RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466274.1

NCL-208, Transcript of nucleolin, human

TSL 2

Gene NCL, Length 671 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NCL-208	ENST00000466274	IVD	P26440	423 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NCL-208	ENST00000466274	IER3	P46695	156 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NCL-208	ENST00000466274	CCNG1	P51959	295 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NCL-208	ENST00000466274	PRKAG1	P54619	331 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NCL-208	ENST00000466274	ALDH18A1	P54886	795 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
NCL-208	ENST00000466274	H3F3A	P84243	136 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NCL-208	ENST00000466274	ROR2	Q01974	943 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
NCL-208	ENST00000466274	DYRK1A	Q13627	763 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NCL-208	ENST00000466274	FRG1	Q14331	258 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
NCL-208	ENST00000466274	SRSF7	Q16629	238 aa	Known RBP eCLIP	4.84	□□□□□ -1.63
NCL-208	ENST00000466274	TST	Q16762	297 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
NCL-208	ENST00000466274	SGO1	Q5FBB7	561 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NCL-208	ENST00000466274	FAM219B	Q5XKK7	198 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NCL-208	ENST00000466274	STEAP4	Q687X5	459 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NCL-208	ENST00000466274	CLEC6A	Q6EIG7	209 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NCL-208	ENST00000466274	C6orf89	Q6UWU4	347 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NCL-208	ENST00000466274	GOLGA7	Q7Z5G4	137 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NCL-208	ENST00000466274	PTOV1	Q86YD1	416 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NCL-208	ENST00000466274	C1orf52	Q8N6N3	182 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
NCL-208	ENST00000466274	C11orf44	Q8N8P7	122 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NCL-208	ENST00000466274	COX18	Q8N8Q8	333 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NCL-208	ENST00000466274		Q8N9P0	234 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
NCL-208	ENST00000466274	SDR9C7	Q8NEX9	313 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NCL-208	ENST00000466274	OR9K2	Q8NGE7	335 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NCL-208	ENST00000466274	DCAKD	Q8WVC6	231 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NCL-208	ENST00000466274	IPCEF1	Q8WWN9	437 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
NCL-208	ENST00000466274	SELENOM	Q8WWX9	145 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NCL-208	ENST00000466274	DDIT4L	Q96D03	193 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NCL-208	ENST00000466274	NEURL3	Q96EH8	262 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NCL-208	ENST00000466274	C3orf30	Q96M34	536 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NCL-208	ENST00000466274	ALKBH3	Q96Q83	286 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
NCL-208	ENST00000466274	LINC00470	Q9BZP3	86 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NCL-208	ENST00000466274	MMP28	Q9H239	520 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NCL-208	ENST00000466274	RHOJ	Q9H4E5	214 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NCL-208	ENST00000466274	MIEF1	Q9NQG6	463 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NCL-208	ENST00000466274	ACER3	Q9NUN7	267 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NCL-208	ENST00000466274	ACOXL	Q9NUZ1	547 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NCL-208	ENST00000466274	TXNDC16	Q9P2K2	825 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NCL-208	ENST00000466274	MYEF2	Q9P2K5	600 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
NCL-208	ENST00000466274	VPS29	Q9UBQ0	182 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NCL-208	ENST00000466274	SNX6	Q9UNH7	406 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NCL-208	ENST00000466274	CAB39	Q9Y376	341 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
