RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488157.5

NISCH-210, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 4

Gene NISCH, Length 590 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-210ENST00000488157 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP10.57□□□□□ -0.72
NISCH-210ENST00000488157 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP10.57□□□□□ -0.72
NISCH-210ENST00000488157 OR2T5Q6IEZ7 315 aa10.57□□□□□ -0.72
NISCH-210ENST00000488157 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP10.57□□□□□ -0.72
NISCH-210ENST00000488157 C1orf94Q6P1W5 598 aa10.57□□□□□ -0.72
NISCH-210ENST00000488157 B3GLCTQ6Y288 498 aa10.57□□□□□ -0.72
NISCH-210ENST00000488157 FAM122BQ7Z309 247 aa10.57□□□□□ -0.72
NISCH-210ENST00000488157 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa10.57□□□□□ -0.72
NISCH-210ENST00000488157 MDP1Q86V88 176 aa10.57□□□□□ -0.72
NISCH-210ENST00000488157 SKA3Q8IX90 412 aa10.57□□□□□ -0.72
NISCH-210ENST00000488157 OR2T29Q8NH02 315 aa10.57□□□□□ -0.72
NISCH-210ENST00000488157 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP10.57□□□□□ -0.72
NISCH-210ENST00000488157 NSMAFQ92636 917 aa10.57□□□□□ -0.72
NISCH-210ENST00000488157 RASD2Q96D21 266 aa10.57□□□□□ -0.72
NISCH-210ENST00000488157 KCNK17Q96T54 332 aa10.57□□□□□ -0.72
NISCH-210ENST00000488157 SH3GL3Q99963 347 aa10.57□□□□□ -0.72
NISCH-210ENST00000488157 TMCC3Q9ULS5 477 aa10.57□□□□□ -0.72
NISCH-210ENST00000488157 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa10.56□□□□□ -0.72
NISCH-210ENST00000488157 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa10.56□□□□□ -0.72
NISCH-210ENST00000488157 NPIPB13A6NJU9 1138 aa10.56□□□□□ -0.72
NISCH-210ENST00000488157 NPIPB4C9JG80 1138 aa10.56□□□□□ -0.72
NISCH-210ENST00000488157 HS3ST1O14792 307 aa10.56□□□□□ -0.72
NISCH-210ENST00000488157 ARHGEF9O43307 516 aa10.56□□□□□ -0.72
NISCH-210ENST00000488157 ATP5HO75947 161 aa10.56□□□□□ -0.72
NISCH-210ENST00000488157 KRT36O76013 467 aa10.56□□□□□ -0.72
NISCH-210ENST00000488157 NDUFB2O95178 105 aa10.56□□□□□ -0.72
NISCH-210ENST00000488157 STAMBPO95630 424 aa10.56□□□□□ -0.72
NISCH-210ENST00000488157 PPP1R3DO95685 299 aa10.56□□□□□ -0.72
NISCH-210ENST00000488157 WNT11O96014 354 aa10.56□□□□□ -0.72
NISCH-210ENST00000488157 GASTP01350 101 aa10.56□□□□□ -0.72
NISCH-210ENST00000488157 CD14P08571 375 aa10.56□□□□□ -0.72
NISCH-210ENST00000488157 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP10.56□□□□□ -0.72
NISCH-210ENST00000488157 CECR9P0C854 216 aa10.56□□□□□ -0.72
NISCH-210ENST00000488157 CD79AP11912 226 aa10.56□□□□□ -0.72
NISCH-210ENST00000488157 CAPZA2P47755 286 aa10.56□□□□□ -0.72
NISCH-210ENST00000488157 CD47Q08722 323 aa10.56□□□□□ -0.72
NISCH-210ENST00000488157 KEAP1Q14145 624 aa10.56□□□□□ -0.72
NISCH-210ENST00000488157 ETFDHQ16134 617 aa10.56□□□□□ -0.72
NISCH-210ENST00000488157 ANKDD1AQ495B1 522 aa10.56□□□□□ -0.72
NISCH-210ENST00000488157 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP10.56□□□□□ -0.72
NISCH-210ENST00000488157 MESTQ5EB52 335 aa10.56□□□□□ -0.72
NISCH-210ENST00000488157 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa10.56□□□□□ -0.72
NISCH-210ENST00000488157 KLHL17Q6TDP4 642 aa10.56□□□□□ -0.72
NISCH-210ENST00000488157 TMEM108Q6UXF1 575 aa10.56□□□□□ -0.72
NISCH-210ENST00000488157 ZNF627Q7L945 461 aa10.56□□□□□ -0.72
NISCH-210ENST00000488157 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa10.56□□□□□ -0.72
NISCH-210ENST00000488157 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa10.56□□□□□ -0.72
