RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511207.5

CCNH-209, Transcript of cyclin H, human

TSL 2

Gene CCNH, Length 451 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CCNH-209	ENST00000511207	SUPT3H	B4E1H0	165 aa		2.54	□□□□□ -2
CCNH-209	ENST00000511207	EIF3H	O15372	352 aa	Known RBP eCLIP	2.54	□□□□□ -2
CCNH-209	ENST00000511207	HDAC3	O15379	428 aa		2.54	□□□□□ -2
CCNH-209	ENST00000511207	EIF4E2	O60573	245 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
CCNH-209	ENST00000511207	SUPT7L	O94864	414 aa		2.54	□□□□□ -2
CCNH-209	ENST00000511207	CLIC3	O95833	236 aa		2.54	□□□□□ -2
CCNH-209	ENST00000511207	LY6G6D	O95868	133 aa		2.54	□□□□□ -2
CCNH-209	ENST00000511207	PLEK	P08567	350 aa	Predicted RBP	2.54	□□□□□ -2
CCNH-209	ENST00000511207	GKN3P	P0CG01	181 aa		2.54	□□□□□ -2
CCNH-209	ENST00000511207	SMIM10L1	P0DMW3	83 aa		2.54	□□□□□ -2
CCNH-209	ENST00000511207	HTR1E	P28566	365 aa		2.54	□□□□□ -2
CCNH-209	ENST00000511207	AQP2	P41181	271 aa		2.54	□□□□□ -2
CCNH-209	ENST00000511207	RPS5	P46782	204 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
CCNH-209	ENST00000511207	PRPS1	P60891	318 aa		2.54	□□□□□ -2
CCNH-209	ENST00000511207	SELENBP1	Q13228	472 aa		2.54	□□□□□ -2
CCNH-209	ENST00000511207	ITIH4	Q14624	930 aa		2.54	□□□□□ -2
CCNH-209	ENST00000511207	CLINT1	Q14677	625 aa		2.54	□□□□□ -2
CCNH-209	ENST00000511207	SF3A2	Q15428	464 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
CCNH-209	ENST00000511207	HADH	Q16836	314 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
CCNH-209	ENST00000511207	CAVIN4	Q5BKX8	364 aa		2.54	□□□□□ -2
CCNH-209	ENST00000511207	FHL5	Q5TD97	284 aa		2.54	□□□□□ -2
CCNH-209	ENST00000511207	PLCXD3	Q63HM9	321 aa		2.54	□□□□□ -2
CCNH-209	ENST00000511207	ANKRD26P1	Q6NSI1	321 aa		2.54	□□□□□ -2
CCNH-209	ENST00000511207	CNIH2	Q6PI25	160 aa		2.54	□□□□□ -2
CCNH-209	ENST00000511207	OR52K1	Q8NGK4	314 aa		2.54	□□□□□ -2
CCNH-209	ENST00000511207	OR2G3	Q8NGZ4	309 aa		2.54	□□□□□ -2
CCNH-209	ENST00000511207	SMIM10	Q96HG1	83 aa		2.54	□□□□□ -2
CCNH-209	ENST00000511207	PKNOX2	Q96KN3	472 aa		2.54	□□□□□ -2
CCNH-209	ENST00000511207	PRRC1	Q96M27	445 aa		2.54	□□□□□ -2
CCNH-209	ENST00000511207	OPALIN	Q96PE5	141 aa		2.54	□□□□□ -2
CCNH-209	ENST00000511207	ECSIT	Q9BQ95	431 aa		2.54	□□□□□ -2
