RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476635.5

PRKCI-202, Transcript of protein kinase C iota, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRKCI, Length 3,650 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCI-202ENST00000476635 RNF133Q8WVZ7 376 aa5.74□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 PELI1Q96FA3 418 aa5.74□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 TSC22D3Q99576 134 aa5.74□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 OR11A1Q9GZK7 315 aa5.74□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 TAS2R16Q9NYV7 291 aa5.74□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 B4GALT7Q9UBV7 327 aa5.74□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa5.74□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 COPS3Q9UNS2 423 aa5.74□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa5.74□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 A0A0J9YW62 118 aa5.74□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 PRR32B1ATL7 298 aa5.74□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 ZNF814B7Z6K7 855 aa5.74□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa5.74□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 DCTN6O00399 190 aa5.74□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 EFSO43281 561 aa5.74□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 CD79BP40259 229 aa5.74□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 TSTQ16762 297 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 SSX6Q7RTT6 188 aa5.74□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 CDH26Q8IXH8 852 aa5.74□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 OR4K13Q8NH42 304 aa5.74□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 S100ZQ8WXG8 99 aa5.74□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 SRXN1Q9BYN0 137 aa5.74□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 MOB1AQ9H8S9 216 aa5.74□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 STMN3Q9NZ72 180 aa5.74□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 DKKL1Q9UK85 242 aa5.74□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 KCNMB2Q9Y691 235 aa5.74□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 SERPINA3P01011 423 aa5.73□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 RAF1P04049 648 aa5.73□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 HLA-DPB1P04440 258 aa5.73□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 CLUP10909 449 aa5.73□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 APEX1P27695 318 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 OPRL1P41146 370 aa5.73□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 MNDAP41218 407 aa5.73□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 CCR4P51679 360 aa5.73□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 TLE3Q04726 772 aa5.73□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP5.73□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 DGUOKQ16854 277 aa5.73□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 PDSS1Q5T2R2 415 aa5.73□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 LHFPL3Q86UP9 236 aa5.73□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 UEVLDQ8IX04 471 aa5.73□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 TMEM178AQ8NBL3 297 aa5.73□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 OR9K2Q8NGE7 335 aa5.73□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 INTS14Q96SY0 518 aa5.73□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 CDADC1Q9BWV3 514 aa5.73□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 MED20Q9H944 212 aa5.73□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 GLRX2Q9NS18 164 aa5.73□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 FAM86C1Q9NVL1 165 aa5.73□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 TUBD1Q9UJT1 453 aa5.73□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa5.73□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 A0A0G2JK05 382 aa5.73□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 IGHG1P01857 330 aa5.73□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 RFPL3SP0C7P2 107 aa5.73□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 PSMB9P28065 219 aa5.73□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 OR7A5Q15622 319 aa5.73□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP5.73□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 Q6ZS92 163 aa5.73□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 CATSPERDQ86XM0 798 aa5.73□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 IL17RDQ8NFM7 739 aa5.73□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP5.73□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 PHOX2BQ99453 314 aa5.73□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 TTYH2Q9BSA4 534 aa5.73□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 MRI1Q9BV20 369 aa5.73□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 NIPAL2Q9H841 368 aa5.73□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP5.73□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 FAM183AA6NL82 134 aa5.73□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 AKR7A3O95154 331 aa5.73□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 TACSTD2P09758 323 aa5.73□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 HLA-DOBP13765 273 aa5.73□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 CD46P15529 392 aa5.73□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 CTLA4P16410 223 aa5.73□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 LAP3P28838 519 aa5.73□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 CD40LGP29965 261 aa5.73□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 RPL4P36578 427 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 MLLT10P55197 1068 aa5.73□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 PRSS45Q7RTY3 260 aa5.73□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 DPPA2Q7Z7J5 298 aa5.73□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 CCDC190Q86UF4 302 aa5.73□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 GLB1L2Q8IW92 636 aa5.73□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 TMEM251Q8N6I4 163 aa5.73□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 PLPP7Q8NBV4 271 aa5.73□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 NEIL3Q8TAT5 605 aa5.73□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 NDNFQ8TB73 568 aa5.73□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa5.73□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa5.73□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 A0A1W2PPW3 197 aa5.72□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 DAPL1A0PJW8 107 aa5.72□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa5.72□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19 ms