RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000316412.9

PRAMEF20-201, Transcript of PRAME family member 20, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene PRAMEF20, Length 1,597 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF20-201ENST00000316412 IGHG1P01857 330 aa15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF20-201ENST00000316412 CDK1P06493 297 aa15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF20-201ENST00000316412 CTLA4P16410 223 aa15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF20-201ENST00000316412 PTGS2P35354 604 aa15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF20-201ENST00000316412 ST3GAL4Q11206 333 aa15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF20-201ENST00000316412 OR52I1Q8NGK6 324 aa15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF20-201ENST00000316412 OR2T4Q8NH00 348 aa15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF20-201ENST00000316412 PRRG4Q9BZD6 226 aa15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF20-201ENST00000316412 BCO1Q9HAY6 547 aa15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF20-201ENST00000316412 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF20-201ENST00000316412 ASF1BQ9NVP2 202 aa15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF20-201ENST00000316412 KLHL9Q9P2J3 617 aa15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF20-201ENST00000316412 B9D1Q9UPM9 204 aa15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF20-201ENST00000316412 MOKQ9UQ07 419 aa15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF20-201ENST00000316412 RCE1Q9Y256 329 aa15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF20-201ENST00000316412 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF20-201ENST00000316412 SPTA1P02549 2419 aa15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF20-201ENST00000316412 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF20-201ENST00000316412 SLC22A20A6NK97 555 aa15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF20-201ENST00000316412 ZNF724A8MTY0 619 aa15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF20-201ENST00000316412 FAM171A2A8MVW0 826 aa15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF20-201ENST00000316412 RGS10O43665 173 aa15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF20-201ENST00000316412 SLC16A7O60669 478 aa15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF20-201ENST00000316412 GLCEO94923 617 aa15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF20-201ENST00000316412 APOL3O95236 402 aa15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF20-201ENST00000316412 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF20-201ENST00000316412 SELENOPP49908 381 aa15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF20-201ENST00000316412 RPS7P62081 194 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF20-201ENST00000316412 FMODQ06828 376 aa15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF20-201ENST00000316412 LGALS3BPQ08380 585 aa15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF20-201ENST00000316412 RAB40BQ12829 278 aa15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF20-201ENST00000316412 LY6DQ14210 128 aa15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF20-201ENST00000316412 GGTLC2Q14390 218 aa15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF20-201ENST00000316412 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF20-201ENST00000316412 ETFDHQ16134 617 aa15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF20-201ENST00000316412 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF20-201ENST00000316412 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF20-201ENST00000316412 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF20-201ENST00000316412 MYDGFQ969H8 173 aa15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF20-201ENST00000316412 TMEM54Q969K7 222 aa15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF20-201ENST00000316412 TMEM45BQ96B21 275 aa15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF20-201ENST00000316412 SHANK1Q9Y566 2161 aa15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF20-201ENST00000316412 A0A087WXM4 84 aa15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF20-201ENST00000316412 J3QRE1 110 aa15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF20-201ENST00000316412 GPR171O14626 319 aa15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF20-201ENST00000316412 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF20-201ENST00000316412 CLRN1P58418 232 aa15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF20-201ENST00000316412 KLHL22Q53GT1 634 aa15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF20-201ENST00000316412 THEM4Q5T1C6 240 aa15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF20-201ENST00000316412 CARD17Q5XLA6 110 aa15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF20-201ENST00000316412 TMEM154Q6P9G4 183 aa15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF20-201ENST00000316412 PRSS48Q7RTY5 328 aa15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF20-201ENST00000316412 SPARTQ8N0X7 666 aa15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF20-201ENST00000316412 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF20-201ENST00000316412 TRIB1Q96RU8 372 aa15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF20-201ENST00000316412 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF20-201ENST00000316412 RACGAP1Q9H0H5 632 aa15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF20-201ENST00000316412 ADGRL4Q9HBW9 690 aa15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF20-201ENST00000316412 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF20-201ENST00000316412 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF20-201ENST00000316412 MT-ND2P03891 347 aa15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF20-201ENST00000316412 FCGR2AP12318 317 aa15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF20-201ENST00000316412 ATP6V1B1P15313 513 aa15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF20-201ENST00000316412 CRABP1P29762 137 aa15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF20-201ENST00000316412 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF20-201ENST00000316412 TUBA4AP68366 448 aa15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF20-201ENST00000316412 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF20-201ENST00000316412 PHYHD1Q5SRE7 291 aa15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF20-201ENST00000316412 LRFN4Q6PJG9 635 aa15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF20-201ENST00000316412 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF20-201ENST00000316412 LYPD4Q6UWN0 246 aa15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF20-201ENST00000316412 SHFQ7M4L6 423 aa15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF20-201ENST00000316412 AAED1Q7RTV5 226 aa15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF20-201ENST00000316412 TUSC5Q8IXB3 177 aa15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF20-201ENST00000316412 STX19Q8N4C7 294 aa15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF20-201ENST00000316412 PROKR2Q8NFJ6 384 aa15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF20-201ENST00000316412 OR4F15Q8NGB8 312 aa15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF20-201ENST00000316412 OR51G2Q8NGK0 314 aa15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF20-201ENST00000316412 TMEM80Q96HE8 168 aa15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF20-201ENST00000316412 RBP7Q96R05 134 aa15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF20-201ENST00000316412 GP6Q9HCN6 339 aa15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF20-201ENST00000316412 SCOCQ9UIL1 159 aa15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF20-201ENST00000316412 CLEC4AQ9UMR7 237 aa15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF20-201ENST00000316412 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF20-201ENST00000316412 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF20-201ENST00000316412 IRGMA1A4Y4 181 aa15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF20-201ENST00000316412 YES1P07947 543 aa15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF20-201ENST00000316412 SBK2P0C263 348 aa15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF20-201ENST00000316412 IRF3Q14653 427 aa15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF20-201ENST00000316412 LCN1P1Q5VSP4 162 aa15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF20-201ENST00000316412 C20orf196Q8IYI0 205 aa15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF20-201ENST00000316412 ZNF511Q8NB15 262 aa15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF20-201ENST00000316412 OR6K6Q8NGW6 343 aa15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF20-201ENST00000316412 FNDC8Q8TC99 324 aa15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF20-201ENST00000316412 WNT2BQ93097 391 aa15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF20-201ENST00000316412 MCHR2Q969V1 340 aa15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF20-201ENST00000316412 RERGLQ9H628 205 aa15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF20-201ENST00000316412 MARCH7Q9H992 704 aa15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF20-201ENST00000316412 CALHM2Q9HA72 323 aa15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF20-201ENST00000316412 GLTPQ9NZD2 209 aa15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 73.6 ms