RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 F2RL1P55085 397 aa19.44■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF266Q14584 549 aa19.44■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP19.44■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 BRICD5Q6PL45 260 aa19.44■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF620Q6ZNG0 422 aa19.44■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP19.44■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP19.44■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 CMC2Q9NRP2 79 aa19.44■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 TXNL1O43396 289 aa19.44■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 MAP2K6P52564 334 aa19.44■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP19.44■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 DCAF12Q5T6F0 453 aa19.44■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 PFN4Q8NHR9 129 aa19.44■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa19.44■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP19.44■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 NWD2Q9ULI1 1742 aa19.44■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 TCRBV5S2A0A599 114 aa19.44■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 OR5K3A6NET4 321 aa19.44■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa19.44■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP19.44■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 GJC3Q8NFK1 279 aa19.44■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 FAM213BQ8TBF2 198 aa19.44■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP19.44■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 NUDT8Q8WV74 236 aa19.44■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa19.44■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 BOLA1Q9Y3E2 137 aa19.44■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 C1QBP02746 253 aa19.43■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 ACHEP22303 614 aa19.43■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 ENPP1P22413 925 aa19.43■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 RPL27P61353 136 aaKnown RBP19.43■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 PLPP7Q8NBV4 271 aa19.43■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 OR6C1Q96RD1 312 aa19.43■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP19.43■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 C19orf43Q9BQ61 176 aa19.43■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP19.43■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 GPATCH2Q9NW75 528 aa19.43■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 QPCTLQ9NXS2 382 aa19.43■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 SLC30A7Q8NEW0 376 aa19.43■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP19.43■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 MUCL1Q96DR8 90 aa19.43■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 BTF3L4Q96K17 158 aa19.43■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 ABHD6Q9BV23 337 aa19.43■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 SAMD10Q9BYL1 202 aa19.43■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 SCPEP1Q9HB40 452 aa19.43■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 ABHD16AO95870 558 aa19.43■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 OMGP23515 440 aa19.43■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 IL32P24001 234 aa19.43■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP19.43■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa19.43■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 DCXRQ7Z4W1 244 aa19.43■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP19.43■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP19.43■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 A0A1W2PR48 441 aa19.43■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 NSA2O95478 260 aaKnown RBP19.43■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 NME2P22392 152 aa19.43■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 MRPL19P49406 292 aaKnown RBP19.43■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP19.43■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF77Q15935 545 aa19.43■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP19.43■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 PRSS35Q8N3Z0 413 aa19.43■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 SCARB1Q8WTV0 552 aa19.43■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 HSD17B8Q92506 261 aa19.43■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP19.43■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 SEC22CQ9BRL7 303 aa19.43■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 FGF22Q9HCT0 170 aa19.43■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 GHRLQ9UBU3 117 aa19.43■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 PRAMEF4O60810 478 aa19.42■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 SOHLH1Q5JUK2 328 aa19.42■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 MARCH3Q86UD3 253 aa19.42■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 NXPE3Q969Y0 559 aa19.42■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 TUBG2Q9NRH3 451 aa19.42■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 PTGER4P35408 488 aa19.42■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP19.42■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 PMPCAQ10713 525 aa19.42■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 LIPNQ5VXI9 398 aa19.42■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa19.42■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP19.42■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 ARRDC5A6NEK1 342 aa19.42■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 GPX5O75715 221 aa19.42■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 B3GALT4O96024 378 aa19.42■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 BCKDHBP21953 392 aa19.42■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 CARD18P57730 90 aa19.42■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 OR4N2Q8NGD1 307 aa19.42■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 OR1E3Q8WZA6 343 aa19.42■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 UHRF2Q96PU4 802 aa19.42■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 OR52A5Q9H2C5 316 aa19.42■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 SLC23A2Q9UGH3 650 aa19.42■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF814B7Z6K7 855 aa19.42■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 GABRA2P47869 451 aa19.42■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM31Q5JXX7 168 aa19.42■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa19.42■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 RIMKLAQ8IXN7 391 aa19.42■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 OR13H1Q8NG92 308 aa19.42■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP19.42■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 BCL2L10Q9HD36 194 aa19.42■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP19.42■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP19.41■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 ACSM5Q6NUN0 579 aa19.41■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 SLC35A4Q96G79 324 aa19.41■□□□□ 0.7
CCSAP-201ENST00000284617 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP19.41■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38 ms