RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472326.2

SGCE-210, Transcript of sarcoglycan epsilon, humanhuman

TSL 2

Gene SGCE, Length 453 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCE-210ENST00000472326 C10orf35Q96D05 121 aa3.57□□□□□ -1.84
SGCE-210ENST00000472326 PDXPQ96GD0 296 aa3.57□□□□□ -1.84
SGCE-210ENST00000472326 COQ2Q96H96 371 aa3.57□□□□□ -1.84
SGCE-210ENST00000472326 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
SGCE-210ENST00000472326 OR8B4Q96RC9 309 aa3.57□□□□□ -1.84
SGCE-210ENST00000472326 COPS8Q99627 209 aa3.57□□□□□ -1.84
SGCE-210ENST00000472326 CHAC1Q9BUX1 264 aa3.57□□□□□ -1.84
SGCE-210ENST00000472326 PPA2Q9H2U2 334 aa3.57□□□□□ -1.84
SGCE-210ENST00000472326 ADAM28Q9UKQ2 775 aa3.57□□□□□ -1.84
SGCE-210ENST00000472326 WIZO95785 1651 aa3.56□□□□□ -1.84
SGCE-210ENST00000472326 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
SGCE-210ENST00000472326 LTBP4Q8N2S1 1624 aa3.56□□□□□ -1.84
SGCE-210ENST00000472326 GLI2P10070 1586 aa3.56□□□□□ -1.84
SGCE-210ENST00000472326 YEATS2Q9ULM3 1422 aa3.56□□□□□ -1.84
SGCE-210ENST00000472326 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa3.56□□□□□ -1.84
SGCE-210ENST00000472326 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
SGCE-210ENST00000472326 ADRA2AP08913 450 aa3.56□□□□□ -1.84
SGCE-210ENST00000472326 CYB561P49447 251 aa3.56□□□□□ -1.84
SGCE-210ENST00000472326 RAP1AP62834 184 aa3.56□□□□□ -1.84
SGCE-210ENST00000472326 HES5Q5TA89 166 aa3.56□□□□□ -1.84
SGCE-210ENST00000472326 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
SGCE-210ENST00000472326 SORT1Q99523 831 aa3.56□□□□□ -1.84
SGCE-210ENST00000472326 RARRES2Q99969 163 aa3.56□□□□□ -1.84
SGCE-210ENST00000472326 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa3.56□□□□□ -1.84
SGCE-210ENST00000472326 EPS15L1Q9UBC2 864 aa3.56□□□□□ -1.84
SGCE-210ENST00000472326 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa3.56□□□□□ -1.84
SGCE-210ENST00000472326 CDH9Q9ULB4 789 aa3.56□□□□□ -1.84
SGCE-210ENST00000472326 CFAP43Q8NDM7 1665 aa3.55□□□□□ -1.84
SGCE-210ENST00000472326 GRIN2AQ12879 1464 aa3.55□□□□□ -1.84
SGCE-210ENST00000472326 PTPRTO14522 1441 aa3.55□□□□□ -1.84
SGCE-210ENST00000472326 MAGEB3O15480 346 aa3.55□□□□□ -1.84
SGCE-210ENST00000472326 MGRN1O60291 552 aa3.55□□□□□ -1.84
SGCE-210ENST00000472326 FCMRO60667 390 aa3.55□□□□□ -1.84
SGCE-210ENST00000472326 SNNO75324 88 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
SGCE-210ENST00000472326 OR7A10O76100 309 aa3.55□□□□□ -1.84
SGCE-210ENST00000472326 MAGEA8P43361 318 aa3.55□□□□□ -1.84
SGCE-210ENST00000472326 Q5W150 140 aa3.55□□□□□ -1.84
SGCE-210ENST00000472326 FBXW9Q5XUX1 488 aa3.55□□□□□ -1.84
SGCE-210ENST00000472326 OR5D13Q8NGL4 314 aa3.55□□□□□ -1.84
SGCE-210ENST00000472326 OR10G4Q8NGN3 311 aa3.55□□□□□ -1.84
SGCE-210ENST00000472326 PANX2Q96RD6 677 aa3.55□□□□□ -1.84
SGCE-210ENST00000472326 OSBPL10Q9BXB5 764 aa3.55□□□□□ -1.84
SGCE-210ENST00000472326 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
SGCE-210ENST00000472326 KIAA1257Q9ULG3 409 aa3.55□□□□□ -1.84
SGCE-210ENST00000472326 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
SGCE-210ENST00000472326 WIF1Q9Y5W5 379 aa3.55□□□□□ -1.84
SGCE-210ENST00000472326 PLB1Q6P1J6 1458 aa3.54□□□□□ -1.84
SGCE-210ENST00000472326 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
SGCE-210ENST00000472326 BCORL1Q5H9F3 1711 aa3.54□□□□□ -1.84
