RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000340958.3

CLDN4-201, Transcript of claudin 4, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene CLDN4, Length 1,831 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN4-201ENST00000340958 INPP5EQ9NRR6 644 aa15.49■□□□□ 0.07
CLDN4-201ENST00000340958 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
CLDN4-201ENST00000340958 NCKAP5O14513 1909 aa15.48■□□□□ 0.07
CLDN4-201ENST00000340958 TMEM129A0AVI4 362 aa15.48■□□□□ 0.07
CLDN4-201ENST00000340958 MKRN2OSH3BPM6 223 aa15.48■□□□□ 0.07
CLDN4-201ENST00000340958 RAMP1O60894 148 aa15.48■□□□□ 0.07
CLDN4-201ENST00000340958 IGHG1P01857 330 aa15.48■□□□□ 0.07
CLDN4-201ENST00000340958 IGHA1P01876 353 aa15.48■□□□□ 0.07
CLDN4-201ENST00000340958 CD36P16671 472 aa15.48■□□□□ 0.07
CLDN4-201ENST00000340958 KLK2P20151 261 aa15.48■□□□□ 0.07
CLDN4-201ENST00000340958 CLDN15P56746 228 aa15.48■□□□□ 0.07
CLDN4-201ENST00000340958 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
CLDN4-201ENST00000340958 H3F3AP84243 136 aa15.48■□□□□ 0.07
CLDN4-201ENST00000340958 CAMK2DQ13557 499 aa15.48■□□□□ 0.07
CLDN4-201ENST00000340958 OR2G6Q5TZ20 316 aa15.48■□□□□ 0.07
CLDN4-201ENST00000340958 CHMP1BQ7LBR1 199 aa15.48■□□□□ 0.07
CLDN4-201ENST00000340958 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
CLDN4-201ENST00000340958 SLC35F2Q8IXU6 374 aa15.48■□□□□ 0.07
CLDN4-201ENST00000340958 ZNF511Q8NB15 262 aa15.48■□□□□ 0.07
CLDN4-201ENST00000340958 ZNRF4Q8WWF5 429 aa15.48■□□□□ 0.07
CLDN4-201ENST00000340958 EXTL1Q92935 676 aa15.48■□□□□ 0.07
CLDN4-201ENST00000340958 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
CLDN4-201ENST00000340958 ISOC1Q96CN7 298 aa15.48■□□□□ 0.07
CLDN4-201ENST00000340958 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
CLDN4-201ENST00000340958 ALG8Q9BVK2 526 aa15.48■□□□□ 0.07
CLDN4-201ENST00000340958 PTTG2Q9NZH5 202 aa15.48■□□□□ 0.07
CLDN4-201ENST00000340958 B9D1Q9UPM9 204 aa15.48■□□□□ 0.07
CLDN4-201ENST00000340958 FKBP7Q9Y680 259 aa15.48■□□□□ 0.07
CLDN4-201ENST00000340958 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa15.47■□□□□ 0.07
CLDN4-201ENST00000340958 SLC35F4A4IF30 521 aa15.47■□□□□ 0.07
CLDN4-201ENST00000340958 DCTN6O00399 190 aa15.47■□□□□ 0.07
CLDN4-201ENST00000340958 SELENOFO60613 162 aa15.47■□□□□ 0.07
CLDN4-201ENST00000340958 LIMS3P0CW19 117 aa15.47■□□□□ 0.07
CLDN4-201ENST00000340958 LIMS4P0CW20 117 aa15.47■□□□□ 0.07
CLDN4-201ENST00000340958 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
CLDN4-201ENST00000340958 CLDN17P56750 224 aa15.47■□□□□ 0.07
CLDN4-201ENST00000340958 GGTLC2Q14390 218 aa15.47■□□□□ 0.07
CLDN4-201ENST00000340958 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
CLDN4-201ENST00000340958 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
CLDN4-201ENST00000340958 TSTQ16762 297 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
CLDN4-201ENST00000340958 PCSK4Q6UW60 755 aa15.47■□□□□ 0.07
CLDN4-201ENST00000340958 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
CLDN4-201ENST00000340958 ROBO4Q8WZ75 1007 aa15.47■□□□□ 0.07
CLDN4-201ENST00000340958 RACGAP1Q9H0H5 632 aa15.47■□□□□ 0.07
CLDN4-201ENST00000340958 ETAA1Q9NY74 926 aa15.47■□□□□ 0.07
CLDN4-201ENST00000340958 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
CLDN4-201ENST00000340958 MED12Q93074 2177 aa15.47■□□□□ 0.07
CLDN4-201ENST00000340958 BSNQ9UPA5 3926 aa15.47■□□□□ 0.07
