RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467308.1

TSSC4-208, Transcript of tumor suppressing subtransferable candidate 4, human

TSL 3

Gene TSSC4, Length 409 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TSSC4-208	ENST00000467308		A0A1W2PR80	420 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TSSC4-208	ENST00000467308	SAC3D1	A6NKF1	404 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TSSC4-208	ENST00000467308	PDLIM1	O00151	329 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TSSC4-208	ENST00000467308	MRPL33	O75394	65 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
TSSC4-208	ENST00000467308	PMS2P2	O95744	297 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TSSC4-208	ENST00000467308	ITGA5	P08648	1049 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TSSC4-208	ENST00000467308	FKBP2	P26885	142 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
TSSC4-208	ENST00000467308	NTF4	P34130	210 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TSSC4-208	ENST00000467308	RYK	P34925	604 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TSSC4-208	ENST00000467308	APOBEC1	P41238	236 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
TSSC4-208	ENST00000467308	NR4A2	P43354	598 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TSSC4-208	ENST00000467308	PDLIM4	P50479	330 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TSSC4-208	ENST00000467308	MAP2K6	P52564	334 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TSSC4-208	ENST00000467308	ALG10B	Q5I7T1	473 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TSSC4-208	ENST00000467308	LPCAT4	Q643R3	524 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TSSC4-208	ENST00000467308	CBR4	Q8N4T8	237 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TSSC4-208	ENST00000467308	WDR31	Q8NA23	367 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TSSC4-208	ENST00000467308	C1orf162	Q8NEQ5	155 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
TSSC4-208	ENST00000467308	PIGX	Q8TBF5	258 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TSSC4-208	ENST00000467308	MSI2	Q96DH6	328 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
TSSC4-208	ENST00000467308	RDH12	Q96NR8	316 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TSSC4-208	ENST00000467308	RBM4B	Q9BQ04	359 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
TSSC4-208	ENST00000467308	PIMREG	Q9BSJ6	248 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TSSC4-208	ENST00000467308	RBM4	Q9BWF3	364 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
TSSC4-208	ENST00000467308	SLC19A3	Q9BZV2	496 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TSSC4-208	ENST00000467308	CHODL	Q9H9P2	273 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TSSC4-208	ENST00000467308	SELENON	Q9NZV5	590 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TSSC4-208	ENST00000467308	RHCG	Q9UBD6	479 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TSSC4-208	ENST00000467308	SLC7A7	Q9UM01	511 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TSSC4-208	ENST00000467308	HDGFL3	Q9Y3E1	203 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TSSC4-208	ENST00000467308	FKBP7	Q9Y680	259 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TSSC4-208	ENST00000467308		U3KQV3	271 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TSSC4-208	ENST00000467308		A0A087WUJ7	227 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TSSC4-208	ENST00000467308		A0A087WUU8	490 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TSSC4-208	ENST00000467308	SLC35F4	A4IF30	521 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TSSC4-208	ENST00000467308	LY6H	O94772	140 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TSSC4-208	ENST00000467308	CCNB2	O95067	398 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TSSC4-208	ENST00000467308	ALPL	P05186	524 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TSSC4-208	ENST00000467308	ANXA8	P13928	327 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TSSC4-208	ENST00000467308	FUT4	P22083	530 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TSSC4-208	ENST00000467308	IFNGR2	P38484	337 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TSSC4-208	ENST00000467308	ALDH3A2	P51648	485 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TSSC4-208	ENST00000467308	SRSF2	Q01130	221 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
