RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000397611.7

PTPRD-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRD, Length 8,242 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-205ENST00000397611 ZFP57Q9NU63 452 aa5□□□□□ -1.61
PTPRD-205ENST00000397611 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
PTPRD-205ENST00000397611 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa5□□□□□ -1.61
PTPRD-205ENST00000397611 HMSDA8MTL9 139 aa5□□□□□ -1.61
PTPRD-205ENST00000397611 BHLHE40O14503 412 aa5□□□□□ -1.61
PTPRD-205ENST00000397611 ZNF208O43345 1280 aa5□□□□□ -1.61
PTPRD-205ENST00000397611 CYTIPO60759 359 aa5□□□□□ -1.61
PTPRD-205ENST00000397611 PLGP00747 810 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
PTPRD-205ENST00000397611 RRASP10301 218 aa5□□□□□ -1.61
PTPRD-205ENST00000397611 SLC2A5P22732 501 aa5□□□□□ -1.61
PTPRD-205ENST00000397611 GNRHRP30968 328 aa5□□□□□ -1.61
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PTPRD-205ENST00000397611 RPE65Q16518 533 aa5□□□□□ -1.61
PTPRD-205ENST00000397611 OLIG3Q7RTU3 272 aa5□□□□□ -1.61
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PTPRD-205ENST00000397611 KDM8Q8N371 416 aa5□□□□□ -1.61
PTPRD-205ENST00000397611 OR52B4Q8NGK2 314 aa5□□□□□ -1.61
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PTPRD-205ENST00000397611 PRSS27Q9BQR3 290 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRD-205ENST00000397611 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
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PTPRD-205ENST00000397611 PRSS16Q9NQE7 514 aa4.99□□□□□ -1.61
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