RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486404.5

CHMP3-208, Transcript of charged multivesicular body protein 3, human

TSL 3

Gene CHMP3, Length 650 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CHMP3-208	ENST00000486404	CD47	Q08722	323 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CHMP3-208	ENST00000486404	DAG1	Q14118	895 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CHMP3-208	ENST00000486404	ADIPOQ	Q15848	244 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CHMP3-208	ENST00000486404	GKAP1	Q5VSY0	366 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
CHMP3-208	ENST00000486404	KRT80	Q6KB66	452 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CHMP3-208	ENST00000486404	TMEM53	Q6P2H8	277 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CHMP3-208	ENST00000486404	NHLRC1	Q6VVB1	395 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CHMP3-208	ENST00000486404	RRM2B	Q7LG56	351 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CHMP3-208	ENST00000486404	PIWIL3	Q7Z3Z3	882 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
CHMP3-208	ENST00000486404	CDK20	Q8IZL9	346 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CHMP3-208	ENST00000486404	SLC22A24	Q8N4F4	322 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CHMP3-208	ENST00000486404	RNF148	Q8N7C7	305 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CHMP3-208	ENST00000486404	SYT14	Q8NB59	555 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CHMP3-208	ENST00000486404	MOSPD2	Q8NHP6	518 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CHMP3-208	ENST00000486404	LRRC37B	Q96QE4	947 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CHMP3-208	ENST00000486404	REG4	Q9BYZ8	158 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CHMP3-208	ENST00000486404	DENND2D	Q9H6A0	471 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
CHMP3-208	ENST00000486404	ZNF442	Q9H7R0	627 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CHMP3-208	ENST00000486404	NOX3	Q9HBY0	568 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CHMP3-208	ENST00000486404	DYNLRB1	Q9NP97	96 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CHMP3-208	ENST00000486404	TMEM38B	Q9NVV0	291 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CHMP3-208	ENST00000486404	NDE1	Q9NXR1	346 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CHMP3-208	ENST00000486404	FBXO9	Q9UK97	447 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
CHMP3-208	ENST00000486404	SNX13	Q9Y5W8	968 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CHMP3-208	ENST00000486404	TRAV27	A0A087WT01	109 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CHMP3-208	ENST00000486404	EFCAB9	A8MZ26	197 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CHMP3-208	ENST00000486404	hCG_2039718	K7EN88	272 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CHMP3-208	ENST00000486404	ACADS	P16219	412 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CHMP3-208	ENST00000486404	TCN1	P20061	433 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
CHMP3-208	ENST00000486404	NPR2	P20594	1047 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CHMP3-208	ENST00000486404	EFNA4	P52798	201 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CHMP3-208	ENST00000486404	RPS23	P62266	143 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
CHMP3-208	ENST00000486404	RAB1A	P62820	205 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CHMP3-208	ENST00000486404	TAF11	Q15544	211 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CHMP3-208	ENST00000486404	SLC36A2	Q495M3	483 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CHMP3-208	ENST00000486404	FGD3	Q5JSP0	725 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CHMP3-208	ENST00000486404	FAM205BP	Q63HN1	556 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CHMP3-208	ENST00000486404	C16orf89	Q6UX73	402 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CHMP3-208	ENST00000486404	DPPA2	Q7Z7J5	298 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CHMP3-208	ENST00000486404	OAF	Q86UD1	273 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CHMP3-208	ENST00000486404	ZNF525	Q8N782	197 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CHMP3-208	ENST00000486404	MAPK1IP1L	Q8NDC0	245 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CHMP3-208	ENST00000486404	RBM15B	Q8NDT2	890 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
CHMP3-208	ENST00000486404	OR4K5	Q8NGD3	323 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CHMP3-208	ENST00000486404	OR13C2	Q8NGS9	318 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CHMP3-208	ENST00000486404	LIPH	Q8WWY8	451 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CHMP3-208	ENST00000486404	ACOT11	Q8WXI4	607 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
CHMP3-208	ENST00000486404	FAM168A	Q92567	244 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CHMP3-208	ENST00000486404	ZNF347	Q96SE7	839 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CHMP3-208	ENST00000486404	VRK1	Q99986	396 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
