RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473406.5

RABGGTB-209, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 721 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-209ENST00000473406 IL26Q9NPH9 171 aa4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF302Q9NR11 478 aa4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-209ENST00000473406 CTSFQ9UBX1 484 aa4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-209ENST00000473406 CD300AQ9UGN4 299 aa4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-209ENST00000473406 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-209ENST00000473406 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa4.68□□□□□ -1.66
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RABGGTB-209ENST00000473406 K7N7A8 449 aa4.67□□□□□ -1.66
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RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF229Q9UJW7 825 aa4.67□□□□□ -1.66
RABGGTB-209ENST00000473406 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa4.67□□□□□ -1.66
RABGGTB-209ENST00000473406 PCSK5Q92824 1860 aa4.66□□□□□ -1.66
RABGGTB-209ENST00000473406 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa4.66□□□□□ -1.66
RABGGTB-209ENST00000473406 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa4.66□□□□□ -1.66
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RABGGTB-209ENST00000473406 H7C0C1 242 aa4.66□□□□□ -1.66
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RABGGTB-209ENST00000473406 XRCC2O43543 280 aa4.66□□□□□ -1.66
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RABGGTB-209ENST00000473406 HBE1P02100 147 aa4.66□□□□□ -1.66
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RABGGTB-209ENST00000473406 DUX4L5P0CJ88 424 aa4.66□□□□□ -1.66
RABGGTB-209ENST00000473406 DUX4L6P0CJ89 424 aa4.66□□□□□ -1.66
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RABGGTB-209ENST00000473406 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP4.66□□□□□ -1.66
RABGGTB-209ENST00000473406 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa4.66□□□□□ -1.66
RABGGTB-209ENST00000473406 NDUFAF7Q7L592 441 aa4.66□□□□□ -1.66
RABGGTB-209ENST00000473406 TMEM135Q86UB9 458 aa4.66□□□□□ -1.66
RABGGTB-209ENST00000473406 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa4.66□□□□□ -1.66
RABGGTB-209ENST00000473406 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa4.66□□□□□ -1.66
RABGGTB-209ENST00000473406 OR10G3Q8NGC4 313 aa4.66□□□□□ -1.66
RABGGTB-209ENST00000473406 CLHC1Q8NHS4 586 aa4.66□□□□□ -1.66
RABGGTB-209ENST00000473406 SPATA3Q8NHX4 192 aa4.66□□□□□ -1.66
RABGGTB-209ENST00000473406 TRIM51Q9BSJ1 452 aa4.66□□□□□ -1.66
RABGGTB-209ENST00000473406 C20orf85Q9H1P6 137 aa4.66□□□□□ -1.66
RABGGTB-209ENST00000473406 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
RABGGTB-209ENST00000473406 SCRT2Q9NQ03 307 aa4.66□□□□□ -1.66
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RABGGTB-209ENST00000473406 DUX4Q9UBX2 424 aa4.66□□□□□ -1.66
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RABGGTB-209ENST00000473406 GNPTGQ9UJJ9 305 aa4.66□□□□□ -1.66
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RABGGTB-209ENST00000473406 LYRM9A8MSI8 78 aa4.65□□□□□ -1.67
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RABGGTB-209ENST00000473406 PLPP1O14494 284 aa4.65□□□□□ -1.67
RABGGTB-209ENST00000473406 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
RABGGTB-209ENST00000473406 TBL1XO60907 577 aa4.65□□□□□ -1.67
RABGGTB-209ENST00000473406 KLK1P06870 262 aa4.65□□□□□ -1.67
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RABGGTB-209ENST00000473406 CSKP41240 450 aa4.65□□□□□ -1.67
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RABGGTB-209ENST00000473406 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP4.65□□□□□ -1.67
RABGGTB-209ENST00000473406 CXCL6P80162 114 aa4.65□□□□□ -1.67
RABGGTB-209ENST00000473406 SP4Q02446 784 aa4.65□□□□□ -1.67
RABGGTB-209ENST00000473406 TRDNQ13061 729 aa4.65□□□□□ -1.67
RABGGTB-209ENST00000473406 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
RABGGTB-209ENST00000473406 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
RABGGTB-209ENST00000473406 C18orf65Q6ZTR6 163 aa4.65□□□□□ -1.67
RABGGTB-209ENST00000473406 PID1Q7Z2X4 250 aa4.65□□□□□ -1.67
RABGGTB-209ENST00000473406 C6orf223Q8N319 242 aa4.65□□□□□ -1.67
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