RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296098.4

TRIM54-201, Transcript of tripartite motif containing 54, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRIM54, Length 2,027 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54-201ENST00000296098 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
TRIM54-201ENST00000296098 IZUMO1Q8IYV9 350 aa21.58■■□□□ 1.05
TRIM54-201ENST00000296098 TCTE3Q8IZS6 198 aa21.58■■□□□ 1.05
TRIM54-201ENST00000296098 PRSS35Q8N3Z0 413 aa21.58■■□□□ 1.05
TRIM54-201ENST00000296098 SMIM4Q8WVI0 70 aa21.58■■□□□ 1.05
TRIM54-201ENST00000296098 NAT6Q93015 286 aa21.58■■□□□ 1.05
TRIM54-201ENST00000296098 PMEPA1Q969W9 287 aa21.58■■□□□ 1.05
TRIM54-201ENST00000296098 SLC25A38Q96DW6 304 aa21.58■■□□□ 1.05
TRIM54-201ENST00000296098 C4orf45Q96LM5 186 aa21.58■■□□□ 1.05
TRIM54-201ENST00000296098 DPAGT1Q9H3H5 408 aa21.58■■□□□ 1.05
TRIM54-201ENST00000296098 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa21.58■■□□□ 1.04
TRIM54-201ENST00000296098 TMEM200CA6NKL6 621 aa21.58■■□□□ 1.04
TRIM54-201ENST00000296098 ONECUT2O95948 504 aa21.58■■□□□ 1.04
TRIM54-201ENST00000296098 ADRB1P08588 477 aa21.58■■□□□ 1.04
TRIM54-201ENST00000296098 CTLA4P16410 223 aa21.58■■□□□ 1.04
TRIM54-201ENST00000296098 RAB25P57735 213 aa21.58■■□□□ 1.04
TRIM54-201ENST00000296098 MAMSTRQ6ZN01 415 aa21.58■■□□□ 1.04
TRIM54-201ENST00000296098 SLC35D2Q76EJ3 337 aa21.58■■□□□ 1.04
TRIM54-201ENST00000296098 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.04
TRIM54-201ENST00000296098 PPP1R3BQ86XI6 285 aa21.58■■□□□ 1.04
TRIM54-201ENST00000296098 SIAH3Q8IW03 269 aa21.58■■□□□ 1.04
TRIM54-201ENST00000296098 OR5L2Q8NGL0 311 aa21.58■■□□□ 1.04
TRIM54-201ENST00000296098 OR8K3Q8NH51 312 aa21.58■■□□□ 1.04
TRIM54-201ENST00000296098 GPR148Q8TDV2 347 aa21.58■■□□□ 1.04
TRIM54-201ENST00000296098 RNF170Q96K19 258 aa21.58■■□□□ 1.04
TRIM54-201ENST00000296098 DCBLD2Q96PD2 775 aa21.58■■□□□ 1.04
TRIM54-201ENST00000296098 NPAS1Q99742 590 aa21.58■■□□□ 1.04
TRIM54-201ENST00000296098 CRB3Q9BUF7 120 aa21.58■■□□□ 1.04
TRIM54-201ENST00000296098 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.04
TRIM54-201ENST00000296098 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa21.58■■□□□ 1.04
TRIM54-201ENST00000296098 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa21.57■■□□□ 1.04
TRIM54-201ENST00000296098 SPARCP09486 303 aa21.57■■□□□ 1.04
TRIM54-201ENST00000296098 NAGAP17050 411 aa21.57■■□□□ 1.04
TRIM54-201ENST00000296098 IL11P20809 199 aa21.57■■□□□ 1.04
TRIM54-201ENST00000296098 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
TRIM54-201ENST00000296098 KIR3DL2P43630 455 aa21.57■■□□□ 1.04
TRIM54-201ENST00000296098 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
TRIM54-201ENST00000296098 PUDPQ08623 228 aa21.57■■□□□ 1.04
TRIM54-201ENST00000296098 MEP1BQ16820 701 aa21.57■■□□□ 1.04
TRIM54-201ENST00000296098 OTPQ5XKR4 325 aa21.57■■□□□ 1.04
TRIM54-201ENST00000296098 SLC18B1Q6NT16 456 aa21.57■■□□□ 1.04
TRIM54-201ENST00000296098 LRRN1Q6UXK5 716 aa21.57■■□□□ 1.04
TRIM54-201ENST00000296098 Q7L0L9 218 aa21.57■■□□□ 1.04
TRIM54-201ENST00000296098 NOXA1Q86UR1 476 aa21.57■■□□□ 1.04
TRIM54-201ENST00000296098 NXPE2Q96DL1 559 aa21.57■■□□□ 1.04
TRIM54-201ENST00000296098 SPSB2Q99619 263 aa21.57■■□□□ 1.04
TRIM54-201ENST00000296098 MED11Q9P086 117 aa21.57■■□□□ 1.04
