RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527952.1

PTPRJ-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRJ, Length 626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-205ENST00000527952 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
PTPRJ-205ENST00000527952 TMEM38BQ9NVV0 291 aa20.56■□□□□ 0.88
PTPRJ-205ENST00000527952 CORO2BQ9UQ03 480 aa20.56■□□□□ 0.88
PTPRJ-205ENST00000527952 DHHO43323 396 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRJ-205ENST00000527952 CHP2O43745 196 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRJ-205ENST00000527952 RP2O75695 350 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRJ-205ENST00000527952 TGDSO95455 350 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRJ-205ENST00000527952 OR8G3PP0DMU2 310 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRJ-205ENST00000527952 MTPNP58546 118 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRJ-205ENST00000527952 LMO4P61968 165 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRJ-205ENST00000527952 CCL8P80075 99 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRJ-205ENST00000527952 MYBPC1Q00872 1141 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRJ-205ENST00000527952 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
PTPRJ-205ENST00000527952 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
PTPRJ-205ENST00000527952 ZNF613Q6PF04 617 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRJ-205ENST00000527952 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
PTPRJ-205ENST00000527952 ICA1LQ8NDH6 482 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRJ-205ENST00000527952 OR4K5Q8NGD3 323 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRJ-205ENST00000527952 LRRC8CQ8TDW0 803 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRJ-205ENST00000527952 ZNF566Q969W8 418 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRJ-205ENST00000527952 FAHD2AQ96GK7 314 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRJ-205ENST00000527952 SLC7A7Q9UM01 511 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRJ-205ENST00000527952 GMEB1Q9Y692 573 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRJ-205ENST00000527952 TENM1Q9UKZ4 2725 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRJ-205ENST00000527952 LCKP06239 509 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRJ-205ENST00000527952 QDPRP09417 244 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRJ-205ENST00000527952 UMPSP11172 480 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRJ-205ENST00000527952 CFPP27918 469 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRJ-205ENST00000527952 TMEM33P57088 247 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRJ-205ENST00000527952 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
PTPRJ-205ENST00000527952 MVKQ03426 396 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRJ-205ENST00000527952 GLO1Q04760 184 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRJ-205ENST00000527952 CYP51A1Q16850 503 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRJ-205ENST00000527952 REP15Q6BDI9 236 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRJ-205ENST00000527952 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
PTPRJ-205ENST00000527952 DEF8Q6ZN54 512 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRJ-205ENST00000527952 C11orf65Q8NCR3 313 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRJ-205ENST00000527952 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRJ-205ENST00000527952 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
PTPRJ-205ENST00000527952 CDH20Q9HBT6 801 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRJ-205ENST00000527952 NANSQ9NR45 359 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRJ-205ENST00000527952 FBXL3Q9UKT7 428 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRJ-205ENST00000527952 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
