RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428064.5

LIMS1-208, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene LIMS1, Length 637 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-208ENST00000428064 SEPHS2Q99611 448 aa18.04■□□□□ 0.48
LIMS1-208ENST00000428064 C1orf198Q9H425 327 aa18.04■□□□□ 0.48
LIMS1-208ENST00000428064 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP18.04■□□□□ 0.48
LIMS1-208ENST00000428064 SLC22A23A1A5C7 686 aa18.03■□□□□ 0.48
LIMS1-208ENST00000428064 DHHO43323 396 aa18.03■□□□□ 0.48
LIMS1-208ENST00000428064 MGRN1O60291 552 aa18.03■□□□□ 0.48
LIMS1-208ENST00000428064 FARS2O95363 451 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
LIMS1-208ENST00000428064 IGHG1P01857 330 aa18.03■□□□□ 0.48
LIMS1-208ENST00000428064 HIST1H2ABP04908 130 aa18.03■□□□□ 0.48
LIMS1-208ENST00000428064 IL2RGP31785 369 aa18.03■□□□□ 0.48
LIMS1-208ENST00000428064 RBM34P42696 430 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
LIMS1-208ENST00000428064 CDH15P55291 814 aa18.03■□□□□ 0.48
LIMS1-208ENST00000428064 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
LIMS1-208ENST00000428064 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP18.03■□□□□ 0.48
LIMS1-208ENST00000428064 MELKQ14680 651 aa18.03■□□□□ 0.48
LIMS1-208ENST00000428064 COQ5Q5HYK3 327 aa18.03■□□□□ 0.48
LIMS1-208ENST00000428064 ELFN2Q5R3F8 820 aa18.03■□□□□ 0.48
LIMS1-208ENST00000428064 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa18.03■□□□□ 0.48
LIMS1-208ENST00000428064 HDXQ7Z353 690 aa18.03■□□□□ 0.48
LIMS1-208ENST00000428064 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa18.03■□□□□ 0.48
LIMS1-208ENST00000428064 HIST1H2ACQ93077 130 aa18.03■□□□□ 0.48
LIMS1-208ENST00000428064 SNX18Q96RF0 628 aa18.03■□□□□ 0.48
LIMS1-208ENST00000428064 SH3GL1Q99961 368 aa18.03■□□□□ 0.48
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
LIMS1-208ENST00000428064 A0A0G2JND7 137 aa18.02■□□□□ 0.48
LIMS1-208ENST00000428064 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP18.02■□□□□ 0.48
LIMS1-208ENST00000428064 FBP2O00757 339 aa18.02■□□□□ 0.48
LIMS1-208ENST00000428064 SNAP29O95721 258 aa18.02■□□□□ 0.48
LIMS1-208ENST00000428064 BCL10O95999 233 aa18.02■□□□□ 0.48
LIMS1-208ENST00000428064 NPPAP01160 153 aa18.02■□□□□ 0.48
LIMS1-208ENST00000428064 MT-ND1P03886 318 aa18.02■□□□□ 0.48
LIMS1-208ENST00000428064 ACHEP22303 614 aa18.02■□□□□ 0.48
LIMS1-208ENST00000428064 TRIP10Q15642 601 aa18.02■□□□□ 0.48
LIMS1-208ENST00000428064 NANOGP8Q6NSW7 305 aa18.02■□□□□ 0.48
LIMS1-208ENST00000428064 HDDC2Q7Z4H3 204 aa18.02■□□□□ 0.48
LIMS1-208ENST00000428064 CALHM3Q86XJ0 350 aa18.02■□□□□ 0.48
LIMS1-208ENST00000428064 OR8J3Q8NGG0 315 aa18.02■□□□□ 0.48
LIMS1-208ENST00000428064 FGFBP3Q8TAT2 258 aa18.02■□□□□ 0.48
LIMS1-208ENST00000428064 SYT3Q9BQG1 590 aa18.02■□□□□ 0.48
LIMS1-208ENST00000428064 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP18.02■□□□□ 0.48
LIMS1-208ENST00000428064 NANOGQ9H9S0 305 aa18.02■□□□□ 0.48
LIMS1-208ENST00000428064 BAG5Q9UL15 447 aa18.02■□□□□ 0.48
LIMS1-208ENST00000428064 QDPRP09417 244 aa18.01■□□□□ 0.47
LIMS1-208ENST00000428064 TSPAN19P0C672 248 aa18.01■□□□□ 0.47
LIMS1-208ENST00000428064 PATE4P0C8F1 98 aa18.01■□□□□ 0.47
LIMS1-208ENST00000428064 UMPSP11172 480 aa18.01■□□□□ 0.47
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP18.01■□□□□ 0.47
LIMS1-208ENST00000428064 SLC30A7Q8NEW0 376 aa18.01■□□□□ 0.47
LIMS1-208ENST00000428064 NOXO1Q8NFA2 376 aa18.01■□□□□ 0.47
