RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548518.1

SLC8B1-205, Transcript of solute carrier family 8 member B1, human

TSL 4

Gene SLC8B1, Length 664 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SLC8B1-205	ENST00000548518	PPP1R8	Q12972	351 aa	Known RBP	10.53	□□□□□ -0.72
SLC8B1-205	ENST00000548518	RFX4	Q33E94	735 aa		10.53	□□□□□ -0.72
SLC8B1-205	ENST00000548518	HIKESHI	Q53FT3	197 aa		10.53	□□□□□ -0.72
SLC8B1-205	ENST00000548518	LINGO2	Q7L985	606 aa		10.53	□□□□□ -0.72
SLC8B1-205	ENST00000548518	ADCK1	Q86TW2	530 aa		10.53	□□□□□ -0.72
SLC8B1-205	ENST00000548518	JAZF1	Q86VZ6	243 aa		10.53	□□□□□ -0.72
SLC8B1-205	ENST00000548518	LRRC75A	Q8NAA5	344 aa		10.53	□□□□□ -0.72
SLC8B1-205	ENST00000548518	BCL2L2	Q92843	193 aa	Predicted RBP	10.53	□□□□□ -0.72
SLC8B1-205	ENST00000548518	MCHR2	Q969V1	340 aa		10.53	□□□□□ -0.72
SLC8B1-205	ENST00000548518	RADIL	Q96JH8	1075 aa		10.53	□□□□□ -0.72
SLC8B1-205	ENST00000548518	TSPAN32	Q96QS1	320 aa		10.53	□□□□□ -0.72
SLC8B1-205	ENST00000548518	GPX7	Q96SL4	187 aa	Predicted RBP	10.53	□□□□□ -0.72
SLC8B1-205	ENST00000548518	IFT27	Q9BW83	186 aa		10.53	□□□□□ -0.72
SLC8B1-205	ENST00000548518	DGCR6L	Q9BY27	220 aa		10.53	□□□□□ -0.72
SLC8B1-205	ENST00000548518	MRPL13	Q9BYD1	178 aa	Known RBP	10.53	□□□□□ -0.72
SLC8B1-205	ENST00000548518	NRIP3	Q9NQ35	241 aa		10.53	□□□□□ -0.72
SLC8B1-205	ENST00000548518	ARMC1	Q9NVT9	282 aa		10.53	□□□□□ -0.72
SLC8B1-205	ENST00000548518	PDP1	Q9P0J1	537 aa	Predicted RBP	10.53	□□□□□ -0.72
SLC8B1-205	ENST00000548518	KIF17	Q9P2E2	1029 aa		10.53	□□□□□ -0.72
SLC8B1-205	ENST00000548518	SLC25A15	Q9Y619	301 aa		10.53	□□□□□ -0.72
SLC8B1-205	ENST00000548518	CDH10	Q9Y6N8	788 aa		10.53	□□□□□ -0.72
SLC8B1-205	ENST00000548518		A0A1W2PR80	420 aa		10.52	□□□□□ -0.73
SLC8B1-205	ENST00000548518	DEFB108A	A8MXU0	73 aa		10.52	□□□□□ -0.73
SLC8B1-205	ENST00000548518		M0R1B8	84 aa		10.52	□□□□□ -0.73
SLC8B1-205	ENST00000548518	IMPA2	O14732	288 aa		10.52	□□□□□ -0.73
SLC8B1-205	ENST00000548518	IDH3B	O43837	385 aa		10.52	□□□□□ -0.73
SLC8B1-205	ENST00000548518	TIPRL	O75663	272 aa		10.52	□□□□□ -0.73
SLC8B1-205	ENST00000548518	UBL3	O95164	117 aa		10.52	□□□□□ -0.73
SLC8B1-205	ENST00000548518	GAST	P01350	101 aa		10.52	□□□□□ -0.73
SLC8B1-205	ENST00000548518	OR8G3P	P0DMU2	310 aa		10.52	□□□□□ -0.73
SLC8B1-205	ENST00000548518	ANXA8	P13928	327 aa		10.52	□□□□□ -0.73
SLC8B1-205	ENST00000548518	B4GALT1	P15291	398 aa		10.52	□□□□□ -0.73
