RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519068.2

MSC-AS1-205, MSC antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene MSC-AS1, Length 569 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSC-AS1-205ENST00000519068 IL1RL1Q01638 556 aa4.77□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 MYBPHQ13203 477 aa4.77□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 PMS2P3Q13401 168 aa4.77□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 OR7A5Q15622 319 aa4.77□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 TRIP10Q15642 601 aa4.77□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 C3AR1Q16581 482 aa4.77□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 SGCBQ16585 318 aa4.77□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 MSMPQ1L6U9 139 aa4.77□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 ZNF674Q2M3X9 581 aa4.77□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 MS4A18Q3C1V0 323 aa4.77□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 HBMQ6B0K9 141 aa4.77□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 C1orf94Q6P1W5 598 aa4.77□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 ZNF585AQ6P3V2 769 aa4.77□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 PLXDC2Q6UX71 529 aa4.77□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa4.77□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa4.77□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 CHMP1BQ7LBR1 199 aa4.77□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 HIPK1Q86Z02 1210 aa4.77□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 KDM8Q8N371 416 aa4.77□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 SVOPLQ8N434 492 aa4.77□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 CBR4Q8N4T8 237 aa4.77□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 LINC00471Q8N535 108 aa4.77□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 TMEM99Q8N816 258 aa4.77□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 AQP11Q8NBQ7 271 aa4.77□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 OR10G2Q8NGC3 310 aa4.77□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 OR9Q2Q8NGE9 314 aa4.77□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 OR2V1Q8NHB1 315 aa4.77□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 MFSD8Q8NHS3 518 aa4.77□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 PIGXQ8TBF5 258 aa4.77□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 ROBO4Q8WZ75 1007 aa4.77□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 HIST1H2ACQ93077 130 aa4.77□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 BPIFA2Q96DR5 249 aa4.77□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 SGTBQ96EQ0 304 aa4.77□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 DTNBP1Q96EV8 351 aa4.77□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 NRBF2Q96F24 287 aa4.77□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 GPR137Q96N19 417 aa4.77□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 CIB1Q99828 191 aa4.77□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 TMEM43Q9BTV4 400 aa4.77□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 ZNF426Q9BUY5 554 aa4.77□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 PTDSS2Q9BVG9 487 aa4.77□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 TAPBPLQ9BX59 468 aa4.77□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 UCK2Q9BZX2 261 aa4.77□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 KLHL4Q9C0H6 718 aa4.77□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 ANKRD19PQ9H560 264 aa4.77□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa4.77□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP4.77□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 TAS2R5Q9NYW4 299 aa4.77□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 OAZ3Q9UMX2 235 aa4.77□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 RCE1Q9Y256 329 aa4.77□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 TRAPPC4Q9Y296 219 aa4.77□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 EPG5Q9HCE0 2579 aa4.77□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 FRYQ5TBA9 3013 aa4.77□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa4.76□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 HTR3EA5X5Y0 456 aa4.76□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 OR14I1A6ND48 311 aa4.76□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 GJE1A6NN92 205 aa4.76□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 ENO4A6NNW6 628 aa4.76□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 A8MZ25 164 aa4.76□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 FTCDNL1E5RQL4 147 aa4.76□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 PLPP3O14495 311 aa4.76□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 SOCS2O14508 198 aa4.76□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 CDC42EP2O14613 210 aa4.76□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 OR7A10O76100 309 aa4.76□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 OR2C1O95371 312 aa4.76□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 AHSA1O95433 338 aa4.76□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 PRB1P04280 392 aa4.76□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 ANXA8P13928 327 aa4.76□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 ZNF17P17021 662 aa4.76□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 KLK2P20151 261 aa4.76□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 POU1F1P28069 291 aa4.76□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 PPIFP30405 207 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 GRPRP30550 384 aa4.76□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 UQCRC1P31930 480 aa4.76□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 IDUAP35475 653 aa4.76□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 AQP2P41181 271 aa4.76□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 GPR4P46093 362 aa4.76□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 DIO1P49895 249 aa4.76□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 ZNF134P52741 427 aa4.76□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 CTBP2P56545 445 aa4.76□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 NUP107P57740 925 aa4.76□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 RAC3P60763 192 aa4.76□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 SLC35A1P78382 337 aa4.76□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 COX10Q12887 443 aa4.76□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 SELENBP1Q13228 472 aa4.76□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 IGFBP7Q16270 282 aa4.76□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 INAQ16352 499 aa4.76□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 ZNF74Q16587 644 aa4.76□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 RFX4Q33E94 735 aa4.76□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 ZBED5Q49AG3 693 aa4.76□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 SYT14P1Q58G82 188 aa4.76□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.5 ms