RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489344.5

RBM3-208, Transcript of RNA binding motif protein 3, human

TSL 2

Gene RBM3, Length 724 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM3-208	ENST00000489344	ZC3H12D	A2A288	527 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
RBM3-208	ENST00000489344	CHP2	O43745	196 aa		11.94	□□□□□ -0.5
RBM3-208	ENST00000489344	THY1	P04216	161 aa		11.94	□□□□□ -0.5
RBM3-208	ENST00000489344	ATP6V1B2	P21281	511 aa		11.94	□□□□□ -0.5
RBM3-208	ENST00000489344	YAP1	P46937	504 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
RBM3-208	ENST00000489344	SLC16A1	P53985	500 aa		11.94	□□□□□ -0.5
RBM3-208	ENST00000489344	TAS2R41	P59536	307 aa		11.94	□□□□□ -0.5
RBM3-208	ENST00000489344	PIN1	Q13526	163 aa	Predicted RBP	11.94	□□□□□ -0.5
RBM3-208	ENST00000489344	SWT1	Q5T5J6	900 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
RBM3-208	ENST00000489344	TSPO2	Q5TGU0	170 aa		11.94	□□□□□ -0.5
RBM3-208	ENST00000489344	LINC00114	Q6XXX2	140 aa		11.94	□□□□□ -0.5
RBM3-208	ENST00000489344	ASRGL1	Q7L266	308 aa		11.94	□□□□□ -0.5
RBM3-208	ENST00000489344	TSPYL5	Q86VY4	417 aa	Predicted RBP	11.94	□□□□□ -0.5
RBM3-208	ENST00000489344	STK35	Q8TDR2	534 aa		11.94	□□□□□ -0.5
RBM3-208	ENST00000489344	MRPL24	Q96A35	216 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
RBM3-208	ENST00000489344	SLC41A3	Q96GZ6	507 aa		11.94	□□□□□ -0.5
RBM3-208	ENST00000489344	LRGUK	Q96M69	825 aa		11.94	□□□□□ -0.5
RBM3-208	ENST00000489344	KATNB1	Q9BVA0	655 aa		11.94	□□□□□ -0.5
RBM3-208	ENST00000489344	DYNLRB1	Q9NP97	96 aa		11.94	□□□□□ -0.5
RBM3-208	ENST00000489344	RIMS3	Q9UJD0	308 aa		11.94	□□□□□ -0.5
RBM3-208	ENST00000489344	SLC7A7	Q9UM01	511 aa		11.94	□□□□□ -0.5
RBM3-208	ENST00000489344	POMP	Q9Y244	141 aa		11.94	□□□□□ -0.5
RBM3-208	ENST00000489344	TRAPPC4	Q9Y296	219 aa		11.94	□□□□□ -0.5
RBM3-208	ENST00000489344		V9GYQ6	96 aa		11.94	□□□□□ -0.5
RBM3-208	ENST00000489344	TCRBV5S2	A0A599	114 aa		11.93	□□□□□ -0.5
RBM3-208	ENST00000489344		J3KTA2	159 aa		11.93	□□□□□ -0.5
RBM3-208	ENST00000489344	OR5F1	O95221	314 aa		11.93	□□□□□ -0.5
RBM3-208	ENST00000489344	LYPD3	O95274	346 aa		11.93	□□□□□ -0.5
RBM3-208	ENST00000489344	PMS2P2	O95744	297 aa		11.93	□□□□□ -0.5
RBM3-208	ENST00000489344	MSMB	P08118	114 aa		11.93	□□□□□ -0.5
RBM3-208	ENST00000489344	MPG	P29372	298 aa		11.93	□□□□□ -0.5
RBM3-208	ENST00000489344	IFNA8	P32881	189 aa		11.93	□□□□□ -0.5
RBM3-208	ENST00000489344	IL1RL1	Q01638	556 aa		11.93	□□□□□ -0.5
RBM3-208	ENST00000489344	EGR4	Q05215	589 aa		11.93	□□□□□ -0.5
RBM3-208	ENST00000489344	GABPB1	Q06547	395 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
RBM3-208	ENST00000489344	C1QTNF12	Q5T7M4	302 aa		11.93	□□□□□ -0.5
RBM3-208	ENST00000489344	FAHD2B	Q6P2I3	314 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
RBM3-208	ENST00000489344	TSEN54	Q7Z6J9	526 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
RBM3-208	ENST00000489344	LSR	Q86X29	649 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
RBM3-208	ENST00000489344	LRRC17	Q8N6Y2	441 aa		11.93	□□□□□ -0.5
RBM3-208	ENST00000489344	CLDND2	Q8NHS1	167 aa		11.93	□□□□□ -0.5
RBM3-208	ENST00000489344	POP5	Q969H6	163 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
RBM3-208	ENST00000489344	FAHD2A	Q96GK7	314 aa		11.93	□□□□□ -0.5
RBM3-208	ENST00000489344	C7orf34	Q96L11	122 aa		11.93	□□□□□ -0.5
RBM3-208	ENST00000489344	PRRC1	Q96M27	445 aa		11.93	□□□□□ -0.5
RBM3-208	ENST00000489344	SUCNR1	Q9BXA5	334 aa		11.93	□□□□□ -0.5
RBM3-208	ENST00000489344	PARPBP	Q9NWS1	579 aa		11.93	□□□□□ -0.5
RBM3-208	ENST00000489344	SLC7A8	Q9UHI5	535 aa		11.93	□□□□□ -0.5