SLC8B1-205	ENST00000548518	NPR2	P20594	1047 aa		10.52	□□□□□ -0.73
SLC8B1-205	ENST00000548518	ZNF83	P51522	516 aa		10.52	□□□□□ -0.73
SLC8B1-205	ENST00000548518	MYBPC1	Q00872	1141 aa		10.52	□□□□□ -0.73
SLC8B1-205	ENST00000548518	GABPB1	Q06547	395 aa	Predicted RBP	10.52	□□□□□ -0.73
SLC8B1-205	ENST00000548518	KRR1	Q13601	381 aa	Known RBP	10.52	□□□□□ -0.73
SLC8B1-205	ENST00000548518	FHL1	Q13642	323 aa		10.52	□□□□□ -0.73
SLC8B1-205	ENST00000548518	HIST3H3	Q16695	136 aa		10.52	□□□□□ -0.73
SLC8B1-205	ENST00000548518	NRN1L	Q496H8	165 aa		10.52	□□□□□ -0.73
SLC8B1-205	ENST00000548518	PHYHD1	Q5SRE7	291 aa		10.52	□□□□□ -0.73
SLC8B1-205	ENST00000548518	NCMAP	Q5T1S8	102 aa		10.52	□□□□□ -0.73
SLC8B1-205	ENST00000548518	DNM1P34	Q6PK57	102 aa		10.52	□□□□□ -0.73
SLC8B1-205	ENST00000548518	ZNF620	Q6ZNG0	422 aa		10.52	□□□□□ -0.73
SLC8B1-205	ENST00000548518	RASSF6	Q6ZTQ3	369 aa		10.52	□□□□□ -0.73
SLC8B1-205	ENST00000548518	C22orf34	Q6ZV56	151 aa		10.52	□□□□□ -0.73
SLC8B1-205	ENST00000548518	DPPA2	Q7Z7J5	298 aa		10.52	□□□□□ -0.73
SLC8B1-205	ENST00000548518	CDC20B	Q86Y33	519 aa		10.52	□□□□□ -0.73
SLC8B1-205	ENST00000548518	ZNF519	Q8TB69	540 aa		10.52	□□□□□ -0.73
SLC8B1-205	ENST00000548518	HDAC2	Q92769	488 aa	Known RBP	10.52	□□□□□ -0.73
SLC8B1-205	ENST00000548518	GTPBP3	Q969Y2	492 aa	Known RBP	10.52	□□□□□ -0.73
SLC8B1-205	ENST00000548518	LURAP1	Q96LR2	239 aa		10.52	□□□□□ -0.73
SLC8B1-205	ENST00000548518		Q96M85	177 aa		10.52	□□□□□ -0.73
SLC8B1-205	ENST00000548518	ERMAP	Q96PL5	475 aa	Predicted RBP	10.52	□□□□□ -0.73
SLC8B1-205	ENST00000548518	KCNK17	Q96T54	332 aa		10.52	□□□□□ -0.73
SLC8B1-205	ENST00000548518	DENND2D	Q9H6A0	471 aa	Predicted RBP	10.52	□□□□□ -0.73
SLC8B1-205	ENST00000548518	TBC1D23	Q9NUY8	699 aa		10.52	□□□□□ -0.73
SLC8B1-205	ENST00000548518	FBXL3	Q9UKT7	428 aa		10.52	□□□□□ -0.73
SLC8B1-205	ENST00000548518	ADAM18	Q9Y3Q7	739 aa		10.52	□□□□□ -0.73
SLC8B1-205	ENST00000548518	RNF115	Q9Y4L5	304 aa		10.52	□□□□□ -0.73
SLC8B1-205	ENST00000548518	IER3IP1	Q9Y5U9	82 aa		10.52	□□□□□ -0.73
SLC8B1-205	ENST00000548518	ABCA4	P78363	2273 aa		10.52	□□□□□ -0.73
SLC8B1-205	ENST00000548518	TEX13C	A0A0J9YWL9	993 aa		10.51	□□□□□ -0.73
SLC8B1-205	ENST00000548518	ARPC3	O15145	178 aa		10.51	□□□□□ -0.73
SLC8B1-205	ENST00000548518	SEC14L2	O76054	403 aa		10.51	□□□□□ -0.73
SLC8B1-205	ENST00000548518	PPP1R3D	O95685	299 aa		10.51	□□□□□ -0.73
