RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445241.5

PTPA-222, Transcript of protein phosphatase 2 phosphatase activator, human

TSL 3

Gene PTPA, Length 949 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPA-222	ENST00000445241	PAMR1	Q6UXH9	720 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	FAM122B	Q7Z309	247 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	CDH24	Q86UP0	819 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	SPATA24	Q86W54	205 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	ARIH2OS	Q8N7S6	290 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	NANOS1	Q8WY41	292 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	KATNB1	Q9BVA0	655 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	DGCR6L	Q9BY27	220 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	NRIP3	Q9NQ35	241 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	GRHPR	Q9UBQ7	328 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	FBXL3	Q9UKT7	428 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	SAMHD1	Q9Y3Z3	626 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	LRBA	P50851	2863 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	IMPA2	O14732	288 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	IDH3B	O43837	385 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	TXNDC12	O95881	172 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	IGKV3-15	P01624	115 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	QDPR	P09417	244 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF26	P17031	533 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	CDH2	P19022	906 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	GSTM3	P21266	225 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	SDHA	P31040	664 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	ACVR1B	P36896	505 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF84	P51523	738 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	RPS6KA3	P51812	740 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	BSPH1	Q075Z2	132 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	HIKESHI	Q53FT3	197 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	PGBD2	Q6P3X8	592 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF813	Q6ZN06	617 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF704	Q6ZNC4	412 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	ADCK1	Q86TW2	530 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	WDFY1	Q8IWB7	410 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	CLDN22	Q8N7P3	220 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	FANK1	Q8TC84	345 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	MCHR2	Q969V1	340 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	NMD3	Q96D46	503 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF837	Q96EG3	531 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	TSPAN32	Q96QS1	320 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	RBP7	Q96R05	134 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	NPAP1	Q9NZP6	1156 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	ST6GALNAC2	Q9UJ37	374 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF346	Q9UL40	294 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	PDZD2	O15018	2839 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	MYO9A	B2RTY4	2548 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241		A0A1W2PPR1	153 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	DPRX	A6NFQ7	191 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	XKRY	O14609	159 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	HS3ST1	O14792	307 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	ARPC3	O15145	178 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	FKBP6	O75344	327 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	CIB2	O75838	187 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	FARS2	O95363	451 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	IGLV1-44	P01699	117 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	RAF1	P04049	648 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	OR8G3P	P0DMU2	310 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	CBR1	P16152	277 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	NPR2	P20594	1047 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	CD40	P25942	277 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	SLC6A6	P31641	620 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	ARR3	P36575	388 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	RUNX1T1	Q06455	604 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	RFX4	Q33E94	735 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	C1orf146	Q5VVC0	180 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	CD300LD	Q6UXZ3	194 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF620	Q6ZNG0	422 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	MEX3D	Q86XN8	651 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	DEPDC4	Q8N2C3	294 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	IL17RD	Q8NFM7	739 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	HDAC2	Q92769	488 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	MBD6	Q96DN6	1003 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	DUS3L	Q96G46	650 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF570	Q96NI8	536 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	SLC38A2	Q96QD8	506 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	HS3ST6	Q96QI5	342 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	SNX18	Q96RF0	628 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	GPA33	Q99795	319 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	TMEM38B	Q9NVV0	291 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	IL20	Q9NYY1	176 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241	DNAJB9	Q9UBS3	223 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PTPA-222	ENST00000445241		A0A096LPE4	126 aa		12.77	□□□□□ -0.37
PTPA-222	ENST00000445241		A0A1W2PPZ6	126 aa		12.77	□□□□□ -0.37
PTPA-222	ENST00000445241	DEAF1	O75398	565 aa	Predicted RBP	12.77	□□□□□ -0.37
PTPA-222	ENST00000445241	UBL3	O95164	117 aa		12.77	□□□□□ -0.37
PTPA-222	ENST00000445241	DNASE1	P24855	282 aa		12.77	□□□□□ -0.37
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF83	P51522	516 aa		12.77	□□□□□ -0.37
PTPA-222	ENST00000445241	FXYD6P3	P58550	94 aa		12.77	□□□□□ -0.37
PTPA-222	ENST00000445241	ERVK-25	P63136	954 aa		12.77	□□□□□ -0.37
PTPA-222	ENST00000445241	MRPS34	P82930	218 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.37
PTPA-222	ENST00000445241	CD47	Q08722	323 aa		12.77	□□□□□ -0.37
PTPA-222	ENST00000445241	COX10	Q12887	443 aa		12.77	□□□□□ -0.37
PTPA-222	ENST00000445241	TOP3A	Q13472	1001 aa	Predicted RBP	12.77	□□□□□ -0.37
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF672	Q499Z4	452 aa	Predicted RBP	12.77	□□□□□ -0.37
PTPA-222	ENST00000445241	RASSF6	Q6ZTQ3	369 aa		12.77	□□□□□ -0.37
PTPA-222	ENST00000445241	YTHDF3	Q7Z739	585 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.37
PTPA-222	ENST00000445241	SLC22A24	Q8N4F4	322 aa		12.77	□□□□□ -0.37
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF611	Q8N823	705 aa		12.77	□□□□□ -0.37
PTPA-222	ENST00000445241	SYT14	Q8NB59	555 aa		12.77	□□□□□ -0.37
PTPA-222	ENST00000445241	NRBF2	Q96F24	287 aa		12.77	□□□□□ -0.37
PTPA-222	ENST00000445241	WAC	Q9BTA9	647 aa		12.77	□□□□□ -0.37
PTPA-222	ENST00000445241	OR52D1	Q9H346	318 aa		12.77	□□□□□ -0.37

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