RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468599.1

CNOT10-211, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 10, humanhuman

TSL 5

Gene CNOT10, Length 811 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT10-211ENST00000468599 IGHG1P01857 330 aa9.89□□□□□ -0.83
CNOT10-211ENST00000468599 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
CNOT10-211ENST00000468599 FASP25445 335 aa9.89□□□□□ -0.83
CNOT10-211ENST00000468599 SDHAP31040 664 aa9.89□□□□□ -0.83
CNOT10-211ENST00000468599 ACVR1BP36896 505 aa9.89□□□□□ -0.83
CNOT10-211ENST00000468599 IFNGR2P38484 337 aa9.89□□□□□ -0.83
CNOT10-211ENST00000468599 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
CNOT10-211ENST00000468599 TUBA1BP68363 451 aa9.89□□□□□ -0.83
CNOT10-211ENST00000468599 TUBA4AP68366 448 aa9.89□□□□□ -0.83
CNOT10-211ENST00000468599 ARF1P84077 181 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
CNOT10-211ENST00000468599 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
CNOT10-211ENST00000468599 RFX4Q33E94 735 aa9.89□□□□□ -0.83
CNOT10-211ENST00000468599 TBRG1Q3YBR2 411 aa9.89□□□□□ -0.83
CNOT10-211ENST00000468599 KLHL24Q6TFL4 600 aa9.89□□□□□ -0.83
CNOT10-211ENST00000468599 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa9.89□□□□□ -0.83
CNOT10-211ENST00000468599 TUBA1AQ71U36 451 aa9.89□□□□□ -0.83
CNOT10-211ENST00000468599 WFDC8Q8IUA0 241 aa9.89□□□□□ -0.83
CNOT10-211ENST00000468599 LINC00471Q8N535 108 aa9.89□□□□□ -0.83
CNOT10-211ENST00000468599 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa9.89□□□□□ -0.83
CNOT10-211ENST00000468599 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
CNOT10-211ENST00000468599 STEAP2Q8NFT2 490 aa9.89□□□□□ -0.83
CNOT10-211ENST00000468599 OR6N1Q8NGY5 312 aa9.89□□□□□ -0.83
CNOT10-211ENST00000468599 OR4Q3Q8NH05 313 aa9.89□□□□□ -0.83
CNOT10-211ENST00000468599 OR52N5Q8NH56 324 aa9.89□□□□□ -0.83
CNOT10-211ENST00000468599 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
CNOT10-211ENST00000468599 FAM222BQ8WU58 562 aa9.89□□□□□ -0.83
CNOT10-211ENST00000468599 MCHR2Q969V1 340 aa9.89□□□□□ -0.83
CNOT10-211ENST00000468599 DACH2Q96NX9 599 aa9.89□□□□□ -0.83
CNOT10-211ENST00000468599 MUS81Q96NY9 551 aa9.89□□□□□ -0.83
CNOT10-211ENST00000468599 MED18Q9BUE0 208 aa9.89□□□□□ -0.83
CNOT10-211ENST00000468599 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa9.89□□□□□ -0.83
CNOT10-211ENST00000468599 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa9.89□□□□□ -0.83
CNOT10-211ENST00000468599 NOX3Q9HBY0 568 aa9.89□□□□□ -0.83
CNOT10-211ENST00000468599 SLC17A5Q9NRA2 495 aa9.89□□□□□ -0.83
CNOT10-211ENST00000468599 ZNF224Q9NZL3 707 aa9.89□□□□□ -0.83
CNOT10-211ENST00000468599 KCNN3Q9UGI6 736 aa9.89□□□□□ -0.83
CNOT10-211ENST00000468599 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa9.89□□□□□ -0.83
CNOT10-211ENST00000468599 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa9.89□□□□□ -0.83
CNOT10-211ENST00000468599 SLC25A15Q9Y619 301 aa9.89□□□□□ -0.83
CNOT10-211ENST00000468599 A0A096LPE4 126 aa9.88□□□□□ -0.83
CNOT10-211ENST00000468599 A0A1W2PPZ6 126 aa9.88□□□□□ -0.83
CNOT10-211ENST00000468599 CIB4A0PJX0 185 aa9.88□□□□□ -0.83
CNOT10-211ENST00000468599 FAM221AA4D161 298 aa9.88□□□□□ -0.83
CNOT10-211ENST00000468599 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
CNOT10-211ENST00000468599 BHLHE40O14503 412 aa9.88□□□□□ -0.83
CNOT10-211ENST00000468599 SOCS2O14508 198 aa9.88□□□□□ -0.83
CNOT10-211ENST00000468599 KRT33AO76009 404 aa9.88□□□□□ -0.83
CNOT10-211ENST00000468599 TXNDC12O95881 172 aa9.88□□□□□ -0.83