TRIM54-201ENST00000296098 RGS13O14921 159 aa21.56■■□□□ 1.04
TRIM54-201ENST00000296098 RAF1P04049 648 aa21.56■■□□□ 1.04
TRIM54-201ENST00000296098 CALCBP10092 127 aa21.56■■□□□ 1.04
TRIM54-201ENST00000296098 CLDN12P56749 244 aa21.56■■□□□ 1.04
TRIM54-201ENST00000296098 SLC17A1Q14916 467 aa21.56■■□□□ 1.04
TRIM54-201ENST00000296098 MFSD13AQ14CX5 517 aa21.56■■□□□ 1.04
TRIM54-201ENST00000296098 TIGD3Q6B0B8 471 aa21.56■■□□□ 1.04
TRIM54-201ENST00000296098 FDX2Q6P4F2 183 aa21.56■■□□□ 1.04
TRIM54-201ENST00000296098 LRRTM1Q86UE6 522 aa21.56■■□□□ 1.04
TRIM54-201ENST00000296098 WDR5BQ86VZ2 330 aa21.56■■□□□ 1.04
TRIM54-201ENST00000296098 EID2Q8N6I1 236 aa21.56■■□□□ 1.04
TRIM54-201ENST00000296098 ZNF248Q8NDW4 579 aa21.56■■□□□ 1.04
TRIM54-201ENST00000296098 RNF138Q8WVD3 245 aa21.56■■□□□ 1.04
TRIM54-201ENST00000296098 TTC9Q92623 222 aa21.56■■□□□ 1.04
TRIM54-201ENST00000296098 PIGKQ92643 395 aa21.56■■□□□ 1.04
TRIM54-201ENST00000296098 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP21.56■■□□□ 1.04
TRIM54-201ENST00000296098 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
TRIM54-201ENST00000296098 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
TRIM54-201ENST00000296098 ELOVL3Q9HB03 270 aa21.56■■□□□ 1.04
TRIM54-201ENST00000296098 KLRF1Q9NZS2 232 aa21.56■■□□□ 1.04
TRIM54-201ENST00000296098 VDAC3Q9Y277 283 aa21.56■■□□□ 1.04
TRIM54-201ENST00000296098 YES1P07947 543 aa21.56■■□□□ 1.04
TRIM54-201ENST00000296098 ADRA2CP18825 462 aa21.56■■□□□ 1.04
TRIM54-201ENST00000296098 CRABP1P29762 137 aa21.56■■□□□ 1.04
TRIM54-201ENST00000296098 DLX5P56178 289 aa21.56■■□□□ 1.04
TRIM54-201ENST00000296098 ADAM8P78325 824 aa21.56■■□□□ 1.04
TRIM54-201ENST00000296098 FOXF1Q12946 379 aa21.56■■□□□ 1.04
TRIM54-201ENST00000296098 WDR38Q5JTN6 314 aa21.56■■□□□ 1.04
TRIM54-201ENST00000296098 ARSKQ6UWY0 536 aa21.56■■□□□ 1.04
TRIM54-201ENST00000296098 FCRLAQ7L513 359 aa21.56■■□□□ 1.04
TRIM54-201ENST00000296098 LINGO2Q7L985 606 aa21.56■■□□□ 1.04
TRIM54-201ENST00000296098 ZNF679Q8IYX0 411 aa21.56■■□□□ 1.04
TRIM54-201ENST00000296098 OR10AC1Q8NH08 325 aa21.56■■□□□ 1.04
TRIM54-201ENST00000296098 MFSD8Q8NHS3 518 aa21.56■■□□□ 1.04
TRIM54-201ENST00000296098 AUNIPQ9H7T9 357 aa21.56■■□□□ 1.04
TRIM54-201ENST00000296098 APMAPQ9HDC9 416 aa21.56■■□□□ 1.04
TRIM54-201ENST00000296098 MCUBQ9NWR8 336 aa21.56■■□□□ 1.04
TRIM54-201ENST00000296098 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
TRIM54-201ENST00000296098 PI4KAP42356 2102 aa21.56■■□□□ 1.04
TRIM54-201ENST00000296098 FAM172BPA6NC97 362 aa21.55■■□□□ 1.04
TRIM54-201ENST00000296098 A6NIZ1 184 aa21.55■■□□□ 1.04
TRIM54-201ENST00000296098 GSTT2P0CG29 244 aa21.55■■□□□ 1.04
TRIM54-201ENST00000296098 GSTT2BP0CG30 244 aa21.55■■□□□ 1.04
TRIM54-201ENST00000296098 HLA-DOBP13765 273 aa21.55■■□□□ 1.04
TRIM54-201ENST00000296098 RAP1BP61224 184 aa21.55■■□□□ 1.04
TRIM54-201ENST00000296098 RAP1AP62834 184 aa21.55■■□□□ 1.04
TRIM54-201ENST00000296098 OR7A5Q15622 319 aa21.55■■□□□ 1.04
TRIM54-201ENST00000296098 ETFDHQ16134 617 aa21.55■■□□□ 1.04
TRIM54-201ENST00000296098 BCL2A1Q16548 175 aa21.55■■□□□ 1.04
TRIM54-201ENST00000296098 PRSS45Q7RTY3 260 aa21.55■■□□□ 1.04
TRIM54-201ENST00000296098 TMEM106AQ96A25 262 aa21.55■■□□□ 1.04
TRIM54-201ENST00000296098 C8orf44Q96CB5 159 aa21.55■■□□□ 1.04
TRIM54-201ENST00000296098 ARL5BQ96KC2 179 aa21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.7 ms