RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496574.6

PKD1-222, Transcript of polycystin 1, transient receptor potential channel interacting, human

TSL 5

Gene PKD1, Length 4,419 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PKD1-222	ENST00000496574	MRPL41	Q8IXM3	137 aa	Known RBP	13	□□□□□ -0.33
PKD1-222	ENST00000496574	OR1J2	Q8NGS2	313 aa		13	□□□□□ -0.33
PKD1-222	ENST00000496574	KCNG3	Q8TAE7	436 aa		13	□□□□□ -0.33
PKD1-222	ENST00000496574	SENP5	Q96HI0	755 aa	Predicted RBP	13	□□□□□ -0.33
PKD1-222	ENST00000496574	APOO	Q9BUR5	198 aa		13	□□□□□ -0.33
PKD1-222	ENST00000496574	RNF32	Q9H0A6	362 aa		13	□□□□□ -0.33
PKD1-222	ENST00000496574	NELFA	Q9H3P2	528 aa		13	□□□□□ -0.33
PKD1-222	ENST00000496574	DUSP22	Q9NRW4	184 aa		13	□□□□□ -0.33
PKD1-222	ENST00000496574	STARD5	Q9NSY2	213 aa		13	□□□□□ -0.33
PKD1-222	ENST00000496574	MARCH5	Q9NX47	278 aa		13	□□□□□ -0.33
PKD1-222	ENST00000496574	REV1	Q9UBZ9	1251 aa		13	□□□□□ -0.33
PKD1-222	ENST00000496574	NSA2	O95478	260 aa	Known RBP	13	□□□□□ -0.33
PKD1-222	ENST00000496574	PMP2	P02689	132 aa		13	□□□□□ -0.33
PKD1-222	ENST00000496574	CTSA	P10619	480 aa		13	□□□□□ -0.33
PKD1-222	ENST00000496574	PVR	P15151	417 aa		13	□□□□□ -0.33
PKD1-222	ENST00000496574	GABRR1	P24046	479 aa		13	□□□□□ -0.33
PKD1-222	ENST00000496574	BSG	P35613	385 aa		13	□□□□□ -0.33
PKD1-222	ENST00000496574	MFGE8	Q08431	387 aa	Predicted RBP	13	□□□□□ -0.33
PKD1-222	ENST00000496574	RTL6	Q6ICC9	239 aa		13	□□□□□ -0.33
PKD1-222	ENST00000496574	TANGO2	Q6ICL3	276 aa		13	□□□□□ -0.33
PKD1-222	ENST00000496574	TMEM71	Q6P5X7	295 aa		13	□□□□□ -0.33
PKD1-222	ENST00000496574	STAC2	Q6ZMT1	411 aa		13	□□□□□ -0.33
PKD1-222	ENST00000496574	ZNF761	Q86XN6	746 aa	Predicted RBP	13	□□□□□ -0.33
PKD1-222	ENST00000496574	SLC39A11	Q8N1S5	342 aa		13	□□□□□ -0.33
PKD1-222	ENST00000496574	TMEM156	Q8N614	296 aa		13	□□□□□ -0.33
PKD1-222	ENST00000496574	TGM7	Q96PF1	710 aa		13	□□□□□ -0.33
PKD1-222	ENST00000496574	EXOSC3	Q9NQT5	275 aa	Known RBP	13	□□□□□ -0.33
PKD1-222	ENST00000496574	EMC9	Q9Y3B6	208 aa		13	□□□□□ -0.33
PKD1-222	ENST00000496574	PEX12	O00623	359 aa		13	□□□□□ -0.33
PKD1-222	ENST00000496574	ITGB2	P05107	769 aa		13	□□□□□ -0.33
PKD1-222	ENST00000496574	RD3L	P0DJH9	198 aa		13	□□□□□ -0.33
PKD1-222	ENST00000496574	ZNF43	P17038	809 aa		13	□□□□□ -0.33
