST00000561817 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
CAPN3-210ENST00000561817 HOXC12P31275 282 aa5.85□□□□□ -1.47
CAPN3-210ENST00000561817 PYCR1P32322 319 aa5.85□□□□□ -1.47
CAPN3-210ENST00000561817 EIF1P41567 113 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
CAPN3-210ENST00000561817 HCCSP53701 268 aa5.85□□□□□ -1.47
CAPN3-210ENST00000561817 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
CAPN3-210ENST00000561817 RPL27P61353 136 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
CAPN3-210ENST00000561817 RPS25P62851 125 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
CAPN3-210ENST00000561817 TUBA1BP68363 451 aa5.85□□□□□ -1.47
CAPN3-210ENST00000561817 RUNX1T1Q06455 604 aa5.85□□□□□ -1.47
CAPN3-210ENST00000561817 FOXO1Q12778 655 aa5.85□□□□□ -1.47
CAPN3-210ENST00000561817 GPR50Q13585 617 aa5.85□□□□□ -1.47
CAPN3-210ENST00000561817 C1DQ13901 141 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
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CAPN3-210ENST00000561817 ACKR1Q16570 336 aa5.85□□□□□ -1.47
CAPN3-210ENST00000561817 CDONQ4KMG0 1287 aa5.85□□□□□ -1.47
CAPN3-210ENST00000561817 KLHL12Q53G59 568 aa5.85□□□□□ -1.47
CAPN3-210ENST00000561817 FAM209BQ5JX69 171 aa5.85□□□□□ -1.47
CAPN3-210ENST00000561817 DCAF10Q5QP82 559 aa5.85□□□□□ -1.47
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CAPN3-210ENST00000561817 SLC22A10Q63ZE4 541 aa5.85□□□□□ -1.47
CAPN3-210ENST00000561817 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
CAPN3-210ENST00000561817 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
CAPN3-210ENST00000561817 LEG1Q6P5S2 330 aa5.85□□□□□ -1.47
CAPN3-210ENST00000561817 LINC00299Q6ZSB3 139 aa5.85□□□□□ -1.47
CAPN3-210ENST00000561817 TUBA1AQ71U36 451 aa5.85□□□□□ -1.47
CAPN3-210ENST00000561817 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa5.85□□□□□ -1.47
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CAPN3-210ENST00000561817 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa5.85□□□□□ -1.47
CAPN3-210ENST00000561817 TIGD4Q8IY51 512 aa5.85□□□□□ -1.47
CAPN3-210ENST00000561817 OR6V1Q8N148 313 aa5.85□□□□□ -1.47
CAPN3-210ENST00000561817 BEST3Q8N1M1 668 aa5.85□□□□□ -1.47
CAPN3-210ENST00000561817 KLHL36Q8N4N3 616 aa5.85□□□□□ -1.47
CAPN3-210ENST00000561817 POMGNT2Q8NAT1 580 aa5.85□□□□□ -1.47
CAPN3-210ENST00000561817 CLRN3Q8NCR9 226 aa5.85□□□□□ -1.47
CAPN3-210ENST00000561817 OR4K17Q8NGC6 315 aa5.85□□□□□ -1.47
CAPN3-210ENST00000561817 OR51L1Q8NGJ5 315 aa5.85□□□□□ -1.47
CAPN3-210ENST00000561817 OR5M1Q8NGP8 315 aa5.85□□□□□ -1.47
CAPN3-210ENST00000561817 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
CAPN3-210ENST00000561817 HIST1H2ACQ93077 130 aa5.85□□□□□ -1.47
CAPN3-210ENST00000561817 OTULINQ96BN8 352 aa5.85□□□□□ -1.47
CAPN3-210ENST00000561817 ZBTB8AQ96BR9 441 aa5.85□□□□□ -1.47
CAPN3-210ENST00000561817 SLC25A36Q96CQ1 311 aa5.85□□□□□ -1.47
CAPN3-210ENST00000561817 DNAJA3Q96EY1 480 aa5.85□□□□□ -1.47
CAPN3-210ENST00000561817 TSSK2Q96PF2 358 aa5.85□□□□□ -1.47
CAPN3-210ENST00000561817 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
CAPN3-210ENST00000561817 ALG8Q9BVK2 526 aa5.85□□□□□ -1.47
CAPN3-210ENST00000561817 CDADC1Q9BWV3 514 aa5.85□□□□□ -1.47
CAPN3-210ENST00000561817 ASPNQ9BXN1 380 aa5.85□□□□□ -1.47
CAPN3-210ENST00000561817 DCSTAMPQ9H295 470 aa5.85□□□□□ -1.47
CAPN3-210ENST00000561817 SIAEQ9HAT2 523 aa5.85□□□□□ -1.47
CAPN3-210ENST00000561817 CHST11Q9NPF2 352 aa5.85□□□□□ -1.47
CAPN3-210ENST00000561817 INIPQ9NRY2 104 aa5.85□□□□□ -1.47
CAPN3-210ENST00000561817 DEPPQ9NTK1 212 aa5.85□□□□□ -1.47
CAPN3-210ENST00000561817 BABAM2Q9NXR7 383 aa5.85□□□□□ -1.47
CAPN3-210ENST00000561817 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa5.85□□□□□ -1.47
CAPN3-210ENST00000561817 STUB1Q9UNE7 303 aa5.85□□□□□ -1.47
CAPN3-210ENST00000561817 COPS3Q9UNS2 423 aa5.85□□□□□ -1.47
CAPN3-210ENST00000561817 MOKQ9UQ07 419 aa5.85□□□□□ -1.47
CAPN3-210ENST00000561817 CORINQ9Y5Q5 1042 aa5.85□□□□□ -1.47
CAPN3-210ENST00000561817 NOX1Q9Y5S8 564 aa5.85□□□□□ -1.47
CAPN3-210ENST00000561817 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
CAPN3-210ENST00000561817 NCKAP5O14513 1909 aa5.85□□□□□ -1.47
CAPN3-210ENST00000561817 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa5.84□□□□□ -1.47
CAPN3-210ENST00000561817 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa5.84□□□□□ -1.47
CAPN3-210ENST00000561817 SLC22A23A1A5C7 686 aa5.84□□□□□ -1.47
CAPN3-210ENST00000561817 PRSS37A4D1T9 235 aa5.84□□□□□ -1.47
CAPN3-210ENST00000561817 PINLYPA6NC86 204 aa5.84□□□□□ -1.47
CAPN3-210ENST00000561817 TRABD2BA6NFA1 517 aa5.84□□□□□ -1.47
CAPN3-210ENST00000561817 ZNF814B7Z6K7 855 aa5.84□□□□□ -1.47
CAPN3-210ENST00000561817 C11orf98E9PRG8 122 aa5.84□□□□□ -1.47
CAPN3-210ENST00000561817 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa5.84□□□□□ -1.47
CAPN3-210ENST00000561817 G3V3Y1 287 aa5.84□□□□□ -1.47
CAPN3-210ENST00000561817 H7C1C5 153 aa5.84□□□□□ -1.47
CAPN3-210ENST00000561817 OGG1O15527 345 aa5.84□□□□□ -1.47
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