RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548041.5

CS-211, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 561 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-211ENST00000548041 ZNF224Q9NZL3 707 aa7.53□□□□□ -1.2
CS-211ENST00000548041 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
CS-211ENST00000548041 TMCC3Q9ULS5 477 aa7.53□□□□□ -1.2
CS-211ENST00000548041 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa7.53□□□□□ -1.2
CS-211ENST00000548041 AMDHD2Q9Y303 409 aa7.53□□□□□ -1.2
CS-211ENST00000548041 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
CS-211ENST00000548041 PLCE1Q9P212 2302 aa7.52□□□□□ -1.2
CS-211ENST00000548041 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 ABCD4O14678 606 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 DHHO43323 396 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 TIPRLO75663 272 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 KRT36O76013 467 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 CCNB2O95067 398 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 PPP1R3DO95685 299 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 GASTP01350 101 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 CD3EP07766 207 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 CD14P08571 375 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 CELA3BP08861 270 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 CAPZA2P47755 286 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 HMGA2P52926 109 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 NR1H2P55055 460 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 TSPAN31Q12999 210 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 ANKDD1AQ495B1 522 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 C1orf146Q5VVC0 180 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 SMARCD3Q6STE5 483 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 PAMR1Q6UXH9 720 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 B3GLCTQ6Y288 498 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 ZNF813Q6ZN06 617 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 ZNF620Q6ZNG0 422 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 HS3ST5Q8IZT8 346 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 AQP11Q8NBQ7 271 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 FGFBP3Q8TAT2 258 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 NSMAFQ92636 917 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 BOD1Q96IK1 185 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 SAMD8Q96LT4 415 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 TMEM204Q9BSN7 226 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 EGLN3Q9H6Z9 239 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 NRIP3Q9NQ35 241 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 POFUT2Q9Y2G5 429 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 RNF115Q9Y4L5 304 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 ROS1P08922 2347 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 NAV2Q8IVL1 2488 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa7.51□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 SHISA9B4DS77 424 aa7.51□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 EBAG9O00559 213 aa7.51□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 SOCS2O14508 198 aa7.51□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 ARHGEF9O43307 516 aa7.51□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 SOX14O95416 240 aa7.51□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 WNT11O96014 354 aa7.51□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 HLA-HP01893 362 aa7.51□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 PATE4P0C8F1 98 aa7.51□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 CD40P25942 277 aa7.51□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 SDHAP31040 664 aa7.51□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 CDAP32320 146 aa7.51□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 CDH11P55287 796 aa7.51□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 PIGFQ07326 219 aa7.51□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 NPRL3Q12980 569 aa7.51□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 TAF11Q15544 211 aa7.51□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 MICAQ29983 383 aa7.51□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa7.51□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 C10orf128Q5T292 105 aa7.51□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa7.51□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 TMEM108Q6UXF1 575 aa7.51□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 PTCHD4Q6ZW05 846 aa7.51□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 ZNF627Q7L945 461 aa7.51□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 HDDC2Q7Z4H3 204 aa7.51□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 MDP1Q86V88 176 aa7.51□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 SKA3Q8IX90 412 aa7.51□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa7.51□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 OR10G2Q8NGC3 310 aa7.51□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 OR8D4Q8NGM9 314 aa7.51□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP7.51□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 NABP1Q96AH0 204 aa7.51□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 FOXN4Q96NZ1 517 aa7.51□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 SLC38A2Q96QD8 506 aa7.51□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 SH3GL3Q99963 347 aa7.51□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 ALG12Q9BV10 488 aa7.51□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 NGBQ9NPG2 151 aa7.51□□□□□ -1.21
CS-211ENST00000548041 TMEM38BQ9NVV0 291 aa7.51□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 91.1 ms