RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000341935.9

CCR6-201, Transcript of C-C motif chemokine receptor 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCR6, Length 4,018 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR6-201ENST00000341935 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
CCR6-201ENST00000341935 NUDT14O95848 222 aa5.48□□□□□ -1.53
CCR6-201ENST00000341935 PNMTP11086 282 aa5.48□□□□□ -1.53
CCR6-201ENST00000341935 MAKP20794 623 aa5.48□□□□□ -1.53
CCR6-201ENST00000341935 ELK4P28324 431 aa5.48□□□□□ -1.53
CCR6-201ENST00000341935 LAP3P28838 519 aa5.48□□□□□ -1.53
CCR6-201ENST00000341935 CASP3P42574 277 aa5.48□□□□□ -1.53
CCR6-201ENST00000341935 ISL1P61371 349 aa5.48□□□□□ -1.53
CCR6-201ENST00000341935 IL5RAQ01344 420 aa5.48□□□□□ -1.53
CCR6-201ENST00000341935 CLN3Q13286 438 aa5.48□□□□□ -1.53
CCR6-201ENST00000341935 MEP1AQ16819 746 aa5.48□□□□□ -1.53
CCR6-201ENST00000341935 HIKESHIQ53FT3 197 aa5.48□□□□□ -1.53
CCR6-201ENST00000341935 GPR107Q5VW38 600 aa5.48□□□□□ -1.53
CCR6-201ENST00000341935 RNLSQ5VYX0 342 aa5.48□□□□□ -1.53
CCR6-201ENST00000341935 TMEM236Q5W0B7 351 aa5.48□□□□□ -1.53
CCR6-201ENST00000341935 TMEM81Q6P7N7 255 aa5.48□□□□□ -1.53
CCR6-201ENST00000341935 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa5.48□□□□□ -1.53
CCR6-201ENST00000341935 CDK20Q8IZL9 346 aa5.48□□□□□ -1.53
CCR6-201ENST00000341935 MUL1Q969V5 352 aa5.48□□□□□ -1.53
CCR6-201ENST00000341935 TMEM41AQ96HV5 264 aa5.48□□□□□ -1.53
CCR6-201ENST00000341935 VPS25Q9BRG1 176 aa5.48□□□□□ -1.53
CCR6-201ENST00000341935 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
CCR6-201ENST00000341935 ING2Q9H160 280 aa5.48□□□□□ -1.53
CCR6-201ENST00000341935 OPA3Q9H6K4 179 aa5.48□□□□□ -1.53
CCR6-201ENST00000341935 ZNF696Q9H7X3 374 aa5.48□□□□□ -1.53
CCR6-201ENST00000341935 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
CCR6-201ENST00000341935 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa5.48□□□□□ -1.53
CCR6-201ENST00000341935 MYRFQ9Y2G1 1151 aa5.48□□□□□ -1.53
CCR6-201ENST00000341935 WIF1Q9Y5W5 379 aa5.48□□□□□ -1.53
CCR6-201ENST00000341935 MUC6Q6W4X9 2439 aa5.48□□□□□ -1.53
CCR6-201ENST00000341935 DCDC2BA2VCK2 349 aa5.48□□□□□ -1.53
CCR6-201ENST00000341935 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
CCR6-201ENST00000341935 H3BN98 237 aa5.48□□□□□ -1.53
CCR6-201ENST00000341935 GP1BBP13224 206 aa5.48□□□□□ -1.53
CCR6-201ENST00000341935 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
CCR6-201ENST00000341935 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
CCR6-201ENST00000341935 CD47Q08722 323 aa5.48□□□□□ -1.53
CCR6-201ENST00000341935 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
CCR6-201ENST00000341935 ELOA3BQ3SY89 546 aa5.48□□□□□ -1.53
CCR6-201ENST00000341935 DCAF10Q5QP82 559 aa5.48□□□□□ -1.53
CCR6-201ENST00000341935 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa5.48□□□□□ -1.53
CCR6-201ENST00000341935 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
CCR6-201ENST00000341935 OR5M10Q6IEU7 315 aa5.48□□□□□ -1.53
CCR6-201ENST00000341935 VASH2Q86V25 355 aa5.48□□□□□ -1.53
CCR6-201ENST00000341935 ZFP82Q8N141 532 aa5.48□□□□□ -1.53
CCR6-201ENST00000341935 TMEM156Q8N614 296 aa5.48□□□□□ -1.53
CCR6-201ENST00000341935 C19orf18Q8NEA5 215 aa5.48□□□□□ -1.53
CCR6-201ENST00000341935 ELOA3Q8NG57 546 aa5.48□□□□□ -1.53
CCR6-201ENST00000341935 C22orf15Q8WYQ4 148 aa5.48□□□□□ -1.53