TSSC4-208	ENST00000467308	DAG1	Q14118	895 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TSSC4-208	ENST00000467308	GGTLC2	Q14390	218 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TSSC4-208	ENST00000467308	SEC23B	Q15437	767 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TSSC4-208	ENST00000467308	SWI5	Q1ZZU3	235 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TSSC4-208	ENST00000467308	FGD3	Q5JSP0	725 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TSSC4-208	ENST00000467308	LIPN	Q5VXI9	398 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TSSC4-208	ENST00000467308	TBPL2	Q6SJ96	375 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TSSC4-208	ENST00000467308	CD300LD	Q6UXZ3	194 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TSSC4-208	ENST00000467308	MBOAT2	Q6ZWT7	520 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TSSC4-208	ENST00000467308	GRINA	Q7Z429	371 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TSSC4-208	ENST00000467308	CADM2	Q8N3J6	435 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TSSC4-208	ENST00000467308	OR52J3	Q8NH60	311 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TSSC4-208	ENST00000467308	ZNF563	Q8TA94	476 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TSSC4-208	ENST00000467308	SLC29A1	Q99808	456 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TSSC4-208	ENST00000467308	TMEM43	Q9BTV4	400 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TSSC4-208	ENST00000467308	DGCR6L	Q9BY27	220 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TSSC4-208	ENST00000467308	MYOZ1	Q9NP98	299 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
TSSC4-208	ENST00000467308	PDP1	Q9P0J1	537 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
TSSC4-208	ENST00000467308	CHRNA9	Q9UGM1	479 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TSSC4-208	ENST00000467308	AMDHD2	Q9Y303	409 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TSSC4-208	ENST00000467308	SOCS2	O14508	198 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TSSC4-208	ENST00000467308	TFPI	P10646	304 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TSSC4-208	ENST00000467308	APEH	P13798	732 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
TSSC4-208	ENST00000467308	CBL	P22681	906 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TSSC4-208	ENST00000467308	CLK1	P49759	484 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
TSSC4-208	ENST00000467308	POLR2H	P52434	150 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
TSSC4-208	ENST00000467308	TGFBR3	Q03167	851 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TSSC4-208	ENST00000467308	MST1L	Q2TV78	715 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TSSC4-208	ENST00000467308	RFX4	Q33E94	735 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TSSC4-208	ENST00000467308	KDM4D	Q6B0I6	523 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TSSC4-208	ENST00000467308	IL17REL	Q6ZVW7	336 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TSSC4-208	ENST00000467308	NKAIN4	Q8IVV8	208 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TSSC4-208	ENST00000467308	HS3ST5	Q8IZT8	346 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TSSC4-208	ENST00000467308	OR10G2	Q8NGC3	310 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TSSC4-208	ENST00000467308	OR4K5	Q8NGD3	323 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TSSC4-208	ENST00000467308	C1QTNF6	Q9BXI9	259 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TSSC4-208	ENST00000467308	KRCC1	Q9NPI7	259 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
TSSC4-208	ENST00000467308	SLC17A5	Q9NRA2	495 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TSSC4-208	ENST00000467308	CTPS2	Q9NRF8	586 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TSSC4-208	ENST00000467308	LOC390937	A0A1W2PQ73	354 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TSSC4-208	ENST00000467308	EI24	O14681	340 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TSSC4-208	ENST00000467308	HSPA13	P48723	471 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TSSC4-208	ENST00000467308	FOXG1	P55316	489 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
TSSC4-208	ENST00000467308	H3F3A	P84243	136 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TSSC4-208	ENST00000467308	PPP1R8	Q12972	351 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
TSSC4-208	ENST00000467308	LRRC36	Q1X8D7	754 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TSSC4-208	ENST00000467308	OTUD3	Q5T2D3	398 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
TSSC4-208	ENST00000467308	C1orf94	Q6P1W5	598 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TSSC4-208	ENST00000467308	C5orf46	Q6UWT4	87 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TSSC4-208	ENST00000467308	ZNF730	Q6ZMV8	503 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TSSC4-208	ENST00000467308	WDR88	Q6ZMY6	472 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TSSC4-208	ENST00000467308	TMEM239	Q8WW34	195 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TSSC4-208	ENST00000467308	ARL5B	Q96KC2	179 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TSSC4-208	ENST00000467308	FEV	Q99581	238 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TSSC4-208	ENST00000467308	PARPBP	Q9NWS1	579 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TSSC4-208	ENST00000467308	TMEFF2	Q9UIK5	374 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
TSSC4-208	ENST00000467308	OSGIN1	Q9UJX0	560 aa		13.7	□□□□□ -0.22

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