RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548817.1

TROAP-208, Transcript of trophinin associated protein, humanhuman

TSL 3

Gene TROAP, Length 480 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROAP-208ENST00000548817 MAL2Q969L2 176 aa7.26□□□□□ -1.25
TROAP-208ENST00000548817 VPS33AQ96AX1 596 aa7.26□□□□□ -1.25
TROAP-208ENST00000548817 RAB39BQ96DA2 213 aa7.26□□□□□ -1.25
TROAP-208ENST00000548817 MS4A3Q96HJ5 214 aa7.26□□□□□ -1.25
TROAP-208ENST00000548817 CCT8L2Q96SF2 557 aa7.26□□□□□ -1.25
TROAP-208ENST00000548817 FOXB1Q99853 325 aa7.26□□□□□ -1.25
TROAP-208ENST00000548817 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
TROAP-208ENST00000548817 ZNF385DQ9H6B1 395 aa7.26□□□□□ -1.25
TROAP-208ENST00000548817 EVA1AQ9H8M9 152 aa7.26□□□□□ -1.25
TROAP-208ENST00000548817 CDH20Q9HBT6 801 aa7.26□□□□□ -1.25
TROAP-208ENST00000548817 SLC52A3Q9NQ40 469 aa7.26□□□□□ -1.25
TROAP-208ENST00000548817 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
TROAP-208ENST00000548817 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa7.26□□□□□ -1.25
TROAP-208ENST00000548817 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa7.26□□□□□ -1.25
TROAP-208ENST00000548817 KLHL14Q9P2G3 628 aa7.26□□□□□ -1.25
TROAP-208ENST00000548817 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
TROAP-208ENST00000548817 SLC7A8Q9UHI5 535 aa7.26□□□□□ -1.25
TROAP-208ENST00000548817 FZR1Q9UM11 496 aa7.26□□□□□ -1.25
TROAP-208ENST00000548817 MMP24Q9Y5R2 645 aa7.26□□□□□ -1.25
TROAP-208ENST00000548817 A0A1B0GUS0 222 aa7.25□□□□□ -1.25
TROAP-208ENST00000548817 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa7.25□□□□□ -1.25
TROAP-208ENST00000548817 EVPLLA8MZ36 301 aa7.25□□□□□ -1.25
TROAP-208ENST00000548817 C11orf98E9PRG8 122 aa7.25□□□□□ -1.25
TROAP-208ENST00000548817 PIN1P1O15428 100 aa7.25□□□□□ -1.25
TROAP-208ENST00000548817 HPRP00739 348 aa7.25□□□□□ -1.25
TROAP-208ENST00000548817 HIST1H2ABP04908 130 aa7.25□□□□□ -1.25
TROAP-208ENST00000548817 SERPINA5P05154 406 aa7.25□□□□□ -1.25
TROAP-208ENST00000548817 LCKP06239 509 aa7.25□□□□□ -1.25
TROAP-208ENST00000548817 NUDT7P0C024 238 aa7.25□□□□□ -1.25
TROAP-208ENST00000548817 ADORA3P0DMS8 318 aa7.25□□□□□ -1.25
TROAP-208ENST00000548817 GAAP10253 952 aa7.25□□□□□ -1.25
TROAP-208ENST00000548817 NAT2P11245 290 aa7.25□□□□□ -1.25
TROAP-208ENST00000548817 SLC6A2P23975 617 aa7.25□□□□□ -1.25
TROAP-208ENST00000548817 RAD52P43351 418 aa7.25□□□□□ -1.25
TROAP-208ENST00000548817 SEC24CP53992 1094 aa7.25□□□□□ -1.25
TROAP-208ENST00000548817 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
TROAP-208ENST00000548817 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
TROAP-208ENST00000548817 CDK6Q00534 326 aa7.25□□□□□ -1.25
TROAP-208ENST00000548817 PLP2Q04941 152 aa7.25□□□□□ -1.25
TROAP-208ENST00000548817 MPP2Q14168 576 aa7.25□□□□□ -1.25
TROAP-208ENST00000548817 RAB39AQ14964 217 aa7.25□□□□□ -1.25
TROAP-208ENST00000548817 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
TROAP-208ENST00000548817 OR1Q1Q15612 314 aa7.25□□□□□ -1.25
TROAP-208ENST00000548817 TUSC1Q2TAM9 212 aa7.25□□□□□ -1.25
TROAP-208ENST00000548817 PCGF3Q3KNV8 242 aa7.25□□□□□ -1.25
TROAP-208ENST00000548817 PHYHD1Q5SRE7 291 aa7.25□□□□□ -1.25
TROAP-208ENST00000548817 ACSM5Q6NUN0 579 aa7.25□□□□□ -1.25
TROAP-208ENST00000548817 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa7.25□□□□□ -1.25
TROAP-208ENST00000548817 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