CHMP3-208	ENST00000486404	PLK3	Q9H4B4	646 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CHMP3-208	ENST00000486404	RNF121	Q9H920	327 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CHMP3-208	ENST00000486404	KRCC1	Q9NPI7	259 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
CHMP3-208	ENST00000486404	MAN2C1	Q9NTJ4	1040 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CHMP3-208	ENST00000486404	B3GNT2	Q9NY97	397 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CHMP3-208	ENST00000486404	TAGLN3	Q9UI15	199 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CHMP3-208	ENST00000486404	MAGEL2	Q9UJ55	1249 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CHMP3-208	ENST00000486404	TMEM5	Q9Y2B1	443 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CHMP3-208	ENST00000486404	HIF3A	Q9Y2N7	669 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CHMP3-208	ENST00000486404	ENPP4	Q9Y6X5	453 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CHMP3-208	ENST00000486404		V9GYQ6	96 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CHMP3-208	ENST00000486404	ZAN	Q9Y493	2812 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CHMP3-208	ENST00000486404	HIVEP2	P31629	2446 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CHMP3-208	ENST00000486404	NPIPB13	A6NJU9	1138 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CHMP3-208	ENST00000486404	NPIPB4	C9JG80	1138 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CHMP3-208	ENST00000486404	TRMU	O75648	421 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
CHMP3-208	ENST00000486404	H1F0	P07305	194 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
CHMP3-208	ENST00000486404	ZNF14	P17017	642 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
CHMP3-208	ENST00000486404	PCSK6	P29122	969 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CHMP3-208	ENST00000486404	THBS4	P35443	961 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CHMP3-208	ENST00000486404	RPL4	P36578	427 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
CHMP3-208	ENST00000486404	GPR4	P46093	362 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CHMP3-208	ENST00000486404	SLC9A3	P48764	834 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CHMP3-208	ENST00000486404	PPOX	P50336	477 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CHMP3-208	ENST00000486404	PRKCD	Q05655	676 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CHMP3-208	ENST00000486404	RUNX1T1	Q06455	604 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CHMP3-208	ENST00000486404	RAB39A	Q14964	217 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CHMP3-208	ENST00000486404	KRT72	Q14CN4	511 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CHMP3-208	ENST00000486404	EFNB3	Q15768	340 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CHMP3-208	ENST00000486404	CARTPT	Q16568	116 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CHMP3-208	ENST00000486404	ANKDD1A	Q495B1	522 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CHMP3-208	ENST00000486404	SAMD4B	Q5PRF9	694 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
CHMP3-208	ENST00000486404	GLYAT	Q6IB77	296 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CHMP3-208	ENST00000486404	LRFN4	Q6PJG9	635 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CHMP3-208	ENST00000486404	MBOAT2	Q6ZWT7	520 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CHMP3-208	ENST00000486404	SLC16A14	Q7RTX9	510 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CHMP3-208	ENST00000486404	IGFN1	Q86VF2	1251 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CHMP3-208	ENST00000486404	MEX3D	Q86XN8	651 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
CHMP3-208	ENST00000486404	SKA3	Q8IX90	412 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CHMP3-208	ENST00000486404	RNF113B	Q8IZP6	322 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
CHMP3-208	ENST00000486404	PGAM4	Q8N0Y7	254 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CHMP3-208	ENST00000486404	SVOPL	Q8N434	492 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CHMP3-208	ENST00000486404	OR51A7	Q8NH64	312 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CHMP3-208	ENST00000486404	MCHR2	Q969V1	340 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CHMP3-208	ENST00000486404	POM121	Q96HA1	1249 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CHMP3-208	ENST00000486404	SH3GL3	Q99963	347 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CHMP3-208	ENST00000486404	KCNN2	Q9H2S1	579 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CHMP3-208	ENST00000486404	TXNIP	Q9H3M7	391 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CHMP3-208	ENST00000486404	ANKRD19P	Q9H560	264 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CHMP3-208	ENST00000486404	ZNF224	Q9NZL3	707 aa		11.16	□□□□□ -0.62

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