NISCH-210ENST00000488157 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP10.56□□□□□ -0.72
NISCH-210ENST00000488157 MS4A3Q96HJ5 214 aa10.56□□□□□ -0.72
NISCH-210ENST00000488157 SAMD8Q96LT4 415 aa10.56□□□□□ -0.72
NISCH-210ENST00000488157 ZNF75AQ96N20 296 aa10.56□□□□□ -0.72
NISCH-210ENST00000488157 TRIM15Q9C019 465 aa10.56□□□□□ -0.72
NISCH-210ENST00000488157 LRMDAQ9H2I8 198 aa10.56□□□□□ -0.72
NISCH-210ENST00000488157 EGLN3Q9H6Z9 239 aa10.56□□□□□ -0.72
NISCH-210ENST00000488157 NRIP3Q9NQ35 241 aa10.56□□□□□ -0.72
NISCH-210ENST00000488157 TMEM38BQ9NVV0 291 aa10.56□□□□□ -0.72
NISCH-210ENST00000488157 B3GNT2Q9NY97 397 aa10.56□□□□□ -0.72
NISCH-210ENST00000488157 MOKQ9UQ07 419 aa10.56□□□□□ -0.72
NISCH-210ENST00000488157 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP10.56□□□□□ -0.72
NISCH-210ENST00000488157 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa10.56□□□□□ -0.72
NISCH-210ENST00000488157 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa10.56□□□□□ -0.72
NISCH-210ENST00000488157 E7EQL1 145 aa10.55□□□□□ -0.72
NISCH-210ENST00000488157 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa10.55□□□□□ -0.72
NISCH-210ENST00000488157 SOCS2O14508 198 aa10.55□□□□□ -0.72
NISCH-210ENST00000488157 FKBP6O75344 327 aa10.55□□□□□ -0.72
NISCH-210ENST00000488157 CCNB2O95067 398 aa10.55□□□□□ -0.72
NISCH-210ENST00000488157 CST1P01037 141 aa10.55□□□□□ -0.72
NISCH-210ENST00000488157 IGLV1-44P01699 117 aa10.55□□□□□ -0.72
NISCH-210ENST00000488157 SCG5P05408 212 aa10.55□□□□□ -0.72
NISCH-210ENST00000488157 SOD3P08294 240 aa10.55□□□□□ -0.72
NISCH-210ENST00000488157 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP10.55□□□□□ -0.72
NISCH-210ENST00000488157 CBR1P16152 277 aa10.55□□□□□ -0.72
NISCH-210ENST00000488157 DNASE1P24855 282 aa10.55□□□□□ -0.72
NISCH-210ENST00000488157 FPR3P25089 353 aa10.55□□□□□ -0.72
NISCH-210ENST00000488157 PTAFRP25105 342 aa10.55□□□□□ -0.72
NISCH-210ENST00000488157 CALCRP30988 508 aa10.55□□□□□ -0.72
NISCH-210ENST00000488157 RASSF2P50749 326 aa10.55□□□□□ -0.72
NISCH-210ENST00000488157 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP10.55□□□□□ -0.72
NISCH-210ENST00000488157 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP10.55□□□□□ -0.72
NISCH-210ENST00000488157 NPRL3Q12980 569 aa10.55□□□□□ -0.72
NISCH-210ENST00000488157 TSPAN31Q12999 210 aa10.55□□□□□ -0.72
NISCH-210ENST00000488157 TAF11Q15544 211 aa10.55□□□□□ -0.72
NISCH-210ENST00000488157 PGGHGQ32M88 737 aa10.55□□□□□ -0.72
NISCH-210ENST00000488157 RFX4Q33E94 735 aa10.55□□□□□ -0.72
NISCH-210ENST00000488157 OTPQ5XKR4 325 aa10.55□□□□□ -0.72
NISCH-210ENST00000488157 SMARCD3Q6STE5 483 aa10.55□□□□□ -0.72
NISCH-210ENST00000488157 SLC22A25Q6T423 547 aa10.55□□□□□ -0.72
NISCH-210ENST00000488157 PTCHD4Q6ZW05 846 aa10.55□□□□□ -0.72
NISCH-210ENST00000488157 ASRGL1Q7L266 308 aa10.55□□□□□ -0.72
NISCH-210ENST00000488157 HS3ST5Q8IZT8 346 aa10.55□□□□□ -0.72
NISCH-210ENST00000488157 SLC22A24Q8N4F4 322 aa10.55□□□□□ -0.72
NISCH-210ENST00000488157 FANK1Q8TC84 345 aa10.55□□□□□ -0.72
NISCH-210ENST00000488157 IGFBPL1Q8WX77 278 aa10.55□□□□□ -0.72
NISCH-210ENST00000488157 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP10.55□□□□□ -0.72
NISCH-210ENST00000488157 RADILQ96JH8 1075 aa10.55□□□□□ -0.72
NISCH-210ENST00000488157 FOXN4Q96NZ1 517 aa10.55□□□□□ -0.72
NISCH-210ENST00000488157 SLC38A2Q96QD8 506 aa10.55□□□□□ -0.72
NISCH-210ENST00000488157 OR52D1Q9H346 318 aa10.55□□□□□ -0.72
NISCH-210ENST00000488157 REEP1Q9H902 201 aa10.55□□□□□ -0.72
NISCH-210ENST00000488157 OBP2BQ9NPH6 170 aa10.55□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.3 ms