RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296642.4

PGGT1B-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 552 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-201ENST00000296642 UPRTQ96BW1 309 aa6.65□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 TUBGCP3Q96CW5 907 aa6.65□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 RHOXF2Q9BQY4 288 aa6.65□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC35A5Q9BS91 424 aa6.65□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 C1orf50Q9BV19 199 aa6.65□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 C12orf10Q9HB07 376 aa6.65□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 MMP26Q9NRE1 261 aa6.65□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 C1RLQ9NZP8 487 aa6.65□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 P2RX2Q9UBL9 471 aa6.65□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 IFT52Q9Y366 437 aa6.65□□□□□ -1.34
PGGT1B-201ENST00000296642 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa6.64□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 TRAV40A0A0B4J280 105 aa6.64□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 CDHR4A6H8M9 788 aa6.64□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 FTCDNL1E5RQL4 147 aa6.64□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 H3BSA7 217 aa6.64□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 M0R082 166 aa6.64□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 NPHS1O60500 1241 aa6.64□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 PLIN3O60664 434 aa6.64□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 UBOX5O94941 541 aa6.64□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 OR6A2O95222 327 aa6.64□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 KRT75O95678 551 aa6.64□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 PLATP00750 562 aa6.64□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 IGHV1-46P01743 117 aa6.64□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 PROCP04070 461 aa6.64□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 GKN3PP0CG01 181 aa6.64□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 MAKP20794 623 aa6.64□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 CASQ1P31415 396 aa6.64□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 SERPINB5P36952 375 aa6.64□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 MDH2P40926 338 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 ARHGDIAP52565 204 aa6.64□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 CRISP3P54108 245 aa6.64□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 BTG1P62324 171 aa6.64□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 GNB2P62879 340 aa6.64□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC7A5Q01650 507 aa6.64□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 CHI3L2Q15782 390 aa6.64□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 SMU1Q2TAY7 513 aa6.64□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 NRN1LQ496H8 165 aa6.64□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 RNF220Q5VTB9 566 aa6.64□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 C6orf89Q6UWU4 347 aa6.64□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 Q6ZTK2 550 aa6.64□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 RHOUQ7L0Q8 258 aa6.64□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 OLIG3Q7RTU3 272 aa6.64□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC16A14Q7RTX9 510 aa6.64□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 HMGN2P46Q86SG4 172 aa6.64□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 RIMKLAQ8IXN7 391 aa6.64□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 LRRC34Q8IZ02 419 aa6.64□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM123Q8N131 208 aa6.64□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 CLEC4FQ8N1N0 589 aa6.64□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC22A24Q8N4F4 322 aa6.64□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 DTX3Q8N9I9 347 aa6.64□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 OR10S1Q8NGN2 331 aa6.64□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 OR6S1Q8NH40 331 aa6.64□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 OR52P1PQ8NH57 321 aa6.64□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF417Q8TAU3 575 aa6.64□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 IFT81Q8WYA0 676 aa6.64□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC35B4Q969S0 331 aa6.64□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 ZG16BQ96DA0 208 aa6.64□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF75AQ96N20 296 aa6.64□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 ZIM3Q96PE6 472 aa6.64□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC38A1Q9H2H9 487 aa6.64□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 OR51B6Q9H340 312 aa6.64□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 DPAGT1Q9H3H5 408 aa6.64□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 TUBB1Q9H4B7 451 aa6.64□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 PRDM13Q9H4Q3 707 aa6.64□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 NPHS2Q9NP85 383 aa6.64□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 TNFRSF19Q9NS68 423 aa6.64□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 MIOXQ9UGB7 285 aa6.64□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 EGFL7Q9UHF1 273 aa6.64□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 WNK1Q9H4A3 2382 aa6.64□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa6.63□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 TRAPPC2LH3BP13 241 aa6.63□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 HMGN4O00479 90 aa6.63□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 TM9SF1O15321 606 aa6.63□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 XPNPEP2O43895 674 aa6.63□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 MFN2O95140 757 aa6.63□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 IGHV2-70P01814 119 aa6.63□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 CD55P08174 381 aa6.63□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 ADH4P08319 380 aa6.63□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa6.63□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 RPS2P15880 293 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 CCNOP22674 350 aa6.63□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 AHCYP23526 432 aa6.63□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 GRPRP30550 384 aa6.63□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 GSK3AP49840 483 aa6.63□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF84P51523 738 aa6.63□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 NCALDP61601 193 aa6.63□□□□□ -1.35
PGGT1B-201ENST00000296642 EMX2Q04743 252 aa6.63□□□□□ -1.35
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