RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428026.6

PTPRU-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 5,550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-204ENST00000428026 RAF1P04049 648 aa13.36□□□□□ -0.27
PTPRU-204ENST00000428026 TRAPPC2P0DI81 140 aa13.36□□□□□ -0.27
PTPRU-204ENST00000428026 TRAPPC2BP0DI82 140 aa13.36□□□□□ -0.27
PTPRU-204ENST00000428026 ZNF728P0DKX0 622 aa13.36□□□□□ -0.27
PTPRU-204ENST00000428026 CD38P28907 300 aa13.36□□□□□ -0.27
PTPRU-204ENST00000428026 SAXO2Q658L1 398 aa13.36□□□□□ -0.27
PTPRU-204ENST00000428026 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa13.36□□□□□ -0.27
PTPRU-204ENST00000428026 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP13.36□□□□□ -0.27
PTPRU-204ENST00000428026 PIGMQ9H3S5 423 aa13.36□□□□□ -0.27
PTPRU-204ENST00000428026 WDR76Q9H967 626 aa13.36□□□□□ -0.27
PTPRU-204ENST00000428026 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa13.36□□□□□ -0.27
PTPRU-204ENST00000428026 TAF9BQ9HBM6 251 aa13.36□□□□□ -0.27
PTPRU-204ENST00000428026 NME2P1O60361 137 aa13.36□□□□□ -0.27
PTPRU-204ENST00000428026 MEP1BQ16820 701 aa13.36□□□□□ -0.27
PTPRU-204ENST00000428026 SYT14P1Q58G82 188 aa13.36□□□□□ -0.27
PTPRU-204ENST00000428026 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa13.36□□□□□ -0.27
PTPRU-204ENST00000428026 FGGYQ96C11 551 aa13.36□□□□□ -0.27
PTPRU-204ENST00000428026 GLIPR2Q9H4G4 154 aa13.36□□□□□ -0.27
PTPRU-204ENST00000428026 FLVCR2Q9UPI3 526 aa13.36□□□□□ -0.27
PTPRU-204ENST00000428026 A0A1B0GWA3 101 aa13.35□□□□□ -0.27
PTPRU-204ENST00000428026 ADAM10O14672 748 aa13.35□□□□□ -0.27
PTPRU-204ENST00000428026 SUSD5O60279 629 aa13.35□□□□□ -0.27
PTPRU-204ENST00000428026 CLDN1O95832 211 aa13.35□□□□□ -0.27
PTPRU-204ENST00000428026 TEAD1P28347 426 aa13.35□□□□□ -0.27
PTPRU-204ENST00000428026 RAD52P43351 418 aa13.35□□□□□ -0.27
PTPRU-204ENST00000428026 OR2B8PP59922 312 aa13.35□□□□□ -0.27
PTPRU-204ENST00000428026 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP13.35□□□□□ -0.27
PTPRU-204ENST00000428026 OR52N1Q8NH53 320 aa13.35□□□□□ -0.27
PTPRU-204ENST00000428026 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP13.35□□□□□ -0.27
PTPRU-204ENST00000428026 ULBP2Q9BZM5 246 aa13.35□□□□□ -0.27
PTPRU-204ENST00000428026 UBQLN3Q9H347 655 aa13.35□□□□□ -0.27
PTPRU-204ENST00000428026 RAB9BQ9NP90 201 aa13.35□□□□□ -0.27
PTPRU-204ENST00000428026 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP13.35□□□□□ -0.27
PTPRU-204ENST00000428026 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
PTPRU-204ENST00000428026 MSMO1Q15800 293 aa13.35□□□□□ -0.27
PTPRU-204ENST00000428026 RABEPKQ7Z6M1 372 aa13.35□□□□□ -0.27
PTPRU-204ENST00000428026 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
PTPRU-204ENST00000428026 PTDSS2Q9BVG9 487 aa13.35□□□□□ -0.27
PTPRU-204ENST00000428026 FBXO8Q9NRD0 319 aa13.35□□□□□ -0.27
PTPRU-204ENST00000428026 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP13.35□□□□□ -0.27
PTPRU-204ENST00000428026 PPT2Q9UMR5 302 aa13.35□□□□□ -0.27
PTPRU-204ENST00000428026 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP13.35□□□□□ -0.27
PTPRU-204ENST00000428026 LRIT2A6NDA9 550 aa13.35□□□□□ -0.27
PTPRU-204ENST00000428026 LINC01565O15544 149 aa13.35□□□□□ -0.27
PTPRU-204ENST00000428026 ZNF264O43296 627 aa13.35□□□□□ -0.27
PTPRU-204ENST00000428026 SPNP16150 400 aa13.35□□□□□ -0.27
PTPRU-204ENST00000428026 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
PTPRU-204ENST00000428026 TMEM88Q6PEY1 159 aa13.35□□□□□ -0.27
