RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326294.3

PTPRCAP-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRCAP, Length 1,292 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAP-201ENST00000326294 C18orf12Q96KH6 178 aa16.98■□□□□ 0.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 COX4I2Q96KJ9 171 aa16.98■□□□□ 0.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF75AQ96N20 296 aa16.98■□□□□ 0.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 KCNS3Q9BQ31 491 aa16.98■□□□□ 0.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 CACNG6Q9BXT2 260 aa16.98■□□□□ 0.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMEM38BQ9NVV0 291 aa16.98■□□□□ 0.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa16.97■□□□□ 0.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 A0A1W2PRQ8 180 aa16.97■□□□□ 0.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 H7C1Q1 480 aa16.97■□□□□ 0.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 CDC42EP2O14613 210 aa16.97■□□□□ 0.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 DIRAS1O95057 198 aa16.97■□□□□ 0.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 IGHMP01871 453 aa16.97■□□□□ 0.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 RHCEP18577 417 aa16.97■□□□□ 0.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP16.97■□□□□ 0.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 GPR4P46093 362 aa16.97■□□□□ 0.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 MNAT1P51948 309 aa16.97■□□□□ 0.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 MYBPC1Q00872 1141 aa16.97■□□□□ 0.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP16.97■□□□□ 0.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 DGCR6Q14129 220 aa16.97■□□□□ 0.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 SPATS1Q496A3 300 aa16.97■□□□□ 0.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 PODNL1Q6PEZ8 512 aa16.97■□□□□ 0.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP16.97■□□□□ 0.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 IGFN1Q86VF2 1251 aa16.97■□□□□ 0.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 SYT14Q8NB59 555 aa16.97■□□□□ 0.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR51A7Q8NH64 312 aa16.97■□□□□ 0.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP16.97■□□□□ 0.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 HTRA1Q92743 480 aa16.97■□□□□ 0.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP16.97■□□□□ 0.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP16.97■□□□□ 0.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 DHRS1Q96LJ7 313 aa16.97■□□□□ 0.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 NSMCE2Q96MF7 247 aa16.97■□□□□ 0.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 TXNIPQ9H3M7 391 aa16.97■□□□□ 0.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP16.97■□□□□ 0.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP16.97■□□□□ 0.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP16.97■□□□□ 0.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa16.96■□□□□ 0.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 CD79AP11912 226 aa16.96■□□□□ 0.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC9A3P48764 834 aa16.96■□□□□ 0.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP16.96■□□□□ 0.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 HGFACQ04756 655 aa16.96■□□□□ 0.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 PIGFQ07326 219 aa16.96■□□□□ 0.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 TAF11Q15544 211 aa16.96■□□□□ 0.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 ANKDD1AQ495B1 522 aa16.96■□□□□ 0.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 FGD3Q5JSP0 725 aa16.96■□□□□ 0.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa16.96■□□□□ 0.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 OAFQ86UD1 273 aa16.96■□□□□ 0.