CLDN4-201ENST00000340958 KALRNO60229 2985 aa15.47■□□□□ 0.07
CLDN4-201ENST00000340958 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
CLDN4-201ENST00000340958 TVP23AA6NH52 213 aa15.47■□□□□ 0.07
CLDN4-201ENST00000340958 ACTL6AO96019 429 aa15.47■□□□□ 0.07
CLDN4-201ENST00000340958 ITGB2P05107 769 aa15.47■□□□□ 0.07
CLDN4-201ENST00000340958 OR2T7P0C7T2 308 aa15.47■□□□□ 0.07
CLDN4-201ENST00000340958 LHX2P50458 406 aa15.47■□□□□ 0.07
CLDN4-201ENST00000340958 BLVRAP53004 296 aa15.47■□□□□ 0.07
CLDN4-201ENST00000340958 TBR1Q16650 682 aa15.47■□□□□ 0.07
CLDN4-201ENST00000340958 LYPD4Q6UWN0 246 aa15.47■□□□□ 0.07
CLDN4-201ENST00000340958 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
CLDN4-201ENST00000340958 P2RY8Q86VZ1 359 aa15.47■□□□□ 0.07
CLDN4-201ENST00000340958 EXD3Q8N9H8 876 aa15.47■□□□□ 0.07
CLDN4-201ENST00000340958 OR9K2Q8NGE7 335 aa15.47■□□□□ 0.07
CLDN4-201ENST00000340958 OR2T27Q8NH04 317 aa15.47■□□□□ 0.07
CLDN4-201ENST00000340958 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
CLDN4-201ENST00000340958 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
CLDN4-201ENST00000340958 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
CLDN4-201ENST00000340958 FOXN4Q96NZ1 517 aa15.47■□□□□ 0.07
CLDN4-201ENST00000340958 JAM3Q9BX67 310 aa15.47■□□□□ 0.07
CLDN4-201ENST00000340958 FREM3P0C091 2139 aa15.46■□□□□ 0.07
CLDN4-201ENST00000340958 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa15.46■□□□□ 0.07
CLDN4-201ENST00000340958 J3QRE1 110 aa15.46■□□□□ 0.07
CLDN4-201ENST00000340958 ERVH48-1M5A8F1 160 aa15.46■□□□□ 0.07
CLDN4-201ENST00000340958 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
CLDN4-201ENST00000340958 SYNGR4O95473 234 aa15.46■□□□□ 0.07
CLDN4-201ENST00000340958 NR4A1P22736 598 aa15.46■□□□□ 0.07
CLDN4-201ENST00000340958 LIPAP38571 399 aa15.46■□□□□ 0.07
CLDN4-201ENST00000340958 HCCSP53701 268 aa15.46■□□□□ 0.07
CLDN4-201ENST00000340958 TMBIM6P55061 237 aa15.46■□□□□ 0.07
CLDN4-201ENST00000340958 GLO1Q04760 184 aa15.46■□□□□ 0.07
CLDN4-201ENST00000340958 GALEQ14376 348 aa15.46■□□□□ 0.07
CLDN4-201ENST00000340958 LINC01590Q5TEZ4 76 aa15.46■□□□□ 0.07
CLDN4-201ENST00000340958 VASNQ6EMK4 673 aa15.46■□□□□ 0.07
CLDN4-201ENST00000340958 IGFL3Q6UXB1 125 aa15.46■□□□□ 0.07
CLDN4-201ENST00000340958 TRILQ7L0X0 811 aa15.46■□□□□ 0.07
CLDN4-201ENST00000340958 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa15.46■□□□□ 0.07
CLDN4-201ENST00000340958 OR6X1Q8NH79 312 aa15.46■□□□□ 0.07
CLDN4-201ENST00000340958 NEIL3Q8TAT5 605 aa15.46■□□□□ 0.07
CLDN4-201ENST00000340958 RAB2BQ8WUD1 216 aa15.46■□□□□ 0.07
CLDN4-201ENST00000340958 SNX33Q8WV41 574 aa15.46■□□□□ 0.07
CLDN4-201ENST00000340958 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
CLDN4-201ENST00000340958 NSMAFQ92636 917 aa15.46■□□□□ 0.07
CLDN4-201ENST00000340958 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
CLDN4-201ENST00000340958 ADGRG7Q96K78 797 aa15.46■□□□□ 0.07
CLDN4-201ENST00000340958 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
CLDN4-201ENST00000340958 KCNK17Q96T54 332 aa15.46■□□□□ 0.07
CLDN4-201ENST00000340958 MFRPQ9BY79 579 aa15.46■□□□□ 0.07
CLDN4-201ENST00000340958 PRRG4Q9BZD6 226 aa15.46■□□□□ 0.07
CLDN4-201ENST00000340958 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
CLDN4-201ENST00000340958 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
CLDN4-201ENST00000340958 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.6 ms