RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000447061.2

GAPDHP25-201, Transcript of glyceraldehyde 3 phosphate dehydrogenase pseudogene 25, humanhuman

BASIC

Gene GAPDHP25, Length 1,001 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPDHP25-201ENST00000447061 SORDQ00796 357 aa4.77□□□□□ -1.65
GAPDHP25-201ENST00000447061 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
GAPDHP25-201ENST00000447061 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
GAPDHP25-201ENST00000447061 NPRL3Q12980 569 aa4.77□□□□□ -1.65
GAPDHP25-201ENST00000447061 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
GAPDHP25-201ENST00000447061 HIST3H3Q16695 136 aa4.77□□□□□ -1.65
GAPDHP25-201ENST00000447061 PGGHGQ32M88 737 aa4.77□□□□□ -1.65
GAPDHP25-201ENST00000447061 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
GAPDHP25-201ENST00000447061 THEM4Q5T1C6 240 aa4.77□□□□□ -1.65
GAPDHP25-201ENST00000447061 C10orf128Q5T292 105 aa4.77□□□□□ -1.65
GAPDHP25-201ENST00000447061 TTC23Q5W5X9 447 aa4.77□□□□□ -1.65
GAPDHP25-201ENST00000447061 FBXW9Q5XUX1 488 aa4.77□□□□□ -1.65
GAPDHP25-201ENST00000447061 NIPAL3Q6P499 406 aa4.77□□□□□ -1.65
GAPDHP25-201ENST00000447061 DNM1P34Q6PK57 102 aa4.77□□□□□ -1.65
GAPDHP25-201ENST00000447061 CLEC18BQ6UXF7 455 aa4.77□□□□□ -1.65
GAPDHP25-201ENST00000447061 CASP12Q6UXS9 341 aa4.77□□□□□ -1.65
GAPDHP25-201ENST00000447061 ZNF627Q7L945 461 aa4.77□□□□□ -1.65
GAPDHP25-201ENST00000447061 P2RY8Q86VZ1 359 aa4.77□□□□□ -1.65
GAPDHP25-201ENST00000447061 JAZF1Q86VZ6 243 aa4.77□□□□□ -1.65
GAPDHP25-201ENST00000447061 KIF18BQ86Y91 864 aa4.77□□□□□ -1.65
GAPDHP25-201ENST00000447061 HS3ST5Q8IZT8 346 aa4.77□□□□□ -1.65
GAPDHP25-201ENST00000447061 GCNT2Q8N0V5 402 aa4.77□□□□□ -1.65
GAPDHP25-201ENST00000447061 TMEM123Q8N131 208 aa4.77□□□□□ -1.65
GAPDHP25-201ENST00000447061 C17orf78Q8N4C9 275 aa4.77□□□□□ -1.65
GAPDHP25-201ENST00000447061 RPRMLQ8N4K4 120 aa4.77□□□□□ -1.65
GAPDHP25-201ENST00000447061 FAM26EQ8N5C1 309 aa4.77□□□□□ -1.65
GAPDHP25-201ENST00000447061 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa4.77□□□□□ -1.65
GAPDHP25-201ENST00000447061 CLEC18CQ8NCF0 446 aa4.77□□□□□ -1.65
GAPDHP25-201ENST00000447061 NAXEQ8NCW5 288 aa4.77□□□□□ -1.65
GAPDHP25-201ENST00000447061 NOXO1Q8NFA2 376 aa4.77□□□□□ -1.65
GAPDHP25-201ENST00000447061 MOSPD2Q8NHP6 518 aa4.77□□□□□ -1.65
GAPDHP25-201ENST00000447061 ZNF519Q8TB69 540 aa4.77□□□□□ -1.65
GAPDHP25-201ENST00000447061 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
GAPDHP25-201ENST00000447061 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa4.77□□□□□ -1.65
GAPDHP25-201ENST00000447061 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
GAPDHP25-201ENST00000447061 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
GAPDHP25-201ENST00000447061 TMEM54Q969K7 222 aa4.77□□□□□ -1.65
GAPDHP25-201ENST00000447061 HRASLS5Q96KN8 279 aa4.77□□□□□ -1.65
GAPDHP25-201ENST00000447061 SAMD8Q96LT4 415 aa4.77□□□□□ -1.65
GAPDHP25-201ENST00000447061 ZNF570Q96NI8 536 aa4.77□□□□□ -1.65
GAPDHP25-201ENST00000447061 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
GAPDHP25-201ENST00000447061 SLC38A2Q96QD8 506 aa4.77□□□□□ -1.65
GAPDHP25-201ENST00000447061 RBP7Q96R05 134 aa4.77□□□□□ -1.65
GAPDHP25-201ENST00000447061 OR2M2Q96R28 347 aa4.77□□□□□ -1.65
GAPDHP25-201ENST00000447061 IFT27Q9BW83 186 aa4.77□□□□□ -1.65
GAPDHP25-201ENST00000447061 TSSK6Q9BXA6 273 aa4.77□□□□□ -1.65
GAPDHP25-201ENST00000447061 FN3KQ9H479 309 aa4.77□□□□□ -1.65
GAPDHP25-201ENST00000447061 OBP2BQ9NPH6 170 aa4.77□□□□□ -1.65
GAPDHP25-201ENST00000447061 CMC2Q9NRP2 79 aa4.77□□□□□ -1.65