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 SKA3Q8IX90 412 aa16.96■□□□□ 0.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC22A24Q8N4F4 322 aa16.96■□□□□ 0.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 FGFBP3Q8TAT2 258 aa16.96■□□□□ 0.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 MS4A3Q96HJ5 214 aa16.96■□□□□ 0.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 PYURFQ96I23 114 aa16.96■□□□□ 0.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 NSL1Q96IY1 281 aa16.96■□□□□ 0.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa16.96■□□□□ 0.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 CA10Q9NS85 328 aa16.96■□□□□ 0.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP16.96■□□□□ 0.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 B2RBV5 119 aa16.95■□□□□ 0.3
PTPRCAP-201ENST00000326294 UBL3O95164 117 aa16.95■□□□□ 0.3
PTPRCAP-201ENST00000326294 INHBBP09529 407 aa16.95■□□□□ 0.3
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP16.95■□□□□ 0.3
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP16.95■□□□□ 0.3
PTPRCAP-201ENST00000326294 LIMS1P48059 325 aa16.95■□□□□ 0.3
PTPRCAP-201ENST00000326294 GIPRP48546 466 aa16.95■□□□□ 0.3
PTPRCAP-201ENST00000326294 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP16.95■□□□□ 0.3
PTPRCAP-201ENST00000326294 SEC23BQ15437 767 aa16.95■□□□□ 0.3
PTPRCAP-201ENST00000326294 ETFDHQ16134 617 aa16.95■□□□□ 0.3
PTPRCAP-201ENST00000326294 C10orf128Q5T292 105 aa16.95■□□□□ 0.3
PTPRCAP-201ENST00000326294 NUP37Q8NFH4 326 aa16.95■□□□□ 0.3
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR4F15Q8NGB8 312 aa16.95■□□□□ 0.3
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP16.95■□□□□ 0.3
PTPRCAP-201ENST00000326294 TSPAN32Q96QS1 320 aa16.95■□□□□ 0.3
PTPRCAP-201ENST00000326294 KCNK17Q96T54 332 aa16.95■□□□□ 0.3
PTPRCAP-201ENST00000326294 SMR3AQ99954 134 aa16.95■□□□□ 0.3
PTPRCAP-201ENST00000326294 FUZQ9BT04 418 aa16.95■□□□□ 0.3
PTPRCAP-201ENST00000326294 BDH2Q9BUT1 245 aa16.95■□□□□ 0.3
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMEM5Q9Y2B1 443 aa16.95■□□□□ 0.3
PTPRCAP-201ENST00000326294 TLN2Q9Y4G6 2542 aa16.95■□□□□ 0.3
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZFHX3Q15911 3703 aa16.94■□□□□ 0.3
PTPRCAP-201ENST00000326294 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa16.94■□□□□ 0.3
PTPRCAP-201ENST00000326294 H7C417 338 aa16.94■□□□□ 0.3
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC2A10O95528 541 aa16.94■□□□□ 0.3
PTPRCAP-201ENST00000326294 RAB36O95755 333 aa16.94■□□□□ 0.3
PTPRCAP-201ENST00000326294 PATE4P0C8F1 98 aa16.94■□□□□ 0.3
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR8G3PP0DMU2 310 aa16.94■□□□□ 0.3
PTPRCAP-201ENST00000326294 T-ENOLP0DO92 83 aa16.94■□□□□ 0.3
PTPRCAP-201ENST00000326294 ATP6V1B2P21281 511 aa16.94■□□□□ 0.3
PTPRCAP-201ENST00000326294 ACVR1BP36896 505 aa16.94■□□□□ 0.3
PTPRCAP-201ENST00000326294 CTXN1P60606 82 aa16.94■□□□□ 0.3
PTPRCAP-201ENST00000326294 RPL27P61353 136 aaKnown RBP16.94■□□□□ 0.3
PTPRCAP-201ENST00000326294 RAB1AP62820 205 aa16.94■□□□□ 0.3
PTPRCAP-201ENST00000326294 FMODQ06828 376 aa16.94■□□□□ 0.3
PTPRCAP-201ENST00000326294 SWI5Q1ZZU3 235 aa16.94■□□□□ 0.3
PTPRCAP-201ENST00000326294 CLEC12BQ2HXU8 276 aa16.94■□□□□ 0.3
PTPRCAP-201ENST00000326294 MST1LQ2TV78 715 aa16.94■□□□□ 0.3
PTPRCAP-201ENST00000326294 DNM1P46Q6ZS02 220 aa16.94■□□□□ 0.3
PTPRCAP-201ENST00000326294 BIVMQ86UB2 503 aa16.94■□□□□ 0.3
PTPRCAP-201ENST00000326294 CDK20Q8IZL9 346 aa16.94■□□□□ 0.3
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR4K5Q8NGD3 323 aa16.94■□□□□ 0.3
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF519Q8TB69 540 aa16.94■□□□□ 0.3
PTPRCAP-201ENST00000326294 FBXO17Q96EF6 278 aa16.94■□□□□ 0.3
PTPRCAP-201ENST00000326294 SH3GL3Q99963 347 aa16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.4 ms