RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318988.10

CTDNEP1-201, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF91Q05481 1191 aa24.33■■□□□ 1.49
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CTDNEP1-201ENST00000318988 HIST3H3Q16695 136 aa24.3■■□□□ 1.48
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CTDNEP1-201ENST00000318988 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
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CTDNEP1-201ENST00000318988 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa24.27■■□□□ 1.48
CTDNEP1-201ENST00000318988 FADS2O95864 444 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC15A1P46059 708 aa24.27■■□□□ 1.48
CTDNEP1-201ENST00000318988 SIRPAP78324 504 aa24.27■■□□□ 1.48
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC35A2P78381 396 aa24.27■■□□□ 1.48
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