CCNH-209	ENST00000511207	OSBPL10	Q9BXB5	764 aa		2.54	□□□□□ -2
CCNH-209	ENST00000511207	CLSTN2	Q9H4D0	955 aa		2.54	□□□□□ -2
CCNH-209	ENST00000511207	CCL28	Q9NRJ3	127 aa		2.54	□□□□□ -2
CCNH-209	ENST00000511207	PDP1	Q9P0J1	537 aa	Predicted RBP	2.54	□□□□□ -2
CCNH-209	ENST00000511207	MTRF1L	Q9UGC7	380 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
CCNH-209	ENST00000511207	ING4	Q9UNL4	249 aa		2.54	□□□□□ -2
CCNH-209	ENST00000511207	SLC17A4	Q9Y2C5	497 aa		2.54	□□□□□ -2
CCNH-209	ENST00000511207	ZNF256	Q9Y2P7	627 aa	Predicted RBP	2.54	□□□□□ -2
CCNH-209	ENST00000511207	GOLT1B	Q9Y3E0	138 aa		2.54	□□□□□ -2
CCNH-209	ENST00000511207	AGRN	O00468	2067 aa		2.54	□□□□□ -2
CCNH-209	ENST00000511207	MAPK8IP3	Q9UPT6	1336 aa		2.53	□□□□□ -2
CCNH-209	ENST00000511207	IGKV1D-13	A0A0B4J2D9	117 aa		2.53	□□□□□ -2
CCNH-209	ENST00000511207	GLYATL1P3	A0A0U1RQE8	302 aa		2.53	□□□□□ -2
CCNH-209	ENST00000511207	LYRM9	A8MSI8	78 aa		2.53	□□□□□ -2
CCNH-209	ENST00000511207	PEX7	O00628	323 aa		2.53	□□□□□ -2
CCNH-209	ENST00000511207	TRDMT1	O14717	391 aa	Known RBP	2.53	□□□□□ -2
CCNH-209	ENST00000511207	PPP1R2P9	O14990	202 aa		2.53	□□□□□ -2
CCNH-209	ENST00000511207	C6orf47	O95873	294 aa		2.53	□□□□□ -2
CCNH-209	ENST00000511207	IGKV3-15	P01624	115 aa		2.53	□□□□□ -2
CCNH-209	ENST00000511207	POLR2M	P0CAP2	368 aa		2.53	□□□□□ -2
CCNH-209	ENST00000511207	IGHV3-43D	P0DP04	118 aa		2.53	□□□□□ -2
CCNH-209	ENST00000511207	IGKV1-13	P0DP09	117 aa		2.53	□□□□□ -2
CCNH-209	ENST00000511207	MSR1	P21757	451 aa		2.53	□□□□□ -2
CCNH-209	ENST00000511207	BCKDHB	P21953	392 aa		2.53	□□□□□ -2
CCNH-209	ENST00000511207	BTC	P35070	178 aa		2.53	□□□□□ -2
CCNH-209	ENST00000511207	SERPINB5	P36952	375 aa		2.53	□□□□□ -2
CCNH-209	ENST00000511207	TNFSF9	P41273	254 aa		2.53	□□□□□ -2
CCNH-209	ENST00000511207	CCR8	P51685	355 aa		2.53	□□□□□ -2
CCNH-209	ENST00000511207	STX17	P56962	302 aa		2.53	□□□□□ -2
CCNH-209	ENST00000511207	ECH1	Q13011	328 aa		2.53	□□□□□ -2
CCNH-209	ENST00000511207	AQP6	Q13520	282 aa		2.53	□□□□□ -2
CCNH-209	ENST00000511207	DOC2A	Q14183	400 aa		2.53	□□□□□ -2
CCNH-209	ENST00000511207	FZD2	Q14332	565 aa		2.53	□□□□□ -2
CCNH-209	ENST00000511207	IL17A	Q16552	155 aa		2.53	□□□□□ -2
CCNH-209	ENST00000511207	LRRC10	Q5BKY1	277 aa		2.53	□□□□□ -2