NCL-208	ENST00000466274	FAM96B	Q9Y3D0	163 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NCL-208	ENST00000466274	DTNA	Q9Y4J8	743 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NCL-208	ENST00000466274	GPR45	Q9Y5Y3	372 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NCL-208	ENST00000466274	KIR2DS1	A0A191URI9	304 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NCL-208	ENST00000466274	PLSCR5	A0PG75	271 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NCL-208	ENST00000466274	P2RY10	O00398	339 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NCL-208	ENST00000466274	ANGPTL7	O43827	346 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NCL-208	ENST00000466274	PCDH7	O60245	1069 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NCL-208	ENST00000466274	BANF1	O75531	89 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NCL-208	ENST00000466274	VAMP5	O95183	116 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NCL-208	ENST00000466274	RAB36	O95755	333 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NCL-208	ENST00000466274	IGHV2-70	P01814	119 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NCL-208	ENST00000466274	IGHV4-59	P01825	116 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NCL-208	ENST00000466274	CD79A	P11912	226 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NCL-208	ENST00000466274	MAP3K8	P41279	467 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NCL-208	ENST00000466274	MAP2K6	P52564	334 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NCL-208	ENST00000466274	ATP12A	P54707	1039 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NCL-208	ENST00000466274	POU6F2	P78424	691 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
NCL-208	ENST00000466274	ARF1	P84077	181 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
NCL-208	ENST00000466274	PFKFB4	Q16877	469 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NCL-208	ENST00000466274	GSG1	Q2KHT4	349 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NCL-208	ENST00000466274	TMEM225	Q6GV28	225 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NCL-208	ENST00000466274	SLC35E4	Q6ICL7	350 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NCL-208	ENST00000466274	RAPH1	Q70E73	1250 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NCL-208	ENST00000466274	SZRD1	Q7Z422	152 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NCL-208	ENST00000466274	ISCA2	Q86U28	154 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NCL-208	ENST00000466274	GPAT4	Q86UL3	456 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NCL-208	ENST00000466274	MYPOP	Q86VE0	399 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
NCL-208	ENST00000466274	LRRC28	Q86X40	367 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
NCL-208	ENST00000466274	ADGRG5	Q8IZF4	528 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NCL-208	ENST00000466274	MUC20	Q8N307	709 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
NCL-208	ENST00000466274	KLHDC1	Q8N7A1	406 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NCL-208	ENST00000466274	ZNF614	Q8N883	585 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NCL-208	ENST00000466274	NAT8L	Q8N9F0	302 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NCL-208	ENST00000466274	PAPD5	Q8NDF8	572 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
NCL-208	ENST00000466274	OR2T6	Q8NHC8	308 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NCL-208	ENST00000466274	ZNF563	Q8TA94	476 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NCL-208	ENST00000466274	ZNF519	Q8TB69	540 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NCL-208	ENST00000466274	CHMP6	Q96FZ7	201 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NCL-208	ENST00000466274	CFAP36	Q96G28	342 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NCL-208	ENST00000466274	UBXN10	Q96LJ8	280 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NCL-208	ENST00000466274	THUMPD3	Q9BV44	507 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
NCL-208	ENST00000466274	GLIPR2	Q9H4G4	154 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NCL-208	ENST00000466274	NOL11	Q9H8H0	719 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
NCL-208	ENST00000466274	CYSLTR2	Q9NS75	346 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NCL-208	ENST00000466274	TAS2R7	Q9NYW3	318 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NCL-208	ENST00000466274	TBK1	Q9UHD2	729 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NCL-208	ENST00000466274	SLC45A2	Q9UMX9	530 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NCL-208	ENST00000466274	PCDHGB4	Q9UN71	923 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NCL-208	ENST00000466274	CACNG2	Q9Y698	323 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NCL-208	ENST00000466274	DYNC2H1	Q8NCM8	4307 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
NCL-208	ENST00000466274	SACS	Q9NZJ4	4579 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NCL-208	ENST00000466274	IGLV3-9	A0A075B6K5	115 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NCL-208	ENST00000466274	AQP7P3	A6NL99	342 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NCL-208	ENST00000466274	RPL36A-HNRNPH2	H7BZ11	118 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NCL-208	ENST00000466274	ZNF208	O43345	1280 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NCL-208	ENST00000466274	SPRY3	O43610	288 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NCL-208	ENST00000466274	RSL1D1	O76021	490 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64

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