PKD1-222	ENST00000496574	SERPINF1	P36955	418 aa		13	□□□□□ -0.33
PKD1-222	ENST00000496574	B4GALNT1	Q00973	533 aa		13	□□□□□ -0.33
PKD1-222	ENST00000496574	ZNF425	Q6IV72	752 aa		13	□□□□□ -0.33
PKD1-222	ENST00000496574	CMTM1	Q8IZ96	169 aa		13	□□□□□ -0.33
PKD1-222	ENST00000496574	SLC22A24	Q8N4F4	322 aa		13	□□□□□ -0.33
PKD1-222	ENST00000496574	SPIC	Q8N5J4	248 aa		13	□□□□□ -0.33
PKD1-222	ENST00000496574	NKAIN3	Q8N8D7	197 aa		13	□□□□□ -0.33
PKD1-222	ENST00000496574	CHAC2	Q8WUX2	184 aa		13	□□□□□ -0.33
PKD1-222	ENST00000496574	BORCS8	Q96FH0	119 aa		13	□□□□□ -0.33
PKD1-222	ENST00000496574	OCSTAMP	Q9BR26	566 aa		13	□□□□□ -0.33
PKD1-222	ENST00000496574	PARP12	Q9H0J9	701 aa	Known RBP	13	□□□□□ -0.33
PKD1-222	ENST00000496574	EXOSC5	Q9NQT4	235 aa	Known RBP eCLIP	13	□□□□□ -0.33
PKD1-222	ENST00000496574	CLDND1	Q9NY35	253 aa		13	□□□□□ -0.33
PKD1-222	ENST00000496574	ZMAT5	Q9UDW3	170 aa	Known RBP	13	□□□□□ -0.33
PKD1-222	ENST00000496574	MSRA	Q9UJ68	235 aa		13	□□□□□ -0.33
PKD1-222	ENST00000496574	TMEM235	A6NFC5	223 aa		12.99	□□□□□ -0.33
PKD1-222	ENST00000496574		F5H5K5	113 aa		12.99	□□□□□ -0.33
PKD1-222	ENST00000496574	ZNF264	O43296	627 aa		12.99	□□□□□ -0.33
PKD1-222	ENST00000496574	TAGLN2	P37802	199 aa	Known RBP	12.99	□□□□□ -0.33
PKD1-222	ENST00000496574	SNU13	P55769	128 aa	Known RBP	12.99	□□□□□ -0.33
PKD1-222	ENST00000496574	GPNMB	Q14956	572 aa		12.99	□□□□□ -0.33
PKD1-222	ENST00000496574	PLPP5	Q8NEB5	264 aa		12.99	□□□□□ -0.33
PKD1-222	ENST00000496574	MS4A6E	Q96DS6	147 aa		12.99	□□□□□ -0.33
PKD1-222	ENST00000496574	SPACA1	Q9HBV2	294 aa		12.99	□□□□□ -0.33
PKD1-222	ENST00000496574	VSX1	Q9NZR4	365 aa	Predicted RBP	12.99	□□□□□ -0.33
PKD1-222	ENST00000496574	ELF5	Q9UKW6	265 aa	Predicted RBP	12.99	□□□□□ -0.33
PKD1-222	ENST00000496574		H3BML4	177 aa		12.99	□□□□□ -0.33
PKD1-222	ENST00000496574	MAN2B1	O00754	1011 aa		12.99	□□□□□ -0.33
PKD1-222	ENST00000496574	CBX7	O95931	251 aa		12.99	□□□□□ -0.33
PKD1-222	ENST00000496574	OR7A5	Q15622	319 aa		12.99	□□□□□ -0.33
PKD1-222	ENST00000496574	MPEG1	Q2M385	716 aa		12.99	□□□□□ -0.33
PKD1-222	ENST00000496574	LGALSL	Q3ZCW2	172 aa	Predicted RBP	12.99	□□□□□ -0.33
PKD1-222	ENST00000496574	ZNF542P	Q5EBM4	170 aa		12.99	□□□□□ -0.33
PKD1-222	ENST00000496574	GALNT16	Q8N428	558 aa		12.99	□□□□□ -0.33
PKD1-222	ENST00000496574	OR4D6	Q8NGJ1	314 aa		12.99	□□□□□ -0.33
