RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486810.5

COPS3-209, Transcript of COP9 signalosome subunit 3, humanhuman

TSL 3

Gene COPS3, Length 938 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS3-209ENST00000486810 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa4.9□□□□□ -1.63
COPS3-209ENST00000486810 BICRAQ9NZM4 1560 aa4.9□□□□□ -1.63
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COPS3-209ENST00000486810 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
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COPS3-209ENST00000486810 SEC14L6B5MCN3 397 aa4.89□□□□□ -1.63
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COPS3-209ENST00000486810 I3L1I5 382 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
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COPS3-209ENST00000486810 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP4.89□□□□□ -1.63
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COPS3-209ENST00000486810 PLA2G7Q13093 441 aa4.89□□□□□ -1.63
COPS3-209ENST00000486810 PDZK1IP1Q13113 114 aa4.89□□□□□ -1.63
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COPS3-209ENST00000486810 C5orf47Q569G3 176 aa4.89□□□□□ -1.63
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COPS3-209ENST00000486810 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
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COPS3-209ENST00000486810 AHSPQ9NZD4 102 aa4.89□□□□□ -1.63
COPS3-209ENST00000486810 ADA2Q9NZK5 511 aa4.89□□□□□ -1.63
COPS3-209ENST00000486810 HCN3Q9P1Z3 774 aa4.89□□□□□ -1.63
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COPS3-209ENST00000486810 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
COPS3-209ENST00000486810 TFR2Q9UP52 801 aa4.89□□□□□ -1.63
COPS3-209ENST00000486810 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP4.89□□□□□ -1.63
COPS3-209ENST00000486810 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa4.89□□□□□ -1.63
COPS3-209ENST00000486810 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
COPS3-209ENST00000486810 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa4.89□□□□□ -1.63
COPS3-209ENST00000486810 ARL5AQ9Y689 179 aa4.89□□□□□ -1.63
COPS3-209ENST00000486810 CEP170Q5SW79 1584 aa4.89□□□□□ -1.63
COPS3-209ENST00000486810 MYOM1P52179 1685 aa4.89□□□□□ -1.63
COPS3-209ENST00000486810 A0A087WUJ7 227 aa4.88□□□□□ -1.63
COPS3-209ENST00000486810 A0A0A0MQY5 61 aa4.88□□□□□ -1.63
COPS3-209ENST00000486810 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa4.88□□□□□ -1.63
COPS3-209ENST00000486810 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa4.88□□□□□ -1.63
COPS3-209ENST00000486810 TMEM213A2RRL7 107 aa4.88□□□□□ -1.63
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