RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559770.1

MFGE8-211, Transcript of milk fat globule-EGF factor 8 protein, humanhuman

TSL 2

Gene MFGE8, Length 680 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFGE8-211ENST00000559770 NR4A2P43354 598 aa11.13□□□□□ -0.63
MFGE8-211ENST00000559770 RAB1AP62820 205 aa11.13□□□□□ -0.63
MFGE8-211ENST00000559770 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP11.13□□□□□ -0.63
MFGE8-211ENST00000559770 PIGFQ07326 219 aa11.13□□□□□ -0.63
MFGE8-211ENST00000559770 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
MFGE8-211ENST00000559770 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
MFGE8-211ENST00000559770 FXNQ16595 210 aa11.13□□□□□ -0.63
MFGE8-211ENST00000559770 HIST3H3Q16695 136 aa11.13□□□□□ -0.63
MFGE8-211ENST00000559770 KRT80Q6KB66 452 aa11.13□□□□□ -0.63
MFGE8-211ENST00000559770 ZNF584Q8IVC4 421 aa11.13□□□□□ -0.63
MFGE8-211ENST00000559770 SKA3Q8IX90 412 aa11.13□□□□□ -0.63
MFGE8-211ENST00000559770 SVOPLQ8N434 492 aa11.13□□□□□ -0.63
MFGE8-211ENST00000559770 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa11.13□□□□□ -0.63
MFGE8-211ENST00000559770 PFN4Q8NHR9 129 aa11.13□□□□□ -0.63
MFGE8-211ENST00000559770 TMEM255BQ8WV15 326 aa11.13□□□□□ -0.63
MFGE8-211ENST00000559770 ZNF566Q969W8 418 aa11.13□□□□□ -0.63
MFGE8-211ENST00000559770 FOXN4Q96NZ1 517 aa11.13□□□□□ -0.63
MFGE8-211ENST00000559770 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
MFGE8-211ENST00000559770 CHODLQ9H9P2 273 aa11.13□□□□□ -0.63
MFGE8-211ENST00000559770 C20orf141Q9NUB4 165 aa11.13□□□□□ -0.63
MFGE8-211ENST00000559770 TMEM38BQ9NVV0 291 aa11.13□□□□□ -0.63
MFGE8-211ENST00000559770 GID8Q9NWU2 228 aa11.13□□□□□ -0.63
MFGE8-211ENST00000559770 RIMS3Q9UJD0 308 aa11.13□□□□□ -0.63
MFGE8-211ENST00000559770 VSTM5A8MXK1 200 aa11.12□□□□□ -0.63
MFGE8-211ENST00000559770 DHHO43323 396 aa11.12□□□□□ -0.63
MFGE8-211ENST00000559770 BCL10O95999 233 aa11.12□□□□□ -0.63
MFGE8-211ENST00000559770 IFNA14P01570 189 aa11.12□□□□□ -0.63
MFGE8-211ENST00000559770 HIST1H2ABP04908 130 aa11.12□□□□□ -0.63
MFGE8-211ENST00000559770 THRBP10828 461 aa11.12□□□□□ -0.63
MFGE8-211ENST00000559770 UMPSP11172 480 aa11.12□□□□□ -0.63
MFGE8-211ENST00000559770 FUT1P19526 365 aa11.12□□□□□ -0.63
MFGE8-211ENST00000559770 OR1E2P47887 323 aa11.12□□□□□ -0.63
MFGE8-211ENST00000559770 GIPRP48546 466 aa11.12□□□□□ -0.63
MFGE8-211ENST00000559770 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
MFGE8-211ENST00000559770 EVX1P49640 407 aa11.12□□□□□ -0.63
MFGE8-211ENST00000559770 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
MFGE8-211ENST00000559770 TAS2R41P59536 307 aa11.12□□□□□ -0.63
MFGE8-211ENST00000559770 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
MFGE8-211ENST00000559770 CYBRD1Q53TN4 286 aa11.12□□□□□ -0.63
MFGE8-211ENST00000559770 DEF8Q6ZN54 512 aa11.12□□□□□ -0.63
MFGE8-211ENST00000559770 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa11.12□□□□□ -0.63
MFGE8-211ENST00000559770 SPATA21Q7Z572 469 aa11.12□□□□□ -0.63
MFGE8-211ENST00000559770 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa11.12□□□□□ -0.63
MFGE8-211ENST00000559770 MICU2Q8IYU8 434 aa11.12□□□□□ -0.63
MFGE8-211ENST00000559770 CDK20Q8IZL9 346 aa11.12□□□□□ -0.63
MFGE8-211ENST00000559770 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
MFGE8-211ENST00000559770 SLC22A24Q8N4F4 322 aa11.12□□□□□ -0.63
MFGE8-211ENST00000559770 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