GAPDHP25-201ENST00000447061 ASB6Q9NWX5 421 aa4.77□□□□□ -1.65
GAPDHP25-201ENST00000447061 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
GAPDHP25-201ENST00000447061 TAS2R16Q9NYV7 291 aa4.77□□□□□ -1.65
GAPDHP25-201ENST00000447061 GLTPQ9NZD2 209 aa4.77□□□□□ -1.65
GAPDHP25-201ENST00000447061 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
GAPDHP25-201ENST00000447061 UPB1Q9UBR1 384 aa4.77□□□□□ -1.65
GAPDHP25-201ENST00000447061 SEC14L4Q9UDX3 406 aa4.77□□□□□ -1.65
GAPDHP25-201ENST00000447061 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa4.77□□□□□ -1.65
GAPDHP25-201ENST00000447061 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
GAPDHP25-201ENST00000447061 GPR52Q9Y2T5 361 aa4.77□□□□□ -1.65
GAPDHP25-201ENST00000447061 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
GAPDHP25-201ENST00000447061 ARID1AO14497 2285 aa4.76□□□□□ -1.65
GAPDHP25-201ENST00000447061 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
GAPDHP25-201ENST00000447061 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa4.76□□□□□ -1.65
GAPDHP25-201ENST00000447061 SNTNA6NMZ2 147 aa4.76□□□□□ -1.65
GAPDHP25-201ENST00000447061 RIIAD1A6NNX1 92 aa4.76□□□□□ -1.65
GAPDHP25-201ENST00000447061 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
GAPDHP25-201ENST00000447061 H0YAE9 185 aa4.76□□□□□ -1.65
GAPDHP25-201ENST00000447061 SOCS2O14508 198 aa4.76□□□□□ -1.65
GAPDHP25-201ENST00000447061 SURF4O15260 269 aa4.76□□□□□ -1.65
GAPDHP25-201ENST00000447061 ZNHIT1O43257 154 aa4.76□□□□□ -1.65
GAPDHP25-201ENST00000447061 TRMUO75648 421 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
GAPDHP25-201ENST00000447061 KRT33AO76009 404 aa4.76□□□□□ -1.65
GAPDHP25-201ENST00000447061 AGFG2O95081 481 aa4.76□□□□□ -1.65
GAPDHP25-201ENST00000447061 GOSR1O95249 250 aa4.76□□□□□ -1.65
GAPDHP25-201ENST00000447061 RENP00797 406 aa4.76□□□□□ -1.65
GAPDHP25-201ENST00000447061 HLA-DOBP13765 273 aa4.76□□□□□ -1.65
GAPDHP25-201ENST00000447061 CD33P20138 364 aa4.76□□□□□ -1.65
GAPDHP25-201ENST00000447061 KLK2P20151 261 aa4.76□□□□□ -1.65
GAPDHP25-201ENST00000447061 NPR2P20594 1047 aa4.76□□□□□ -1.65
GAPDHP25-201ENST00000447061 BMP5P22003 454 aa4.76□□□□□ -1.65
GAPDHP25-201ENST00000447061 PAICSP22234 425 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
GAPDHP25-201ENST00000447061 PEX2P28328 305 aa4.76□□□□□ -1.65
GAPDHP25-201ENST00000447061 ACVR1BP36896 505 aa4.76□□□□□ -1.65
GAPDHP25-201ENST00000447061 CD79BP40259 229 aa4.76□□□□□ -1.65
GAPDHP25-201ENST00000447061 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
GAPDHP25-201ENST00000447061 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
GAPDHP25-201ENST00000447061 SELENOPP49908 381 aa4.76□□□□□ -1.65
GAPDHP25-201ENST00000447061 ZNF84P51523 738 aa4.76□□□□□ -1.65
GAPDHP25-201ENST00000447061 SLC25A1P53007 311 aa4.76□□□□□ -1.65
GAPDHP25-201ENST00000447061 CLRN1P58418 232 aa4.76□□□□□ -1.65
GAPDHP25-201ENST00000447061 CDC42P60953 191 aa4.76□□□□□ -1.65
GAPDHP25-201ENST00000447061 ERVK-25P63136 954 aa4.76□□□□□ -1.65
GAPDHP25-201ENST00000447061 SIRPAP78324 504 aa4.76□□□□□ -1.65
GAPDHP25-201ENST00000447061 MYBPC1Q00872 1141 aa4.76□□□□□ -1.65
GAPDHP25-201ENST00000447061 TEKQ02763 1124 aa4.76□□□□□ -1.65
GAPDHP25-201ENST00000447061 TNP2Q05952 138 aa4.76□□□□□ -1.65
GAPDHP25-201ENST00000447061 FOXF2Q12947 444 aa4.76□□□□□ -1.65
GAPDHP25-201ENST00000447061 TMED1Q13445 227 aa4.76□□□□□ -1.65
GAPDHP25-201ENST00000447061 IL18R1Q13478 541 aa4.76□□□□□ -1.65
GAPDHP25-201ENST00000447061 KEAP1Q14145 624 aa4.76□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.7 ms