RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356384.4

RXRA-201, Transcript of retinoid X receptor alpha, humanhuman

TSL 5

Gene RXRA, Length 5,770 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRA-201ENST00000356384 ZNF321PQ8N8H1 164 aa14.82□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 GAB3Q8WWW8 586 aa14.82□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 PIGQQ9BRB3 760 aa14.82□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 SEC22CQ9BRL7 303 aa14.82□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 ZNF416Q9BWM5 594 aa14.82□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 PIGLQ9Y2B2 252 aa14.82□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 PAX6P26367 422 aa14.82□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 S100A11P31949 105 aa14.82□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa14.82□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 DBX2Q6ZNG2 339 aa14.82□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 OR5M11Q96RB7 305 aa14.82□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa14.82□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 NUP98P52948 1817 aa14.82□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 P2RX3P56373 397 aa14.82□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 SLC35A2P78381 396 aa14.82□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa14.82□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 SFT2D1Q8WV19 159 aa14.82□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 TWSG1Q9GZX9 223 aa14.82□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 KCNIP2Q9NS61 270 aa14.82□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 HCSTQ9UBK5 93 aa14.82□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 MYH10P35580 1976 aa14.81□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 PMPCAQ10713 525 aa14.81□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 SLC51BQ86UW2 128 aa14.81□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 OR2T11Q8NH01 316 aa14.81□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa14.81□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 FAM122AQ96E09 287 aa14.81□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 KIRREL1Q96J84 757 aa14.81□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 SNX11Q9Y5W9 270 aa14.81□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa14.81□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 LRP5LA4QPB2 252 aa14.81□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 RGS11O94810 467 aa14.81□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 CLEC2LP0C7M8 214 aa14.81□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa14.81□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 CLDN22Q8N7P3 220 aa14.81□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 TMEM104Q8NE00 496 aa14.81□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 OR51A4Q8NGJ6 313 aa14.81□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 OR52I1Q8NGK6 324 aa14.81□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 POFUT1Q9H488 388 aa14.81□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 B3GAT1Q9P2W7 334 aa14.81□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 HSFX1Q9UBD0 423 aa14.81□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 MUTYHQ9UIF7 546 aa14.81□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 HTR1FP30939 366 aa14.81□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 EPHA5P54756 1037 aa14.81□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa14.81□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 BHLHE23Q8NDY6 225 aa14.81□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 RASD2Q96D21 266 aa14.81□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 CXorf36Q9H7Y0 433 aa14.81□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 ETV7Q9Y603 341 aa14.81□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 SELENOFO60613 162 aa14.81□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 CTRB1P17538 263 aa14.81□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 CTRB2Q6GPI1 263 aa14.81□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 C17orf99Q6UX52 265 aa14.81□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 GDF7Q7Z4P5 450 aa14.81□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 BARHL1Q9BZE3 327 aa14.81□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 ANKRD10Q9NXR5 420 aa14.81□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 RAB22AQ9UL26 194 aa14.81□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 BOLA1Q9Y3E2 137 aa14.81□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa14.8□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 H0YIV9 168 aa14.8□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 ADAM10O14672 748 aa14.8□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 TBPP20226 339 aa14.8□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 FCER1GP30273 86 aa14.8□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 ADRA1AP35348 466 aa14.8□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 KIAA1024LP59773 190 aa14.8□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 GGTA1PQ4G0N0 100 aa14.8□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 NHSL2Q5HYW2 709 aa14.8□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 COX20Q5RI15 118 aa14.8□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 MANEAQ5SRI9 462 aa14.8□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 GDPD3Q7L5L3 318 aa14.8□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 DCXRQ7Z4W1 244 aa14.8□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 NAXDQ8IW45 347 aa14.8□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 OR2G3Q8NGZ4 309 aa14.8□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 TM7SF3Q9NS93 570 aa14.8□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 NPAP1Q9NZP6 1156 aa14.8□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 ANGPTL7O43827 346 aa14.8□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 IGHEP01854 428 aa14.8□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 RAC1P63000 192 aa14.8□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 SPRED1Q7Z699 444 aa14.8□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 MARCH3Q86UD3 253 aa14.8□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 LGI3Q8N145 548 aa14.8□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 TUBB1Q9H4B7 451 aa14.8□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 KLK4Q9Y5K2 254 aa14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21 ms