MFGE8-211ENST00000559770 TMEM239Q8WW34 195 aa11.12□□□□□ -0.63
MFGE8-211ENST00000559770 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
MFGE8-211ENST00000559770 ASB10Q8WXI3 467 aa11.12□□□□□ -0.63
MFGE8-211ENST00000559770 HIST1H2ACQ93077 130 aa11.12□□□□□ -0.63
MFGE8-211ENST00000559770 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
MFGE8-211ENST00000559770 PIMREGQ9BSJ6 248 aa11.12□□□□□ -0.63
MFGE8-211ENST00000559770 RAB1BQ9H0U4 201 aa11.12□□□□□ -0.63
MFGE8-211ENST00000559770 CMTM6Q9NX76 183 aa11.12□□□□□ -0.63
MFGE8-211ENST00000559770 KCNS2Q9ULS6 477 aa11.12□□□□□ -0.63
MFGE8-211ENST00000559770 CMAHPQ9Y471 501 aa11.12□□□□□ -0.63
MFGE8-211ENST00000559770 CAPN7Q9Y6W3 813 aa11.12□□□□□ -0.63
MFGE8-211ENST00000559770 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa11.11□□□□□ -0.63
MFGE8-211ENST00000559770 CENPBD1B2RD01 187 aa11.11□□□□□ -0.63
MFGE8-211ENST00000559770 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa11.11□□□□□ -0.63
MFGE8-211ENST00000559770 TCF21O43680 179 aa11.11□□□□□ -0.63
MFGE8-211ENST00000559770 STAMBPO95630 424 aa11.11□□□□□ -0.63
MFGE8-211ENST00000559770 SERPINA5P05154 406 aa11.11□□□□□ -0.63
MFGE8-211ENST00000559770 F13BP05160 661 aa11.11□□□□□ -0.63
MFGE8-211ENST00000559770 QDPRP09417 244 aa11.11□□□□□ -0.63
MFGE8-211ENST00000559770 PATE4P0C8F1 98 aa11.11□□□□□ -0.63
MFGE8-211ENST00000559770 OR8G3PP0DMU2 310 aa11.11□□□□□ -0.63
MFGE8-211ENST00000559770 GIFP27352 417 aa11.11□□□□□ -0.63
MFGE8-211ENST00000559770 GLRXP35754 106 aa11.11□□□□□ -0.63
MFGE8-211ENST00000559770 MDH1P40925 334 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
MFGE8-211ENST00000559770 SELENOWP63302 87 aa11.11□□□□□ -0.63
MFGE8-211ENST00000559770 RAB39AQ14964 217 aa11.11□□□□□ -0.63
MFGE8-211ENST00000559770 NRN1LQ496H8 165 aa11.11□□□□□ -0.63
MFGE8-211ENST00000559770 NOXO1Q8NFA2 376 aa11.11□□□□□ -0.63
MFGE8-211ENST00000559770 OR2T12Q8NG77 320 aa11.11□□□□□ -0.63
MFGE8-211ENST00000559770 MCHR2Q969V1 340 aa11.11□□□□□ -0.63
MFGE8-211ENST00000559770 RCN3Q96D15 328 aa11.11□□□□□ -0.63
MFGE8-211ENST00000559770 SGTBQ96EQ0 304 aa11.11□□□□□ -0.63
MFGE8-211ENST00000559770 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
MFGE8-211ENST00000559770 ARMCX1Q9P291 453 aa11.11□□□□□ -0.63
MFGE8-211ENST00000559770 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
MFGE8-211ENST00000559770 FBXL3Q9UKT7 428 aa11.11□□□□□ -0.63
MFGE8-211ENST00000559770 A4GNTQ9UNA3 340 aa11.11□□□□□ -0.63
MFGE8-211ENST00000559770 A0A1W2PRG6 482 aa11.1□□□□□ -0.63
MFGE8-211ENST00000559770 ELOVL7A1L3X0 281 aa11.1□□□□□ -0.63
MFGE8-211ENST00000559770 NPIPB13A6NJU9 1138 aa11.1□□□□□ -0.63
MFGE8-211ENST00000559770 NPIPB4C9JG80 1138 aa11.1□□□□□ -0.63
MFGE8-211ENST00000559770 PIP5K1CO60331 668 aa11.1□□□□□ -0.63
MFGE8-211ENST00000559770 TRMUO75648 421 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
MFGE8-211ENST00000559770 RAB36O95755 333 aa11.1□□□□□ -0.63
MFGE8-211ENST00000559770 IGHG1P01857 330 aa11.1□□□□□ -0.63
MFGE8-211ENST00000559770 ITGA2P17301 1181 aa11.1□□□□□ -0.63
MFGE8-211ENST00000559770 FUT4P22083 530 aa11.1□□□□□ -0.63
MFGE8-211ENST00000559770 AQP2P41181 271 aa11.1□□□□□ -0.63
MFGE8-211ENST00000559770 GZMKP49863 264 aa11.1□□□□□ -0.63
MFGE8-211ENST00000559770 GGTLC2Q14390 218 aa11.1□□□□□ -0.63
MFGE8-211ENST00000559770 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
MFGE8-211ENST00000559770 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.8 ms