RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 BRWD3Q6RI45 1802 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 TRBC2A0A5B9 178 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 OR6C6A6NF89 314 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 GCGP01275 180 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 IFNA1P01562 189 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 LINC00032P0C843 101 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 OR10J1P30954 320 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 CDKN1BP46527 198 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 TAS2R38P59533 333 aa5.83□□□□□ -1.48
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PTPRB-210ENST00000551525 MALLQ13021 153 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 LYRM7Q5U5X0 104 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 LAS2Q8IYD9 372 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 TFAP2CQ92754 450 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 DIO2Q92813 273 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 PWWP2AQ96N64 755 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 SIGMAR1Q99720 223 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF426Q9BUY5 554 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 MOKQ9UQ07 419 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 BTRCQ9Y297 605 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 KCNK7Q9Y2U2 307 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 NPTNQ9Y639 398 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 CDH10Q9Y6N8 788 aa5.83□□□□□ -1.48
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PTPRB-210ENST00000551525 TACSTD2P09758 323 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 RAP2AP10114 183 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 PLA1AQ53H76 456 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 BAP18Q8IXM2 172 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 AQP11Q8NBQ7 271 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 OR1J2Q8NGS2 313 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 SORCS1Q8WY21 1168 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 OR1E3Q8WZA6 343 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 PHYHIPLQ96FC7 376 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 C3orf30Q96M34 536 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 MICU1Q9BPX6 476 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 CUTCQ9NTM9 273 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 CLEC2DQ9UHP7 191 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 LOXL2Q9Y4K0 774 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 HMX2A2RU54 273 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 GP1BAP07359 652 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 CSF3P09919 207 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 OMGP23515 440 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 VEZF1Q14119 521 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 SLC5A12Q1EHB4 618 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 PAQR3Q6TCH7 311 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 VRK2Q86Y07 508 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 NAXDQ8IW45 347 aa5.82□□□□□ -1.48
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PTPRB-210ENST00000551525 ADGRG7Q96K78 797 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 MECRQ9BV79 373 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 SEMA6CQ9H3T2 930 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 SLC2A8Q9NY64 477 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 GNG13Q9P2W3 67 aa5.82□□□□□ -1.48
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PTPRB-210ENST00000551525 MT-CO3P00414 261 aa5.82□□□□□ -1.48
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PTPRB-210ENST00000551525 RFX2P48378 723 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 SSR4P51571 173 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 DLX5P56178 289 aa5.82□□□□□ -1.48
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PTPRB-210ENST00000551525 FSTL4Q6MZW2 842 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 CLEC18BQ6UXF7 455 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 CLEC18CQ8NCF0 446 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 SMRP1Q8NCR6 262 aa5.82□□□□□ -1.48
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PTPRB-210ENST00000551525 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 A0A1W2PNV4 684 aa5.82□□□□□ -1.48
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PTPRB-210ENST00000551525 MEIS3P2A8K0S8 358 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 PPP5D1E7EU14 171 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 OR4F21O95013 312 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 GABARAPO95166 117 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 MT-ND2P03891 347 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 FABP3P05413 133 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 OR8U9P0C7N5 309 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 C8orf89P0DMQ9 161 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 T-ENOLP0DO92 83 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 MTHFD2P13995 350 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 GLB1P16278 677 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 UQCRC2P22695 453 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 WNT5AP41221 380 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 PTGIRP43119 386 aa5.82□□□□□ -1.48
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