SLC8B1-205	ENST00000548518	RAB36	O95755	333 aa		10.51	□□□□□ -0.73
SLC8B1-205	ENST00000548518	REN	P00797	406 aa		10.51	□□□□□ -0.73
SLC8B1-205	ENST00000548518	ARR3	P36575	388 aa		10.51	□□□□□ -0.73
SLC8B1-205	ENST00000548518	ACTR3	P61158	418 aa		10.51	□□□□□ -0.73
SLC8B1-205	ENST00000548518	RUNX1T1	Q06455	604 aa		10.51	□□□□□ -0.73
SLC8B1-205	ENST00000548518	BSPH1	Q075Z2	132 aa		10.51	□□□□□ -0.73
SLC8B1-205	ENST00000548518	CCNI	Q14094	377 aa		10.51	□□□□□ -0.73
SLC8B1-205	ENST00000548518	GSG1	Q2KHT4	349 aa		10.51	□□□□□ -0.73
SLC8B1-205	ENST00000548518	SLC36A2	Q495M3	483 aa		10.51	□□□□□ -0.73
SLC8B1-205	ENST00000548518	C10orf128	Q5T292	105 aa		10.51	□□□□□ -0.73
SLC8B1-205	ENST00000548518	ZNF770	Q6IQ21	691 aa	Predicted RBP	10.51	□□□□□ -0.73
SLC8B1-205	ENST00000548518	ZFP1	Q6P2D0	407 aa		10.51	□□□□□ -0.73
SLC8B1-205	ENST00000548518	LRFN4	Q6PJG9	635 aa		10.51	□□□□□ -0.73
SLC8B1-205	ENST00000548518	ZNF704	Q6ZNC4	412 aa	Predicted RBP	10.51	□□□□□ -0.73
SLC8B1-205	ENST00000548518	ZNF627	Q7L945	461 aa		10.51	□□□□□ -0.73
SLC8B1-205	ENST00000548518	HIPK1	Q86Z02	1210 aa		10.51	□□□□□ -0.73
SLC8B1-205	ENST00000548518	SLC22A24	Q8N4F4	322 aa		10.51	□□□□□ -0.73
SLC8B1-205	ENST00000548518	CLDN22	Q8N7P3	220 aa		10.51	□□□□□ -0.73
SLC8B1-205	ENST00000548518	WDR31	Q8NA23	367 aa		10.51	□□□□□ -0.73
SLC8B1-205	ENST00000548518	ATG16L2	Q8NAA4	619 aa		10.51	□□□□□ -0.73
SLC8B1-205	ENST00000548518	TEX47	Q8TBZ9	253 aa		10.51	□□□□□ -0.73
SLC8B1-205	ENST00000548518	DNAJC9	Q8WXX5	260 aa		10.51	□□□□□ -0.73
SLC8B1-205	ENST00000548518	NSMAF	Q92636	917 aa		10.51	□□□□□ -0.73
SLC8B1-205	ENST00000548518	ZNF837	Q96EG3	531 aa	Predicted RBP	10.51	□□□□□ -0.73
SLC8B1-205	ENST00000548518	NRBF2	Q96F24	287 aa		10.51	□□□□□ -0.73
SLC8B1-205	ENST00000548518	DUS3L	Q96G46	650 aa	Known RBP	10.51	□□□□□ -0.73
SLC8B1-205	ENST00000548518	SAMD8	Q96LT4	415 aa		10.51	□□□□□ -0.73
SLC8B1-205	ENST00000548518	GPA33	Q99795	319 aa		10.51	□□□□□ -0.73
SLC8B1-205	ENST00000548518	C1QTNF6	Q9BXI9	259 aa		10.51	□□□□□ -0.73
SLC8B1-205	ENST00000548518	TEX12	Q9BXU0	123 aa		10.51	□□□□□ -0.73
SLC8B1-205	ENST00000548518	RNF121	Q9H920	327 aa		10.51	□□□□□ -0.73
SLC8B1-205	ENST00000548518	TMEM38B	Q9NVV0	291 aa		10.51	□□□□□ -0.73
SLC8B1-205	ENST00000548518	VNN3	Q9NY84	501 aa		10.51	□□□□□ -0.73
SLC8B1-205	ENST00000548518	IL20RA	Q9UHF4	553 aa		10.51	□□□□□ -0.73

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.6 ms