LIMS1-208ENST00000428064 LIPHQ8WWY8 451 aa18.01■□□□□ 0.47
LIMS1-208ENST00000428064 RDH5Q92781 318 aa18.01■□□□□ 0.47
LIMS1-208ENST00000428064 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP18.01■□□□□ 0.47
LIMS1-208ENST00000428064 NPIPB13A6NJU9 1138 aa18■□□□□ 0.47
LIMS1-208ENST00000428064 NPIPB4C9JG80 1138 aa18■□□□□ 0.47
LIMS1-208ENST00000428064 LYNX1G3V0Z9 82 aa18■□□□□ 0.47
LIMS1-208ENST00000428064 FXYD1O00168 92 aa18■□□□□ 0.47
LIMS1-208ENST00000428064 OR5F1O95221 314 aa18■□□□□ 0.47
LIMS1-208ENST00000428064 PTHP01270 115 aa18■□□□□ 0.47
LIMS1-208ENST00000428064 LYNX1P0DP58 116 aa18■□□□□ 0.47
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LIMS1-208ENST00000428064 ALDH3B1P43353 468 aa18■□□□□ 0.47
LIMS1-208ENST00000428064 DAP3P51398 398 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
LIMS1-208ENST00000428064 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP18■□□□□ 0.47
LIMS1-208ENST00000428064 CLRN1P58418 232 aa18■□□□□ 0.47
LIMS1-208ENST00000428064 SLC36A2Q495M3 483 aa18■□□□□ 0.47
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM53Q6P2H8 277 aa18■□□□□ 0.47
LIMS1-208ENST00000428064 ERICH5Q6P6B1 374 aa18■□□□□ 0.47
LIMS1-208ENST00000428064 LRP11Q86VZ4 500 aa18■□□□□ 0.47
LIMS1-208ENST00000428064 CARM1Q86X55 608 aa18■□□□□ 0.47
LIMS1-208ENST00000428064 OR4K5Q8NGD3 323 aa18■□□□□ 0.47
LIMS1-208ENST00000428064 MCHR2Q969V1 340 aa18■□□□□ 0.47
LIMS1-208ENST00000428064 LRRC58Q96CX6 371 aa18■□□□□ 0.47
LIMS1-208ENST00000428064 SH3GL3Q99963 347 aa18■□□□□ 0.47
LIMS1-208ENST00000428064 RACGAP1Q9H0H5 632 aa18■□□□□ 0.47
LIMS1-208ENST00000428064 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
LIMS1-208ENST00000428064 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP18■□□□□ 0.47
LIMS1-208ENST00000428064 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa17.99■□□□□ 0.47
LIMS1-208ENST00000428064 A0A1W2PRG6 482 aa17.99■□□□□ 0.47
LIMS1-208ENST00000428064 BBIP1A8MTZ0 92 aa17.99■□□□□ 0.47
LIMS1-208ENST00000428064 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa17.99■□□□□ 0.47
LIMS1-208ENST00000428064 OR7A10O76100 309 aa17.99■□□□□ 0.47
LIMS1-208ENST00000428064 HPXP02790 462 aa17.99■□□□□ 0.47
LIMS1-208ENST00000428064 THRBP10828 461 aa17.99■□□□□ 0.47
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF84P51523 738 aa17.99■□□□□ 0.47
LIMS1-208ENST00000428064 SEC24CP53992 1094 aa17.99■□□□□ 0.47
LIMS1-208ENST00000428064 UGT2B15P54855 530 aa17.99■□□□□ 0.47
LIMS1-208ENST00000428064 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP17.99■□□□□ 0.47
LIMS1-208ENST00000428064 MMEL1Q495T6 779 aa17.99■□□□□ 0.47
LIMS1-208ENST00000428064 RABL3Q5HYI8 236 aa17.99■□□□□ 0.47
LIMS1-208ENST00000428064 C10orf128Q5T292 105 aa17.99■□□□□ 0.47
LIMS1-208ENST00000428064 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP17.99■□□□□ 0.47
LIMS1-208ENST00000428064 SLC16A14Q7RTX9 510 aa17.99■□□□□ 0.47
LIMS1-208ENST00000428064 ASB10Q8WXI3 467 aa17.99■□□□□ 0.47
LIMS1-208ENST00000428064 C19orf24Q9BVV8 132 aa17.99■□□□□ 0.47
LIMS1-208ENST00000428064 GPR160Q9UJ42 338 aa17.99■□□□□ 0.47
LIMS1-208ENST00000428064 SH3GLB1Q9Y371 365 aa17.99■□□□□ 0.47
LIMS1-208ENST00000428064 A0A1W2PPW3 197 aa17.98■□□□□ 0.47
LIMS1-208ENST00000428064 B4DSR2 109 aa17.98■□□□□ 0.47
LIMS1-208ENST00000428064 IFNA14P01570 189 aa17.98■□□□□ 0.47
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF250P15622 560 aa17.98■□□□□ 0.47
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