TROAP-208ENST00000548817 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa7.25□□□□□ -1.25
TROAP-208ENST00000548817 PXKQ7Z7A4 578 aa7.25□□□□□ -1.25
TROAP-208ENST00000548817 DPPA2Q7Z7J5 298 aa7.25□□□□□ -1.25
TROAP-208ENST00000548817 LRP11Q86VZ4 500 aa7.25□□□□□ -1.25
TROAP-208ENST00000548817 NANPQ8TBE9 248 aa7.25□□□□□ -1.25
TROAP-208ENST00000548817 SYNPRQ8TBG9 265 aa7.25□□□□□ -1.25
TROAP-208ENST00000548817 GTF2H4Q92759 462 aa7.25□□□□□ -1.25
TROAP-208ENST00000548817 HIST1H2ACQ93077 130 aa7.25□□□□□ -1.25
TROAP-208ENST00000548817 TLCD1Q96CP7 247 aa7.25□□□□□ -1.25
TROAP-208ENST00000548817 TIMD4Q96H15 378 aa7.25□□□□□ -1.25
TROAP-208ENST00000548817 TXNDC15Q96J42 360 aa7.25□□□□□ -1.25
TROAP-208ENST00000548817 RACGAP1Q9H0H5 632 aa7.25□□□□□ -1.25
TROAP-208ENST00000548817 KCNN2Q9H2S1 579 aa7.25□□□□□ -1.25
TROAP-208ENST00000548817 C1orf198Q9H425 327 aa7.25□□□□□ -1.25
TROAP-208ENST00000548817 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
TROAP-208ENST00000548817 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
TROAP-208ENST00000548817 DECR2Q9NUI1 292 aa7.25□□□□□ -1.25
TROAP-208ENST00000548817 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
TROAP-208ENST00000548817 TAAR3PQ9P1P4 343 aa7.25□□□□□ -1.25
TROAP-208ENST00000548817 CORO2BQ9UQ03 480 aa7.25□□□□□ -1.25
TROAP-208ENST00000548817 CHST2Q9Y4C5 530 aa7.25□□□□□ -1.25
TROAP-208ENST00000548817 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa7.24□□□□□ -1.25
TROAP-208ENST00000548817 LOC105371242A0A075B767 164 aa7.24□□□□□ -1.25
TROAP-208ENST00000548817 A0A0G2JMP0 313 aa7.24□□□□□ -1.25
TROAP-208ENST00000548817 A0A0X1KG70 313 aa7.24□□□□□ -1.25
TROAP-208ENST00000548817 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa7.24□□□□□ -1.25
TROAP-208ENST00000548817 PLPP3O14495 311 aa7.24□□□□□ -1.25
TROAP-208ENST00000548817 TIMM23O14925 209 aa7.24□□□□□ -1.25
TROAP-208ENST00000548817 RNF13O43567 381 aa7.24□□□□□ -1.25
TROAP-208ENST00000548817 CDC14BO60729 498 aa7.24□□□□□ -1.25
TROAP-208ENST00000548817 FZD7O75084 574 aa7.24□□□□□ -1.25
TROAP-208ENST00000548817 SNNO75324 88 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
TROAP-208ENST00000548817 MT-ATP6P00846 226 aa7.24□□□□□ -1.25
TROAP-208ENST00000548817 BGLAPP02818 100 aa7.24□□□□□ -1.25
TROAP-208ENST00000548817 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
TROAP-208ENST00000548817 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
TROAP-208ENST00000548817 OR8G3PP0DMU2 310 aa7.24□□□□□ -1.25
TROAP-208ENST00000548817 BMP2P12643 396 aa7.24□□□□□ -1.25
TROAP-208ENST00000548817 HLA-DOBP13765 273 aa7.24□□□□□ -1.25
TROAP-208ENST00000548817 ADRA2CP18825 462 aa7.24□□□□□ -1.25
TROAP-208ENST00000548817 HTR2AP28223 471 aa7.24□□□□□ -1.25
TROAP-208ENST00000548817 ZNF84P51523 738 aa7.24□□□□□ -1.25
TROAP-208ENST00000548817 BIDP55957 195 aa7.24□□□□□ -1.25
TROAP-208ENST00000548817 RBBP4Q09028 425 aa7.24□□□□□ -1.25
TROAP-208ENST00000548817 SCARB2Q14108 478 aa7.24□□□□□ -1.25
TROAP-208ENST00000548817 FXNQ16595 210 aa7.24□□□□□ -1.25
TROAP-208ENST00000548817 TBC1D28Q2M2D7 210 aa7.24□□□□□ -1.25
TROAP-208ENST00000548817 ALKBH6Q3KRA9 238 aa7.24□□□□□ -1.25
TROAP-208ENST00000548817 SLC36A2Q495M3 483 aa7.24□□□□□ -1.25
TROAP-208ENST00000548817 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
TROAP-208ENST00000548817 SLC2A7Q6PXP3 512 aa7.24□□□□□ -1.25
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