PTPRJ-205ENST00000527952 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRJ-205ENST00000527952 FMO6PO60774 539 aa20.53■□□□□ 0.88
PTPRJ-205ENST00000527952 TFP02787 698 aa20.53■□□□□ 0.88
PTPRJ-205ENST00000527952 PGA4P0DJD7 388 aa20.53■□□□□ 0.88
PTPRJ-205ENST00000527952 PGA3P0DJD8 388 aa20.53■□□□□ 0.88
PTPRJ-205ENST00000527952 RUNX1T1Q06455 604 aa20.53■□□□□ 0.88
PTPRJ-205ENST00000527952 RBBP4Q09028 425 aa20.53■□□□□ 0.88
PTPRJ-205ENST00000527952 ZP4Q12836 540 aa20.53■□□□□ 0.88
PTPRJ-205ENST00000527952 DHDDSQ86SQ9 333 aa20.53■□□□□ 0.88
PTPRJ-205ENST00000527952 OR51F2Q8NH61 342 aa20.53■□□□□ 0.88
PTPRJ-205ENST00000527952 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa20.53■□□□□ 0.88
PTPRJ-205ENST00000527952 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
PTPRJ-205ENST00000527952 ZNF347Q96SE7 839 aa20.53■□□□□ 0.88
PTPRJ-205ENST00000527952 C17orf100A8MU93 164 aa20.52■□□□□ 0.88
PTPRJ-205ENST00000527952 FARS2O95363 451 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
PTPRJ-205ENST00000527952 AVPP01185 164 aa20.52■□□□□ 0.88
PTPRJ-205ENST00000527952 TMEM53Q6P2H8 277 aa20.52■□□□□ 0.88
PTPRJ-205ENST00000527952 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
PTPRJ-205ENST00000527952 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
PTPRJ-205ENST00000527952 SLC16A14Q7RTX9 510 aa20.52■□□□□ 0.88
PTPRJ-205ENST00000527952 LRRC18Q8N456 261 aa20.52■□□□□ 0.88
PTPRJ-205ENST00000527952 SYNPRQ8TBG9 265 aa20.52■□□□□ 0.88
PTPRJ-205ENST00000527952 ZNF416Q9BWM5 594 aa20.52■□□□□ 0.88
PTPRJ-205ENST00000527952 ZNF385DQ9H6B1 395 aa20.52■□□□□ 0.88
PTPRJ-205ENST00000527952 EVA1AQ9H8M9 152 aa20.52■□□□□ 0.88
PTPRJ-205ENST00000527952 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
PTPRJ-205ENST00000527952 WNK2Q9Y3S1 2297 aa20.52■□□□□ 0.88
PTPRJ-205ENST00000527952 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa20.51■□□□□ 0.87
PTPRJ-205ENST00000527952 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa20.51■□□□□ 0.87
PTPRJ-205ENST00000527952 BCL10O95999 233 aa20.51■□□□□ 0.87
PTPRJ-205ENST00000527952 HIST1H2ABP04908 130 aa20.51■□□□□ 0.87
PTPRJ-205ENST00000527952 F13BP05160 661 aa20.51■□□□□ 0.87
PTPRJ-205ENST00000527952 CD247P20963 164 aa20.51■□□□□ 0.87
PTPRJ-205ENST00000527952 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
PTPRJ-205ENST00000527952 CLRN1P58418 232 aa20.51■□□□□ 0.87
PTPRJ-205ENST00000527952 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
PTPRJ-205ENST00000527952 TMEM154Q6P9G4 183 aa20.51■□□□□ 0.87
PTPRJ-205ENST00000527952 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa20.51■□□□□ 0.87
PTPRJ-205ENST00000527952 RETREG3Q86VR2 466 aa20.51■□□□□ 0.87
PTPRJ-205ENST00000527952 SYT14Q8NB59 555 aa20.51■□□□□ 0.87
PTPRJ-205ENST00000527952 HIST1H2ACQ93077 130 aa20.51■□□□□ 0.87
PTPRJ-205ENST00000527952 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa20.51■□□□□ 0.87
PTPRJ-205ENST00000527952 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
PTPRJ-205ENST00000527952 CACNG2Q9Y698 323 aa20.51■□□□□ 0.87
PTPRJ-205ENST00000527952 LOC105371242A0A075B767 164 aa20.5■□□□□ 0.87
PTPRJ-205ENST00000527952 TRAPPC13A5PLN9 417 aa20.5■□□□□ 0.87
PTPRJ-205ENST00000527952 ATP4BP51164 291 aa20.5■□□□□ 0.87
PTPRJ-205ENST00000527952 TSTQ16762 297 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
PTPRJ-205ENST00000527952 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa20.5■□□□□ 0.87
PTPRJ-205ENST00000527952 SNX33Q8WV41 574 aa20.5■□□□□ 0.87
PTPRJ-205ENST00000527952 MCHR2Q969V1 340 aa20.5■□□□□ 0.87
PTPRJ-205ENST00000527952 TAMM41Q96BW9 452 aa20.5■□□□□ 0.87
PTPRJ-205ENST00000527952 CGREF1Q99674 301 aa20.5■□□□□ 0.87
PTPRJ-205ENST00000527952 ZNF665Q9H7R5 613 aa20.5■□□□□ 0.87
PTPRJ-205ENST00000527952 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
PTPRJ-205ENST00000527952 ZNF229Q9UJW7 825 aa20.5■□□□□ 0.87
PTPRJ-205ENST00000527952 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.1 ms