RBM3-208	ENST00000489344	FBXO9	Q9UK97	447 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
RBM3-208	ENST00000489344	A4GNT	Q9UNA3	340 aa		11.93	□□□□□ -0.5
RBM3-208	ENST00000489344	FAM32A	Q9Y421	112 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
RBM3-208	ENST00000489344	ENPP4	Q9Y6X5	453 aa		11.93	□□□□□ -0.5
RBM3-208	ENST00000489344	WNK1	Q9H4A3	2382 aa		11.93	□□□□□ -0.5
RBM3-208	ENST00000489344	LOC105371242	A0A075B767	164 aa		11.92	□□□□□ -0.5
RBM3-208	ENST00000489344	NPIPB7	O75200	414 aa		11.92	□□□□□ -0.5
RBM3-208	ENST00000489344	SEMG1	P04279	462 aa		11.92	□□□□□ -0.5
RBM3-208	ENST00000489344	THRB	P10828	461 aa		11.92	□□□□□ -0.5
RBM3-208	ENST00000489344	IMPDH2	P12268	514 aa		11.92	□□□□□ -0.5
RBM3-208	ENST00000489344	RHCE	P18577	417 aa		11.92	□□□□□ -0.5
RBM3-208	ENST00000489344	OR2B6	P58173	313 aa		11.92	□□□□□ -0.5
RBM3-208	ENST00000489344	NAAA	Q02083	359 aa		11.92	□□□□□ -0.5
RBM3-208	ENST00000489344	ST3GAL3	Q11203	375 aa		11.92	□□□□□ -0.5
RBM3-208	ENST00000489344	C1orf140	Q5VVS0	124 aa		11.92	□□□□□ -0.5
RBM3-208	ENST00000489344	TTC33	Q6PID6	262 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
RBM3-208	ENST00000489344	C5orf46	Q6UWT4	87 aa		11.92	□□□□□ -0.5
RBM3-208	ENST00000489344	CYP4Z1	Q86W10	505 aa		11.92	□□□□□ -0.5
RBM3-208	ENST00000489344	MPP4	Q96JB8	637 aa		11.92	□□□□□ -0.5
RBM3-208	ENST00000489344	SEPHS2	Q99611	448 aa		11.92	□□□□□ -0.5
RBM3-208	ENST00000489344	DOK1	Q99704	481 aa		11.92	□□□□□ -0.5
RBM3-208	ENST00000489344	SLC6A7	Q99884	636 aa		11.92	□□□□□ -0.5
RBM3-208	ENST00000489344	PRSS27	Q9BQR3	290 aa		11.92	□□□□□ -0.5
RBM3-208	ENST00000489344	FNDC11	Q9BVV2	318 aa		11.92	□□□□□ -0.5
RBM3-208	ENST00000489344	TRIM15	Q9C019	465 aa		11.92	□□□□□ -0.5
RBM3-208	ENST00000489344	TPK1	Q9H3S4	243 aa		11.92	□□□□□ -0.5
RBM3-208	ENST00000489344	ESM1	Q9NQ30	184 aa		11.92	□□□□□ -0.5
RBM3-208	ENST00000489344	NDUFAF4	Q9P032	175 aa		11.92	□□□□□ -0.5
RBM3-208	ENST00000489344	FLVCR1	Q9Y5Y0	555 aa		11.92	□□□□□ -0.5
RBM3-208	ENST00000489344	IGKV1D-42	A0A075B6H8	117 aa		11.91	□□□□□ -0.5
RBM3-208	ENST00000489344	AQP12B	A6NM10	295 aa		11.91	□□□□□ -0.5
RBM3-208	ENST00000489344	FFAR1	O14842	300 aa		11.91	□□□□□ -0.5
RBM3-208	ENST00000489344	OR2T1	O43869	369 aa		11.91	□□□□□ -0.5
RBM3-208	ENST00000489344	AHSA1	O95433	338 aa		11.91	□□□□□ -0.5
RBM3-208	ENST00000489344	GPI	P06744	558 aa		11.91	□□□□□ -0.5
RBM3-208	ENST00000489344	ADRA2A	P08913	450 aa		11.91	□□□□□ -0.5
RBM3-208	ENST00000489344	CECR9	P0C854	216 aa		11.91	□□□□□ -0.5
RBM3-208	ENST00000489344	SAG	P10523	405 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
RBM3-208	ENST00000489344	NPR2	P20594	1047 aa		11.91	□□□□□ -0.5
RBM3-208	ENST00000489344	CALCR	P30988	508 aa		11.91	□□□□□ -0.5
RBM3-208	ENST00000489344	THBS4	P35443	961 aa		11.91	□□□□□ -0.5
RBM3-208	ENST00000489344	GPR6	P46095	362 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
RBM3-208	ENST00000489344	RPS5	P46782	204 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
RBM3-208	ENST00000489344	TUBA1B	P68363	451 aa		11.91	□□□□□ -0.5
RBM3-208	ENST00000489344	TUBA4A	P68366	448 aa		11.91	□□□□□ -0.5
RBM3-208	ENST00000489344	SLC35A1	P78382	337 aa		11.91	□□□□□ -0.5
RBM3-208	ENST00000489344	FOXL1	Q12952	345 aa		11.91	□□□□□ -0.5
RBM3-208	ENST00000489344	FLOT2	Q14254	428 aa		11.91	□□□□□ -0.5
RBM3-208	ENST00000489344	TBRG1	Q3YBR2	411 aa		11.91	□□□□□ -0.5
RBM3-208	ENST00000489344	ANKRD16	Q6P6B7	361 aa		11.91	□□□□□ -0.5
RBM3-208	ENST00000489344	WDR88	Q6ZMY6	472 aa		11.91	□□□□□ -0.5
RBM3-208	ENST00000489344	C1orf229	Q6ZS94	237 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5

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