RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516230.1

RNU6-287P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 287, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-287P, Length 98 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-287P-201ENST00000516230 F8P00451 2351 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-287P-201ENST00000516230 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-287P-201ENST00000516230 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-287P-201ENST00000516230 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-287P-201ENST00000516230 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-287P-201ENST00000516230 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-287P-201ENST00000516230 ARHGEF37A1IGU5 675 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-287P-201ENST00000516230 TMEM89A2RUT3 159 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-287P-201ENST00000516230 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa-0.5□□□□□ -2.49
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RNU6-287P-201ENST00000516230 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa-0.5□□□□□ -2.49
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RNU6-287P-201ENST00000516230 HIP1O00291 1037 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-287P-201ENST00000516230 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-287P-201ENST00000516230 PSCAO43653 123 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-287P-201ENST00000516230 ZBTB14O43829 449 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-287P-201ENST00000516230 STAMBPO95630 424 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-287P-201ENST00000516230 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-287P-201ENST00000516230 IGLV3-25P01717 112 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-287P-201ENST00000516230 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP-0.5□□□□□ -2.49
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RNU6-287P-201ENST00000516230 PAICSP22234 425 aaKnown RBP-0.5□□□□□ -2.49
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RNU6-287P-201ENST00000516230 PPP5CP53041 499 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-287P-201ENST00000516230 HSD17B7P56937 341 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-287P-201ENST00000516230 TAS2R31P59538 309 aa-0.5□□□□□ -2.49
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RNU6-287P-201ENST00000516230 KRT83P78385 493 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-287P-201ENST00000516230 PLCXD2Q0VAA5 305 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-287P-201ENST00000516230 SPP2Q13103 211 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-287P-201ENST00000516230 AQP6Q13520 282 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-287P-201ENST00000516230 CUL1Q13616 776 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-287P-201ENST00000516230 RGNQ15493 299 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-287P-201ENST00000516230 ZSWIM7Q19AV6 140 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-287P-201ENST00000516230 ADPRMQ3LIE5 342 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-287P-201ENST00000516230 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP-0.5□□□□□ -2.49
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RNU6-287P-201ENST00000516230 GPRC6AQ5T6X5 926 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-287P-201ENST00000516230 AFTPHQ6ULP2 937 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-287P-201ENST00000516230 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-287P-201ENST00000516230 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-287P-201ENST00000516230 C16orf62Q7Z3J2 963 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-287P-201ENST00000516230 LHFPL3Q86UP9 236 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-287P-201ENST00000516230 VPS36Q86VN1 386 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-287P-201ENST00000516230 SLC26A11Q86WA9 606 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-287P-201ENST00000516230 PLA2G4DQ86XP0 818 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-287P-201ENST00000516230 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP-0.5□□□□□ -2.49
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RNU6-287P-201ENST00000516230 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP-0.5□□□□□ -2.49
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RNU6-287P-201ENST00000516230 ACBD4Q8NC06 268 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-287P-201ENST00000516230 B3GNT7Q8NFL0 401 aa-0.5□□□□□ -2.49
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RNU6-287P-201ENST00000516230 TTLQ8NG68 377 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-287P-201ENST00000516230 OR5D13Q8NGL4 314 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-287P-201ENST00000516230 OR4K13Q8NH42 304 aa-0.5□□□□□ -2.49
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RNU6-287P-201ENST00000516230 SEC22AQ96IW7 307 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-287P-201ENST00000516230 ITCHQ96J02 903 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-287P-201ENST00000516230 ZNF488Q96MN9 340 aa-0.5□□□□□ -2.49
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RNU6-287P-201ENST00000516230 OR2V2Q96R30 315 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-287P-201ENST00000516230 PITX2Q99697 317 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-287P-201ENST00000516230 NABP2Q9BQ15 211 aa-0.5□□□□□ -2.49
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RNU6-287P-201ENST00000516230 METTL7AQ9H8H3 244 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-287P-201ENST00000516230 LINC00574Q9H8X3 128 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-287P-201ENST00000516230 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP-0.5□□□□□ -2.49
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RNU6-287P-201ENST00000516230 ZNF302Q9NR11 478 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-287P-201ENST00000516230 NUDT15Q9NV35 164 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-287P-201ENST00000516230 LINC00846Q9NV44 126 aa-0.5□□□□□ -2.49
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RNU6-287P-201ENST00000516230 HYOU1Q9Y4L1 999 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-287P-201ENST00000516230 OARD1Q9Y530 152 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-287P-201ENST00000516230 CRB1P82279 1406 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-287P-201ENST00000516230 DMXL1Q9Y485 3027 aa-0.51□□□□□ -2.49
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RNU6-287P-201ENST00000516230 FAM74A7A6NL05 159 aa-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-287P-201ENST00000516230 WASHC1A8K0Z3 465 aa-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-287P-201ENST00000516230 TTI1O43156 1089 aa-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-287P-201ENST00000516230 ZSCAN12O43309 604 aa-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-287P-201ENST00000516230 CHST10O43529 356 aa-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-287P-201ENST00000516230 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-287P-201ENST00000516230 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP-0.51□□□□□ -2.49
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