CNOT10-211ENST00000468599 QDPRP09417 244 aa9.88□□□□□ -0.83
CNOT10-211ENST00000468599 EPXP11678 715 aa9.88□□□□□ -0.83
CNOT10-211ENST00000468599 CRYGSP22914 178 aa9.88□□□□□ -0.83
CNOT10-211ENST00000468599 SLC6A6P31641 620 aa9.88□□□□□ -0.83
CNOT10-211ENST00000468599 DAPP51397 102 aa9.88□□□□□ -0.83
CNOT10-211ENST00000468599 CLRN1P58418 232 aa9.88□□□□□ -0.83
CNOT10-211ENST00000468599 CD47Q08722 323 aa9.88□□□□□ -0.83
CNOT10-211ENST00000468599 TAF11Q15544 211 aa9.88□□□□□ -0.83
CNOT10-211ENST00000468599 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa9.88□□□□□ -0.83
CNOT10-211ENST00000468599 FAHD1Q6P587 224 aa9.88□□□□□ -0.83
CNOT10-211ENST00000468599 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa9.88□□□□□ -0.83
CNOT10-211ENST00000468599 CD300LDQ6UXZ3 194 aa9.88□□□□□ -0.83
CNOT10-211ENST00000468599 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa9.88□□□□□ -0.83
CNOT10-211ENST00000468599 IQCF1Q8N6M8 205 aa9.88□□□□□ -0.83
CNOT10-211ENST00000468599 OR5K1Q8NHB7 308 aa9.88□□□□□ -0.83
CNOT10-211ENST00000468599 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
CNOT10-211ENST00000468599 BOD1Q96IK1 185 aa9.88□□□□□ -0.83
CNOT10-211ENST00000468599 S100A14Q9HCY8 104 aa9.88□□□□□ -0.83
CNOT10-211ENST00000468599 TBC1D23Q9NUY8 699 aa9.88□□□□□ -0.83
CNOT10-211ENST00000468599 IL20Q9NYY1 176 aa9.88□□□□□ -0.83
CNOT10-211ENST00000468599 AKAP9Q99996 3911 aa9.87□□□□□ -0.83
CNOT10-211ENST00000468599 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
CNOT10-211ENST00000468599 SLC22A23A1A5C7 686 aa9.87□□□□□ -0.83
CNOT10-211ENST00000468599 SAC3D1A6NKF1 404 aa9.87□□□□□ -0.83
CNOT10-211ENST00000468599 A6NNC1 897 aa9.87□□□□□ -0.83
CNOT10-211ENST00000468599 CENPBD1B2RD01 187 aa9.87□□□□□ -0.83
CNOT10-211ENST00000468599 ARHGEF9O43307 516 aa9.87□□□□□ -0.83
CNOT10-211ENST00000468599 DHHO43323 396 aa9.87□□□□□ -0.83
CNOT10-211ENST00000468599 MITFO75030 526 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
CNOT10-211ENST00000468599 HRGP04196 525 aa9.87□□□□□ -0.83
CNOT10-211ENST00000468599 FCGR1AP12314 374 aa9.87□□□□□ -0.83
CNOT10-211ENST00000468599 APEHP13798 732 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
CNOT10-211ENST00000468599 B4GALT1P15291 398 aa9.87□□□□□ -0.83
CNOT10-211ENST00000468599 PPP3CBP16298 524 aa9.87□□□□□ -0.83
CNOT10-211ENST00000468599 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
CNOT10-211ENST00000468599 SSTR2P30874 369 aa9.87□□□□□ -0.83
CNOT10-211ENST00000468599 PEX19P40855 299 aa9.87□□□□□ -0.83
CNOT10-211ENST00000468599 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
CNOT10-211ENST00000468599 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
CNOT10-211ENST00000468599 SPOCK1Q08629 439 aa9.87□□□□□ -0.83
CNOT10-211ENST00000468599 PPA1Q15181 289 aa9.87□□□□□ -0.83
CNOT10-211ENST00000468599 SLC36A3Q495N2 470 aa9.87□□□□□ -0.83
CNOT10-211ENST00000468599 TIMM23BQ5SRD1 257 aa9.87□□□□□ -0.83
CNOT10-211ENST00000468599 C10orf128Q5T292 105 aa9.87□□□□□ -0.83
CNOT10-211ENST00000468599 FAM205BPQ63HN1 556 aa9.87□□□□□ -0.83
CNOT10-211ENST00000468599 ALKBH2Q6NS38 261 aa9.87□□□□□ -0.83
CNOT10-211ENST00000468599 ZFP1Q6P2D0 407 aa9.87□□□□□ -0.83
CNOT10-211ENST00000468599 ZNF627Q7L945 461 aa9.87□□□□□ -0.83
CNOT10-211ENST00000468599 HDDC2Q7Z4H3 204 aa9.87□□□□□ -0.83
CNOT10-211ENST00000468599 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
CNOT10-211ENST00000468599 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
CNOT10-211ENST00000468599 C17orf78Q8N4C9 275 aa9.87□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71 ms