CCR6-201ENST00000341935 HSD17B8Q92506 261 aa5.48□□□□□ -1.53
CCR6-201ENST00000341935 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
CCR6-201ENST00000341935 BPIFA2Q96DR5 249 aa5.48□□□□□ -1.53
CCR6-201ENST00000341935 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
CCR6-201ENST00000341935 DPH1Q9BZG8 443 aa5.48□□□□□ -1.53
CCR6-201ENST00000341935 METTL9Q9H1A3 318 aa5.48□□□□□ -1.53
CCR6-201ENST00000341935 OR10A4Q9H209 315 aa5.48□□□□□ -1.53
CCR6-201ENST00000341935 EGLN3Q9H6Z9 239 aa5.48□□□□□ -1.53
CCR6-201ENST00000341935 CPNE5Q9HCH3 593 aa5.48□□□□□ -1.53
CCR6-201ENST00000341935 SH2D2AQ9NP31 389 aa5.48□□□□□ -1.53
CCR6-201ENST00000341935 MED11Q9P086 117 aa5.48□□□□□ -1.53
CCR6-201ENST00000341935 RNF6Q9Y252 685 aa5.48□□□□□ -1.53
CCR6-201ENST00000341935 ZFHX3Q15911 3703 aa5.48□□□□□ -1.53
CCR6-201ENST00000341935 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa5.47□□□□□ -1.53
CCR6-201ENST00000341935 B4DXG7 233 aa5.47□□□□□ -1.53
CCR6-201ENST00000341935 CDC42EP2O14613 210 aa5.47□□□□□ -1.53
CCR6-201ENST00000341935 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP5.47□□□□□ -1.53
CCR6-201ENST00000341935 ACVR2AP27037 513 aa5.47□□□□□ -1.53
CCR6-201ENST00000341935 TACR3P29371 465 aa5.47□□□□□ -1.53
CCR6-201ENST00000341935 SERPINF1P36955 418 aa5.47□□□□□ -1.53
CCR6-201ENST00000341935 FOXO1Q12778 655 aa5.47□□□□□ -1.53
CCR6-201ENST00000341935 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
CCR6-201ENST00000341935 QPRTQ15274 297 aa5.47□□□□□ -1.53
CCR6-201ENST00000341935 HSD17B12Q53GQ0 312 aa5.47□□□□□ -1.53
CCR6-201ENST00000341935 KLHL24Q6TFL4 600 aa5.47□□□□□ -1.53
CCR6-201ENST00000341935 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa5.47□□□□□ -1.53
CCR6-201ENST00000341935 ENTHD1Q8IYW4 607 aa5.47□□□□□ -1.53
CCR6-201ENST00000341935 CNIH3Q8TBE1 160 aa5.47□□□□□ -1.53
CCR6-201ENST00000341935 PAQR8Q8TEZ7 354 aa5.47□□□□□ -1.53
CCR6-201ENST00000341935 PSMF1Q92530 271 aa5.47□□□□□ -1.53
CCR6-201ENST00000341935 KCNJ15Q99712 375 aa5.47□□□□□ -1.53
CCR6-201ENST00000341935 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa5.47□□□□□ -1.53
CCR6-201ENST00000341935 HEATR5AQ86XA9 2040 aa5.47□□□□□ -1.53
CCR6-201ENST00000341935 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa5.47□□□□□ -1.53
CCR6-201ENST00000341935 EFCAB9A8MZ26 197 aa5.47□□□□□ -1.53
CCR6-201ENST00000341935 TPOP07202 933 aa5.47□□□□□ -1.53
CCR6-201ENST00000341935 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
CCR6-201ENST00000341935 FUT1P19526 365 aa5.47□□□□□ -1.53
CCR6-201ENST00000341935 MSX1P28360 303 aa5.47□□□□□ -1.53
CCR6-201ENST00000341935 CRABP1P29762 137 aa5.47□□□□□ -1.53
CCR6-201ENST00000341935 ALDH3B2P48448 385 aa5.47□□□□□ -1.53
CCR6-201ENST00000341935 BMXP51813 675 aa5.47□□□□□ -1.53
CCR6-201ENST00000341935 CDC42P60953 191 aa5.47□□□□□ -1.53
CCR6-201ENST00000341935 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
CCR6-201ENST00000341935 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
CCR6-201ENST00000341935 CDK5R2Q13319 367 aa5.47□□□□□ -1.53
CCR6-201ENST00000341935 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
CCR6-201ENST00000341935 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa5.47□□□□□ -1.53
CCR6-201ENST00000341935 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
CCR6-201ENST00000341935 SLX4IPQ5VYV7 408 aa5.47□□□□□ -1.53
CCR6-201ENST00000341935 C12orf73Q69YU5 71 aa5.47□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.5 ms