RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522344.1

CPEB4-210, Transcript of cytoplasmic polyadenylation element binding protein 4, humanhuman

TSL 2

Gene CPEB4, Length 481 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPEB4-210ENST00000522344 C12orf56Q8IXR9 622 aa2.3□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 RAET1EQ8TD07 263 aa2.3□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 HTR3CQ8WXA8 447 aa2.3□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 DEDD2Q8WXF8 326 aa2.3□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 TAAR1Q96RJ0 339 aa2.3□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 ALG12Q9BV10 488 aa2.3□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 PORCNQ9H237 461 aa2.3□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa2.3□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 TBK1Q9UHD2 729 aa2.3□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 SLC25A15Q9Y619 301 aa2.3□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa2.3□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 TRIP11Q15643 1979 aa2.3□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 DOCK8Q8NF50 2099 aa2.3□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 FAM186AA6NE01 2351 aa2.3□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 COL1A2P08123 1366 aa2.29□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa2.29□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 ANGPTL7O43827 346 aa2.29□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 CXCL13O43927 109 aa2.29□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 CNMDO75829 334 aa2.29□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP2.29□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 ABOP16442 354 aa2.29□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 CALCRP30988 508 aa2.29□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 CXCL5P42830 114 aa2.29□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP2.29□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 PRMT2P55345 433 aa2.29□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 RFX4Q33E94 735 aa2.29□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP2.29□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 GPR157Q5UAW9 335 aa2.29□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 SLC26A11Q86WA9 606 aa2.29□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 LRRC43Q8N309 656 aa2.29□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 DEFB123Q8N688 67 aa2.29□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 TRPV1Q8NER1 839 aa2.29□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 OR4K14Q8NGD5 310 aa2.29□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 OR4D9Q8NGE8 314 aa2.29□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 PAGE5Q96GU1 130 aa2.29□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 SEC22AQ96IW7 307 aa2.29□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP2.29□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 ZNF670Q9BS34 389 aa2.29□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 RNF167Q9H6Y7 350 aa2.29□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 SLC17A5Q9NRA2 495 aa2.29□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 ZNF226Q9NYT6 803 aa2.29□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa2.29□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 TMOD2Q9NZR1 351 aa2.29□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP2.29□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP2.29□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP2.29□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 SPTBN2O15020 2390 aa2.29□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 MIA3Q5JRA6 1907 aa2.29□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 ANK1P16157 1881 aa2.28□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa2.28□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 ROBO3Q96MS0 1386 aa2.28□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 FRYLO94915 3013 aa2.28□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 CXCL11O14625 94 aa2.28□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 OR1F1O43749 312 aa2.28□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 UGT1A9O60656 530 aa2.28□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 SUPT3HO75486 399 aa2.28□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 CIAO1O76071 339 aa2.28□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 IGLV3-19P01714 112 aa2.28□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 TDGF1P13385 188 aa2.28□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 POU2F1P14859 743 aa2.28□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 HNF1AP20823 631 aa2.28□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 IL10P22301 178 aa2.28□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 BTCP35070 178 aa2.28□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 PTGDSP41222 190 aa2.28□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 TDGF1P3P51864 188 aa2.28□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 PKNOX1P55347 436 aa2.28□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP2.28□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 PJVKQ0ZLH3 352 aa2.28□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 PDZK1IP1Q13113 114 aa2.28□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 TMEM183BQ1AE95 376 aa2.28□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 PARP15Q460N3 678 aa2.28□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 CAVIN4Q5BKX8 364 aa2.28□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 TPGS2Q68CL5 300 aa2.28□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 PLBD1Q6P4A8 553 aa2.28□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa2.28□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 PCP2Q8IVA1 136 aa2.28□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 TMEM183AQ8IXX5 376 aa2.28□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 ZNF615Q8N8J6 731 aa2.28□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 ZNF709Q8N972 641 aa2.28□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 CNNM3Q8NE01 707 aa2.28□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 FRZBQ92765 325 aa2.28□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 ASB9Q96DX5 294 aa2.28□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 CMTM7Q96FZ5 175 aa2.28□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 RIT2Q99578 217 aa2.28□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 TMEM117Q9H0C3 514 aa2.28□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 ING2Q9H160 280 aa2.28□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 C1orf21Q9H246 121 aa2.28□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 DPH5Q9H2P9 285 aa2.28□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 ZFP14Q9HCL3 533 aa2.28□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 PCYOX1Q9UHG3 505 aa2.28□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 PATJQ8NI35 1801 aa2.28□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 CEP250Q9BV73 2442 aa2.28□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 SPAG17Q6Q759 2223 aa2.27□□□□□ -2.05
CPEB4-210ENST00000522344 DMDP11532 3685 aa2.27□□□□□ -2.05
CPEB4-210ENST00000522344 CACNA1AO00555 2505 aa2.27□□□□□ -2.05
CPEB4-210ENST00000522344 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
CPEB4-210ENST00000522344 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
CPEB4-210ENST00000522344 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa2.27□□□□□ -2.05
CPEB4-210ENST00000522344 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa2.27□□□□□ -2.05
CPEB4-210ENST00000522344 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 76.9 ms