PKD1-222	ENST00000496574	OR1S1	Q8NH92	325 aa		12.99	□□□□□ -0.33
PKD1-222	ENST00000496574	KLHDC7B	Q96G42	594 aa		12.99	□□□□□ -0.33
PKD1-222	ENST00000496574	C1QTNF6	Q9BXI9	259 aa		12.99	□□□□□ -0.33
PKD1-222	ENST00000496574	ZNF160	Q9HCG1	818 aa		12.99	□□□□□ -0.33
PKD1-222	ENST00000496574	ZBTB32	Q9Y2Y4	487 aa	Predicted RBP	12.99	□□□□□ -0.33
PKD1-222	ENST00000496574	FER1L6	Q2WGJ9	1857 aa		12.99	□□□□□ -0.33
PKD1-222	ENST00000496574		H0YGG7	62 aa		12.99	□□□□□ -0.33
PKD1-222	ENST00000496574	TMEM127	O75204	238 aa		12.99	□□□□□ -0.33
PKD1-222	ENST00000496574	SERPINE2	P07093	398 aa		12.99	□□□□□ -0.33
PKD1-222	ENST00000496574	RAE1	P78406	368 aa	Known RBP	12.99	□□□□□ -0.33
PKD1-222	ENST00000496574	PMPCA	Q10713	525 aa		12.99	□□□□□ -0.33
PKD1-222	ENST00000496574	FAM160A2	Q8N612	972 aa	Predicted RBP	12.99	□□□□□ -0.33
PKD1-222	ENST00000496574	BPIFC	Q8NFQ6	507 aa		12.99	□□□□□ -0.33
PKD1-222	ENST00000496574	LMX1A	Q8TE12	382 aa		12.99	□□□□□ -0.33
PKD1-222	ENST00000496574	WBP2	Q969T9	261 aa		12.99	□□□□□ -0.33
PKD1-222	ENST00000496574	LRFN5	Q96NI6	719 aa		12.99	□□□□□ -0.33
PKD1-222	ENST00000496574	SLC52A3	Q9NQ40	469 aa		12.99	□□□□□ -0.33
PKD1-222	ENST00000496574	PCDHB10	Q9UN67	800 aa		12.99	□□□□□ -0.33
PKD1-222	ENST00000496574	PCYT1B	Q9Y5K3	369 aa	Predicted RBP	12.99	□□□□□ -0.33
PKD1-222	ENST00000496574	URGCP-MRPS24	S4R325	110 aa		12.99	□□□□□ -0.33
PKD1-222	ENST00000496574	NRAP	Q86VF7	1730 aa		12.99	□□□□□ -0.33
PKD1-222	ENST00000496574	TNRC6C	Q9HCJ0	1690 aa	Known RBP	12.99	□□□□□ -0.33
PKD1-222	ENST00000496574	TNFSF12-TNFSF13	A0A0A6YY99	330 aa		12.99	□□□□□ -0.33
PKD1-222	ENST00000496574	TNFSF12	O43508	249 aa		12.99	□□□□□ -0.33
PKD1-222	ENST00000496574	DOK2	O60496	412 aa		12.99	□□□□□ -0.33
PKD1-222	ENST00000496574	OR13C7	P0DN81	318 aa		12.99	□□□□□ -0.33
PKD1-222	ENST00000496574	SERPINA2	P20848	420 aa		12.99	□□□□□ -0.33
PKD1-222	ENST00000496574	CSF2RB	P32927	897 aa		12.99	□□□□□ -0.33
PKD1-222	ENST00000496574	RAB13	P51153	203 aa		12.99	□□□□□ -0.33
PKD1-222	ENST00000496574	PCBP3	P57721	371 aa	Known RBP	12.99	□□□□□ -0.33
PKD1-222	ENST00000496574	HHEX	Q03014	270 aa		12.99	□□□□□ -0.33
PKD1-222	ENST00000496574	OR11H7	Q8NGC8	314 aa		12.99	□□□□□ -0.33
PKD1-222	ENST00000496574	DDIT4L	Q96D03	193 aa		12.99	□□□□□ -0.33

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