RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384139.1

RNU6-187P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 187, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-187P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-187P-201ENST00000384139 ZNF470Q6ECI4 717 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 LCN12Q6JVE5 192 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 FAM71F2Q6NXP2 309 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 PLBD1Q6P4A8 553 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 C1orf186Q6ZWK4 172 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 CENPUQ71F23 418 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 LPCAT2Q7L5N7 544 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 BNIPLQ7Z465 357 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 PCGF5Q86SE9 256 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 ZNF546Q86UE3 836 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 WDFY1Q8IWB7 410 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 KDM8Q8N371 416 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 UXS1Q8NBZ7 420 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 C19orf18Q8NEA5 215 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 OR8U1Q8NH10 309 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 OR56B4Q8NH76 319 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 MAIP1Q8WWC4 291 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 OTUB2Q96DC9 234 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 SEH1LQ96EE3 360 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 ITCHQ96J02 903 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 OR2V2Q96R30 315 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 INTS14Q96SY0 518 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 TIMM17AQ99595 171 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 CHAC1Q9BUX1 264 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 AP1M1Q9BXS5 423 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 GABARAPL3Q9BY60 117 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 OSBPL8Q9BZF1 889 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 EDEM3Q9BZQ6 932 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 SLC19A3Q9BZV2 496 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 ACTR6Q9GZN1 396 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 ATG10Q9H0Y0 220 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 PORCNQ9H237 461 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 RBKSQ9H477 322 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 REEP4Q9H6H4 257 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 MYH16Q9H6N6 1097 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 COMMD8Q9NX08 183 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 DOK5Q9P104 306 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 MTRRQ9UBK8 725 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 IKZF2Q9UKS7 526 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 FBXL3Q9UKT7 428 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 FBXW2Q9UKT8 454 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 DNPEPQ9ULA0 475 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 NPIPA1Q9UND3 350 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 STX8Q9UNK0 236 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 R4GN34 69 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 NACADO15069 1562 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 USP24Q9UPU5 2620 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 PTPRUQ92729 1446 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 CLUHO75153 1309 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 A0A0U1RQV1 116 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 A0A1B0GUH1 482 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 FAM74A7A6NL05 159 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 A8MWL6 223 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 A8MXQ7 604 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 G3V3Q6 166 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 DCTN6O00399 190 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 CLDN5O00501 218 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 ST8SIA3O43173 380 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 TIMM44O43615 452 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 CXCL13O43927 109 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 SOX15O60248 233 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 KINO60870 393 aaKnown RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 SCN2BO60939 215 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 CNMDO75829 334 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 ERLIN2O94905 339 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 PGM3O95394 542 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 H6PDO95479 791 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 IGHV3-11P01762 117 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 MT-ND3P03897 115 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 IGKV5-2P06315 115 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 ACSM4P0C7M7 580 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 THRAP10827 490 aa-0.03□□□□□ -2.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23 ms