CCNH-209	ENST00000511207	COA6	Q5JTJ3	125 aa	Known RBP	2.53	□□□□□ -2
CCNH-209	ENST00000511207	PPM1L	Q5SGD2	360 aa		2.53	□□□□□ -2
CCNH-209	ENST00000511207	ZNF544	Q6NX49	715 aa		2.53	□□□□□ -2
CCNH-209	ENST00000511207	SPESP1	Q6UW49	350 aa		2.53	□□□□□ -2
CCNH-209	ENST00000511207	IL34	Q6ZMJ4	242 aa		2.53	□□□□□ -2
CCNH-209	ENST00000511207	HDDC2	Q7Z4H3	204 aa		2.53	□□□□□ -2
CCNH-209	ENST00000511207	RALGPS2	Q86X27	583 aa	Predicted RBP	2.53	□□□□□ -2
CCNH-209	ENST00000511207	APRG1	Q8IVJ8	170 aa		2.53	□□□□□ -2
CCNH-209	ENST00000511207	CMTM1	Q8IZ96	169 aa		2.53	□□□□□ -2
CCNH-209	ENST00000511207	C11orf42	Q8N5U0	333 aa		2.53	□□□□□ -2
CCNH-209	ENST00000511207	C8orf31	Q8N9H6	132 aa		2.53	□□□□□ -2
CCNH-209	ENST00000511207	C20orf203	Q8NBC4	194 aa		2.53	□□□□□ -2
CCNH-209	ENST00000511207	HSD17B11	Q8NBQ5	300 aa		2.53	□□□□□ -2
CCNH-209	ENST00000511207	OR4F15	Q8NGB8	312 aa		2.53	□□□□□ -2
CCNH-209	ENST00000511207	OR10R2	Q8NGX6	335 aa		2.53	□□□□□ -2
CCNH-209	ENST00000511207	SLC7A13	Q8TCU3	470 aa		2.53	□□□□□ -2
CCNH-209	ENST00000511207	MCOLN3	Q8TDD5	553 aa		2.53	□□□□□ -2
CCNH-209	ENST00000511207	GPX8	Q8TED1	209 aa		2.53	□□□□□ -2
CCNH-209	ENST00000511207	FAM151A	Q8WW52	585 aa		2.53	□□□□□ -2
CCNH-209	ENST00000511207	NDRG1	Q92597	394 aa	Known RBP	2.53	□□□□□ -2
CCNH-209	ENST00000511207	MED8	Q96G25	268 aa		2.53	□□□□□ -2
CCNH-209	ENST00000511207	IMMP1L	Q96LU5	166 aa		2.53	□□□□□ -2
CCNH-209	ENST00000511207	JSRP1	Q96MG2	331 aa	Predicted RBP	2.53	□□□□□ -2
CCNH-209	ENST00000511207	BCL7B	Q9BQE9	202 aa		2.53	□□□□□ -2
CCNH-209	ENST00000511207	LZTS2	Q9BRK4	669 aa		2.53	□□□□□ -2
CCNH-209	ENST00000511207	TEKT3	Q9BXF9	490 aa		2.53	□□□□□ -2
CCNH-209	ENST00000511207	HES7	Q9BYE0	225 aa		2.53	□□□□□ -2
CCNH-209	ENST00000511207	UGT1A10	Q9HAW8	530 aa		2.53	□□□□□ -2
CCNH-209	ENST00000511207	EML4	Q9HC35	981 aa	Known RBP	2.53	□□□□□ -2
CCNH-209	ENST00000511207	LYRM4	Q9HD34	91 aa		2.53	□□□□□ -2
CCNH-209	ENST00000511207	MMP26	Q9NRE1	261 aa		2.53	□□□□□ -2
CCNH-209	ENST00000511207	HRASLS2	Q9NWW9	162 aa		2.53	□□□□□ -2
CCNH-209	ENST00000511207	CCDC59	Q9P031	241 aa	Known RBP	2.53	□□□□□ -2
CCNH-209	ENST00000511207	SAR1B	Q9Y6B6	198 aa		2.53	□□□□□ -2

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