SGCE-210ENST00000472326 ZNF726A6NNF4 738 aa3.54□□□□□ -1.84
SGCE-210ENST00000472326 SRP72O76094 671 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
SGCE-210ENST00000472326 CLDN9O95484 217 aa3.54□□□□□ -1.84
SGCE-210ENST00000472326 C6orf47O95873 294 aa3.54□□□□□ -1.84
SGCE-210ENST00000472326 CAPN1P07384 714 aa3.54□□□□□ -1.84
SGCE-210ENST00000472326 PSMC3P17980 439 aa3.54□□□□□ -1.84
SGCE-210ENST00000472326 GDI1P31150 447 aa3.54□□□□□ -1.84
SGCE-210ENST00000472326 FDFT1P37268 417 aa3.54□□□□□ -1.84
SGCE-210ENST00000472326 PON3Q15166 354 aa3.54□□□□□ -1.84
SGCE-210ENST00000472326 ZNF493Q6ZR52 646 aa3.54□□□□□ -1.84
SGCE-210ENST00000472326 RIMKLAQ8IXN7 391 aa3.54□□□□□ -1.84
SGCE-210ENST00000472326 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
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SGCE-210ENST00000472326 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa3.54□□□□□ -1.84
SGCE-210ENST00000472326 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa3.54□□□□□ -1.84
SGCE-210ENST00000472326 ATP10AO60312 1499 aa3.54□□□□□ -1.84
SGCE-210ENST00000472326 NUP160Q12769 1436 aa3.53□□□□□ -1.84
SGCE-210ENST00000472326 IGHV2-5P01817 119 aa3.53□□□□□ -1.84
SGCE-210ENST00000472326 FGF1P05230 155 aa3.53□□□□□ -1.84
SGCE-210ENST00000472326 DESP17661 470 aa3.53□□□□□ -1.84
SGCE-210ENST00000472326 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
SGCE-210ENST00000472326 SYCNQ0VAF6 134 aa3.53□□□□□ -1.84
SGCE-210ENST00000472326 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa3.53□□□□□ -1.84
SGCE-210ENST00000472326 CHRFAM7AQ494W8 412 aa3.53□□□□□ -1.84
SGCE-210ENST00000472326 XKR4Q5GH76 650 aa3.53□□□□□ -1.84
SGCE-210ENST00000472326 CFAP157Q5JU67 520 aa3.53□□□□□ -1.84
SGCE-210ENST00000472326 ZNF880Q6PDB4 577 aa3.53□□□□□ -1.84
SGCE-210ENST00000472326 ZNF461Q8TAF7 563 aa3.53□□□□□ -1.84
SGCE-210ENST00000472326 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
SGCE-210ENST00000472326 HSFY1Q96LI6 401 aa3.53□□□□□ -1.84
SGCE-210ENST00000472326 FMO2Q99518 471 aa3.53□□□□□ -1.84
SGCE-210ENST00000472326 TMEM43Q9BTV4 400 aa3.53□□□□□ -1.84
SGCE-210ENST00000472326 NMRAL1Q9HBL8 299 aa3.53□□□□□ -1.84
SGCE-210ENST00000472326 STRCQ7RTU9 1775 aa3.53□□□□□ -1.84
SGCE-210ENST00000472326 PLA2R1Q13018 1463 aa3.53□□□□□ -1.84
SGCE-210ENST00000472326 DOCK9Q9BZ29 2069 aa3.52□□□□□ -1.85
SGCE-210ENST00000472326 C7orf66A4D0T2 115 aa3.52□□□□□ -1.85
SGCE-210ENST00000472326 GMFGO60234 142 aa3.52□□□□□ -1.85
SGCE-210ENST00000472326 DBTP11182 482 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
SGCE-210ENST00000472326 FOLR1P15328 257 aa3.52□□□□□ -1.85
SGCE-210ENST00000472326 AK4P27144 223 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
SGCE-210ENST00000472326 RORCP51449 518 aa3.52□□□□□ -1.85
SGCE-210ENST00000472326 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa3.52□□□□□ -1.85
SGCE-210ENST00000472326 ATAD3BQ5T9A4 648 aa3.52□□□□□ -1.85
SGCE-210ENST00000472326 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa3.52□□□□□ -1.85
SGCE-210ENST00000472326 UBALD2Q8IYN6 164 aa3.52□□□□□ -1.85
SGCE-210ENST00000472326 OR2G2Q8NGZ5 317 aa3.52□□□□□ -1.85
SGCE-210ENST00000472326 RMI2Q96E14 147 aa3.52□□□□□ -1.85
SGCE-210ENST00000472326 LINC00597Q9H2U6 94 aa3.52□□□□□ -1.85
SGCE-210ENST00000472326 C12orf10Q9HB07 376 aa3.52□□□□□ -1.85
SGCE-210ENST00000472326 GGA2Q9UJY4 613 aa3.52□□□□□ -1.85
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