PTPRU-204ENST00000428026 L3MBTL4Q8NA19 623 aa13.35□□□□□ -0.27
PTPRU-204ENST00000428026 PFN4Q8NHR9 129 aa13.35□□□□□ -0.27
PTPRU-204ENST00000428026 FAM234AQ9H0X4 552 aa13.35□□□□□ -0.27
PTPRU-204ENST00000428026 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa13.35□□□□□ -0.27
PTPRU-204ENST00000428026 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa13.35□□□□□ -0.27
PTPRU-204ENST00000428026 CYTIPO60759 359 aa13.35□□□□□ -0.27
PTPRU-204ENST00000428026 GPX2P18283 190 aa13.35□□□□□ -0.27
PTPRU-204ENST00000428026 BCKDHBP21953 392 aa13.35□□□□□ -0.27
PTPRU-204ENST00000428026 DPP4P27487 766 aa13.35□□□□□ -0.27
PTPRU-204ENST00000428026 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
PTPRU-204ENST00000428026 IKZF1Q13422 519 aa13.35□□□□□ -0.27
PTPRU-204ENST00000428026 BAK1Q16611 211 aa13.35□□□□□ -0.27
PTPRU-204ENST00000428026 TMEM64Q6YI46 380 aa13.35□□□□□ -0.27
PTPRU-204ENST00000428026 HIST2H3AQ71DI3 136 aa13.35□□□□□ -0.27
PTPRU-204ENST00000428026 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP13.35□□□□□ -0.27
PTPRU-204ENST00000428026 SFT2D1Q8WV19 159 aa13.35□□□□□ -0.27
PTPRU-204ENST00000428026 TMEM43Q9BTV4 400 aa13.35□□□□□ -0.27
PTPRU-204ENST00000428026 PAPPAQ13219 1627 aa13.35□□□□□ -0.27
PTPRU-204ENST00000428026 D6RAR5 112 aa13.34□□□□□ -0.27
PTPRU-204ENST00000428026 TUSC2O75896 110 aa13.34□□□□□ -0.27
PTPRU-204ENST00000428026 OR1D4P47884 311 aa13.34□□□□□ -0.27
PTPRU-204ENST00000428026 CCSMST1Q4G0I0 132 aa13.34□□□□□ -0.27
PTPRU-204ENST00000428026 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP13.34□□□□□ -0.27
PTPRU-204ENST00000428026 TMED6Q8WW62 240 aa13.34□□□□□ -0.27
PTPRU-204ENST00000428026 TM4SF18Q96CE8 201 aa13.34□□□□□ -0.27
PTPRU-204ENST00000428026 TXN2Q99757 166 aa13.34□□□□□ -0.27
PTPRU-204ENST00000428026 C1orf198Q9H425 327 aa13.34□□□□□ -0.27
PTPRU-204ENST00000428026 ETV7Q9Y603 341 aa13.34□□□□□ -0.27
PTPRU-204ENST00000428026 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
PTPRU-204ENST00000428026 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa13.34□□□□□ -0.27
PTPRU-204ENST00000428026 TMEM235A6NFC5 223 aa13.34□□□□□ -0.27
PTPRU-204ENST00000428026 TO15178 435 aa13.34□□□□□ -0.27
PTPRU-204ENST00000428026 HOXA9P31269 272 aa13.34□□□□□ -0.27
PTPRU-204ENST00000428026 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP13.34□□□□□ -0.27
PTPRU-204ENST00000428026 DMBX1Q8NFW5 382 aa13.34□□□□□ -0.27
PTPRU-204ENST00000428026 NEURL3Q96EH8 262 aa13.34□□□□□ -0.27
PTPRU-204ENST00000428026 SLC6A17Q9H1V8 727 aa13.34□□□□□ -0.27
PTPRU-204ENST00000428026 A4GALTQ9NPC4 353 aa13.34□□□□□ -0.27
PTPRU-204ENST00000428026 H0YGG7 62 aa13.34□□□□□ -0.27
PTPRU-204ENST00000428026 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP13.34□□□□□ -0.27
PTPRU-204ENST00000428026 LAP3P28838 519 aa13.34□□□□□ -0.27
PTPRU-204ENST00000428026 HOXC13P31276 330 aa13.34□□□□□ -0.27
PTPRU-204ENST00000428026 CTBSQ01459 385 aa13.34□□□□□ -0.27
PTPRU-204ENST00000428026 PMPCAQ10713 525 aa13.34□□□□□ -0.27
PTPRU-204ENST00000428026 AQP6Q13520 282 aa13.34□□□□□ -0.27
PTPRU-204ENST00000428026 KCNG3Q8TAE7 436 aa13.34□□□□□ -0.27
PTPRU-204ENST00000428026 NXPE3Q969Y0 559 aa13.34□□□□□ -0.27
PTPRU-204ENST00000428026 ZNF75AQ96N20 296 aa13.34□□□□□ -0.27
PTPRU-204ENST00000428026 ASB16Q96NS5 453 aa13.34□□□□□ -0.27
PTPRU-204ENST00000428026 C12orf57Q99622 126 aa13.34□□□□□ -0.27
PTPRU-204ENST00000428026 RHNO1Q9BSD3 238 aa13.34□□□□□ -0.27
PTPRU-204ENST00000428026 TAS2R5Q9NYW4 299 aa13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.9 ms